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TBT协议早于SPS协议，SPS协议吸收了TBT协议的文本结构。TBT协定与SPS协定均支持各成员实施保护人类、动物、植物的生命或健康所采取的必须措施。TBT协定明确规定了技术法规的制定和实施的根本原则是“不得对国际贸易造成不必要的障碍”，SPS协定则要求“在风险分析的基础上制定必要的保护人类、动植物的措施，以便使其对贸易的影响降到最低，促进动植物及其产品国际贸易的发展”。两个协定都规定了非歧视的基本义务、提前通报拟议措施的类似规定，以及设立咨询点。两者的根本区别在于各自的管辖范围不一样，SPS协定涉及食品安全、动物卫生和植物卫生三个领域，而TBT协定涉及范围更广，除去与上述领域有关的SPS措施外，所有产品的技术法规和标准都受TBT协定管辖。由于SPS协定的存在，TBT协定未涉及SPS措施问题。例如一项对进口水果进行处理以防止害虫传播的措施会与SPS协定相关，而处理进口水果质量、等级和标签特性的措施则在TBT协定管辖之下。再如进口瓶装水的制瓶材料应该对人无害，且所装水应保证不污染等规定属于SPS协议管辖；而瓶子标准体积大小及形状是否符合超市货架摆放和展示属于TBT协议管辖。此外， TBT协定所指的国际标准是指ISO和IEC 制定的标准。SPS协定所指国际标准指CAC（食品法规委员会）、IPPC（国际植物保护公约组织）和 OIE（世界动物卫生组织）制定的标准。
