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1、伯杰氏系统细菌学手册第二版的分类?从 1984 年第一版开始发行以来，细菌分类已取得了巨大进展，新命名的种成倍增加、新描述的属也在170 个以上， 尤其是80年代末以来，rRNA、DNA、蛋白质序列分析方法日趋实用，因而为细菌的系统发育积累了不少新的资料。 因此已经有可能对其第一版进行新的修订。第二版预计分5 卷出版，从已报导的资料看，它更多地依靠系统发育资料 对细菌分类群的总体安排进行了较大的调整。第二版将原核生物分为30组， 5卷大致的内容安排如下：？第一卷：114组。包括古生菌、蓝细菌、光合细菌和最早分支的属？第二卷：1519组。包括变形杆菌(属革兰氏阴性真细菌类)？第三卷：2022组。
2、包括低G+C含量的革兰氏阳性细菌？第四卷：23组。包括高G+C含量的革兰氏阳性细菌(放线菌类)？第五卷： 2430组。包括浮霉状菌、螺旋体、丝杆菌、拟杆菌和梭杆菌(属革兰氏阴性细菌类)？有关系统手册第二版的分类大纲见下表第三卷 2009 年出版第二卷2005年出版 分为Parter A B C第四卷 2010年出版表 伯杰氏系统细菌学手册第二版分类纲要 分 类 群 代 表 属一、古生菌、蓝细菌、光合细菌和最早分支的属古生菌嗜泉古生菌界 (Crenarchaeota)1组 热变形菌、硫化叶菌和嗜压菌 热变形菌属(Thermoproteus)、硫化叶菌 属(Sulfolobus)广古生菌界 (Eu
3、ryarchaeota)2组产甲烷菌甲烷杆菌属(Methanobacterium)3组盐杆菌盐杆菌属(Halobacterium)、盐球菌属(Halococcus)4组 热原体 热原体属(Thermoplasma)等5组热球菌古生球菌属(Archaeoglobus)、热球菌属(Thermococcus)最早分支的属细菌(真细菌)6组 产液菌和有关的细菌 产液菌属(Aquifex)、氢杆菌属(Hydrogenobacter)7组热袍菌和地袍菌热袍菌属(Thermotoga)、地袍菌属(Geotoga)、热脱硫杆菌属(Thermodesulfobacterium)8组异常球菌异常球菌属(Deino
4、coccus)9组栖热菌栖热菌属(Thermus)、磁杆菌属(Magnetobacterium)10组产金色菌产金色菌属(Chrisiogenes)11组绿屈挠菌和滑柱菌绿屈挠菌属(Chloroflexus)、滑柱菌属(Herpetosiphon)12组热微菌热微菌属(Thermomicrobium)13组 原绿蓝细菌和蓝细菌 原绿蓝细菌属(Prochloron)、聚球蓝细菌属(Synechococcus)、颤蓝细菌属(Oscillatoria)、鱼 腥蓝细菌属(Anabaena)、念珠蓝细菌属(Nostoc)、真枝蓝细菌属(Stigonema)等14组绿菌绿菌属(Chlorobium)、暗网
5、菌属(Pelodictyon)二、变形杆菌细菌变形杆菌界 (Proteobacteria)15组a?变形杆菌红螺菌属(Rhodospirillum)、立克次氏体属(Rickettsia)、柄杆菌属(Caulobacter)、根瘤菌属(Rhizobiu m)、布鲁氏菌属(Brucella)、硝化杆菌属(Nitrobacter)、甲基杆菌属(Methylobacteriun)等16组卩?变形杆菌 奈瑟氏菌属(Neisseria)、产碱杆菌 属(Alcaligenes)、亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)、嗜甲基菌属 (Methylophilus)、硫杆菌属(Thiobacillus)、伯克
6、霍尔德氏菌属(Burkholderia)等17组Y?变形杆菌 着色菌属(Chromatium)、亮发菌属(Leucothrix)、军团菌属(Legionella)、假单胞菌属(Pseudomonas)、固氮菌属(Azotobacter )、弧菌属(Vibrio)、埃希氏菌属(Escherichia)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、变形杆 菌属(Proteus)、沙门氏菌属(Salmonella)、志贺氏菌属(Shigella)、伊尔森氏菌属(Yersinia)、嗜血杆菌属(Haemophilus)18组6?变形杆菌脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、蛭弧菌属(Bodellovib
7、iro)、粘球菌属(Myxococcus)、多囊菌属 (Polyangium)19组?变形杆菌弯曲杆菌属(Campylobacter)、螺杆菌属(Helicobacter)三、低 G+C 含量的革兰氏阳性细菌20组梭菌和有关的细菌梭菌属(Clostridium)、消化链球菌属(Peptostreptococcus)、真杆菌属(Eubacterium)、脱硫肠 状菌属(Desulfotomaculum )、韦荣氏菌属(Veillonella )等21组柔膜菌枝原体属(Mycoplasma)、尿原体属(Ureaplasma)、螺原体属(Spiroplasma)、无胆甾原体属(Acholeplasm
8、a) 22组 芽抱杆菌和乳杆菌 芽抱杆菌属(Bacillus)、显核菌属(Caryophanon)、类芽抱杆菌属(Paenibacillus)、高温放线菌 属(Thermoactinomyces)、乳杆菌属(Lactobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、肠球菌属(Enterococcus)、葡萄球菌属 (Staphylococcus) 利斯特氏菌属(Listeria)四、高 G+C 含量的革兰氏阳性细菌23组放线杆菌纲(Actinobacteria)放线菌属(Actinomyces)、微球菌属(Micrococcus)、节杆菌属(Arthrobacter)、棒杆菌属 (
9、C orynebacterium)、分枝杆菌属(Mycobacterium)、诺卡氏菌属(Nocardia)、游动放线菌属(A ctinoplanes)、丙酸杆菌属 (Propionibacteriu m)链霉菌属(Streptomyces)、高温单抱菌属(Thermomonospora)、弗兰克氏菌属(Frankia)、马杜拉放线 菌属(Actinomadure)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)五、浮霉状菌、螺旋体、丝杆菌、拟杆菌和梭杆菌24组 浮霉状菌、衣原体和有关的细菌 浮霉状菌属(Planctomyces)、衣原体属(Chlamydia)25组 螺旋体 螺旋体属(Spir
10、ochaeta)、疏螺旋体属(Borrelia)、密螺旋体属(Treponema)、小蛇菌属(Serpulina)、钩端螺 旋体属(Leptospira)26组 丝状杆菌 丝状杆菌属(Fibrobacter)27组拟杆菌拟杆菌属(Bacteriodes)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、普雷沃氏菌属(Prevotella)28组 黄杆菌 黄杆菌属(Flavobacterium)29组鞘氨醇杆菌、屈挠杆菌和噬纤维菌鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium)、屈挠杆菌属(Flexibacter)、噬纤维菌属 (Cytophaga)30组 梭杆菌 梭杆菌属(Fusobacterium)第二版更多地采用核酸序列资料对分类群进行新的调整，无疑这是细菌系统发育分类的重大进展，但另一方面，我 们也应看到：在某些类群中，由于序列特征与某些重要的表型特征相矛盾，这将给主要按表型特征进行细菌鉴定带来 新的困难，如何解决这些问题，有待进一步研究。
