《氨基酸的计算》由会员分享，可在线阅读，更多相关《氨基酸的计算（15页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、 有关蛋白质计算的几种类型1.已知氨基酸、肽链数目，求肽键数、失水数和氨基、羧基数目。2.已知氨基酸种类，求形成多肽的种类已知蛋白质（多肽）的分子式，求形成该蛋白质的某种AA的数目。. 4.与基因控制蛋白质合成有关的蛋白质计算。 5与化学有关的计算（利用反应前后平均相对分子质量守恒进行计算）。1条肽链n条肽链氨基酸平均相对分子质量aA氨基酸数目mm肽键数目m-1m-n脱去水分子数m-1m-n多肽相对分子质量ma-（m-1）*18ma-（m-n）*18氨基数目至少1个至少n个羧基数目至少1个至少n个1.已知氨基酸、肽链数目，求肽键数、失水数和氨基、羧基数目例如：人的血红蛋白是由574个氨基酸构成
2、，共计形成4条多肽链，则形成的血红蛋白共失去水分子_个。直链多肽：肽键数=失水数=消耗的氨基、羧基数=AA数-肽链数环状多肽：肽键数=失水数=消耗的氨基、羧基数=AA数直链多肽：游离的氨基（羧基）数=AA反应前氨基（羧基）数-消耗的氨基（羧基）数环状多肽：游离的氨基（羧基）数=AA反应前氨基（羧基）数-AA数2.已知氨基酸种类，求形成多肽的种类例：现有A、B、C、D、E5种AA，让它们足量混合能够形成五肽多少种？包含这5种AA的五肽有多少种？可以重复时55555不能重复时543213.已知蛋白质（多肽）的分子式，求形成该蛋白质的某种AA的数目例2。现有一种“十二肽”，分子式为CxHyNzOd（
3、z12，d13）。已知将它彻底的水解后只得到下列AA：问：将一个“十二肽”彻底水解后，可生成_个赖氨酸和_个天门冬氨酸。5.与化学有关的计算（利用反应前后平均相对分子质量守恒进行计算）1.氨基酸的排列与组合计算：蛋白质分子的多样性除了氨基酸的种类、数量外，更多的是因为氨基酸排列次序的多样性。这涉及数学中的排列组合：由甲、乙、丙三种氨基酸组成的三肽的种类为3！，即321=6种，这是数学中的排列；在某反应容器中给足量的甲、乙、丙三种氨基酸，则该容器内可能生成的三肽种类为333=27，这就要用到数学中的排列与组合了。2.蛋白质相对分子质量的计算：主要涉及蛋白质平均分子量的计算、多肽链合成过程中脱水数
4、目及形成肽键数目的计算、蛋白质水解所需水分子的数目计算、蛋白质中氨基和羧基数目的计算、氨基酸的排列顺序等。在蛋白质的脱水缩合形成过程中：脱去的水分子数形成的肽键数氨基酸总数肽链数蛋白质1条肽链m个氨基酸组成的蛋白质n条肽链m个氨基酸组成的蛋白质脱水分子数=水解所需水分子数m1mn具有的肽键数目m1mn具有R基数目mm至少具有的游离氨基数目1n至少具有的游离羧基数目1n相对分子质量（设氨基酸平均相对分子质量为p）m p18（m1）18是水的分子质量m p18（mn）-（2n2）1(两条肽链的二硫键失去H的，一般不考虑）3.蛋白质分子中游离氨基、羧基数量的计算：每个氨基酸至少含有一个氨基和一个羧基
5、，在缩合反应中，前一个氨基酸的羧基与后一个氨基酸的氨基形成肽键，因此一条肽链中至少有一个氨基（肽链前端）和一个羧基（肽链末端），且R基中的氨基或羧基不参与反应，因此，蛋白质分子中游离的氨基或羧基数就等于肽链数加R基中的氨基或羧基数。如有1000个氨基酸，其中氨基1050，羧基1020，则由这1000个氨基酸形成的由4条肽链组成的蛋白质分子中游离的氨基数为：4+50=54；游离的羧基数为：4+20=24。4.氨基酸中各原子数量的计算 氨基酸的结构通式为：（如图）， 因此，只要知道R基中的各种原子数，就可以求出氨基酸分子中各原子的数量。如某氨基酸的R基为C5H7O4N，则该氨基酸中的C原子数=2+
6、5=7；H原子数=4+7=11；O原子数=2+4=6；N原子数=1+1=2。高二生物生命的基础有关计算专题复习（一）.有关氨基酸、蛋白质的相关计算1.一个氨基酸中的各原子的数目计算：C原子数R基团中的C原子数2，H原子数R基团中的H原子数4，O原子数R基团中的O原子数2，N原子数R基团中的N原子数12.肽链中氨基酸数目、肽键数目和肽链数目之间的关系：若有n个氨基酸分子缩合成m条肽链，则可形成(n-m)个肽键，脱去(n-m)个水分子，至少有NH2和COOH各m个。游离氨基或羧基数肽链条数R基中含有的氨基或羧基数。例（2005上海生物30）某22肽被水解成1个4肽，2个3肽，2个6肽，则这些短肽的
7、氨基总数的最小值及肽键总数依次是（C）A、6 18 B、5 18 C、5 17D、6 17解析：每条短肽至少有一个氨基（不包括R基上的氨基），共有5个短肽，所以这些短肽氨基总数的最小值是5个；肽链的肽键数为n1,所以肽键数为（41）2（31）2（61）=17。例（2003上海）人体免疫球蛋白中，IgG由4条肽链构成，共有764个氨基酸，则该蛋白质分子中至少含有游离的氨基和羧基数分别是（ D） A746和764 B760和760 C762和762 D4和43.氨基酸的平均分子量与蛋白质的分子量之间的关系：n个氨基酸形成m条肽链，每个氨基酸的平均分子量为a，那么由此形成的蛋白质的分子量为：na-(
8、n-m)18 (其中n-m为失去的水分子数，18为水的分子量)；该蛋白质的分子量比组成其氨基酸的分子量之和减少了（n-m）18。（有时也要考虑因其他化学建的形成而导致相对分子质量的减少，如形成二硫键。例（2003上海）某蛋白质由n条肽链组成，氨基酸的平均分子量为a，控制该蛋白质合成的基因含b个碱基对，则该蛋白质的分子量约为（ D） A B C D 4.在R基上无N元素存在的情况下，N原子的数目与氨基酸的数目相等。5.蛋白质分子完全水解时所需的水分子数蛋白质形成过程中脱下的水分子数。6.有关多肽种类的计算：假若有n种氨基酸，由这n种氨基酸组成多肽的情况，可分如下两种情形分析。（1）每种氨基酸数目
9、无限的情况下，可形成m肽的种类为nm种；（2）每种氨基酸数目只有一种的情况下，可形成m肽的种类为n（n1）（n2）1种m例 称取某多肽415g，在小肠液的作用下完全水解得到氨基酸505g。经分析知道组成此多肽的氨基酸平均相对分子质量为100，此多肽由甘氨酸、丙氨酸、半胱氨酸3种氨基酸组成，每摩尔此多肽含有S元素51mol。3种氨基酸的分子结构式如下： （1）小肠液为多肽的水解提供的物质是_。 （2）组成一分子的此多肽需氨基酸个数为_。 （3）此多肽分子中3种氨基酸的数量比为_。 （4）控制此多肽合成的基因片段至少有脱氧核苷酸个数为_。 解析 第（2）小题由题意可知，415g此多肽完全水解需要水
10、505g-415g=90g，即形成415g此种多肽需要脱去90g水。415g此多肽形成时，需要氨基酸505100505（mol），脱水90185(mol)，所以在形成此多肽时需要的氨基酸摩尔数与合成时脱去的水分子摩尔数之比为：5055=1.01。设该肽链上的氨基酸残基数目为n，则该肽链上的氨基酸残基数目与在形成该肽链时脱去的水分子数之比：n（n-1）。得n（n-1）=101，解此方程得n=101。所以此多肽为101肽。第（3）小题由于某摩尔此多肽含有S元素51mol，可知，一分子此多肽需由51分子的半胱氨酸脱水形成。所以，可利用平均分子量计算求解此多肽分子中三种氨基酸的数量比。根据三种氨基酸的
11、结构式可知： 甘氨酸的分子量为75；丙氨酸的分子量为89；半胱氨酸的分子量为121。 设形成此多肽需甘氨酸a个，则有： 75a89（10151a）12151101100解得：a=37 ；101-51-a=13 即，此多肽中三种氨基酸的数量比是： 甘氨酸:丙氨酸:半胱氨酸 = 37:13:51 第(4)小题中由mRNA翻译成蛋白质时，是3个碱基决定一个氨基酸，基因转录成mRNA时是以其中的一条链为模板转录的，而基因中有两条链，所以指导合成多肽的基因中的脱氧核苦酸数为多肽中的氨基酸总数乘6。 答案 （1）肽酶 （2）101肽 （3）甘氨酸：丙氨酸：半胱氨酸=54551 （4）606 例、现有一种“
12、十二肽”，分子式为CXHYNZOW（Z12，W13）。已知将它们彻底水解后得到下列氨基酸： CH2 SH 半胱氨酸：NH2 C COOH 丙氨酸：CH3 CH COOH H NH2 天门冬氨酸：HOOC CH2 CH COOH NH2 赖氨酸：H2N CH2 （CH2）3 CH COOH NH2 苯丙氨酸： CH2 CH COOH NH2 请回答下列问题： （1）该“十二肽”的合成发生在细胞的 中（写细胞器）。 （2）1个该“十二肽”分子水解时需要的水分子数是 个。 （3）合成该多肽时，需要 个遗传密码，与该多肽相应的基因（DNA分子）上至少有 个嘧啶碱基。 （4）将一个该“十二肽”分子彻底水
13、解后有 个赖氨酸和 个天门冬氨酸。 解析：由于在半胱氨酸、丙氨酸、天门冬氨酸、苯丙氨酸中都只含有1分子“N”，而赖氨酸中含有2分子“N”。又知，该十二肽由12个氨基酸组成，如果只含有1个赖氨酸，则可知，该十二肽含有13分子“N”；每增加1个赖氨酸，该十二肽都会增加1分子“N”。即，如果CXHYNZOW（Z12，W13）含有13分子“N”，水解后的赖氨酸分子数为13-12=1；如果CXHYNZOW（Z12，W13）含有14分子“N”，水解后的赖氨酸分子数为14-12=2，依此类推。 所以，将一个该“十二肽”分子彻底水解后有（Z-12）个赖氨酸。 由于在半胱氨酸、丙氨酸、赖氨酸、苯丙氨酸中都只含有1分子“COOH”，而天门冬氨酸中含有2个“COOH”。该十二肽由12个氨基酸脱水缩合形成过程中，有11个氨基酸分别拿出一个“COOH”来进行脱水缩合，而且每个“COOH”都脱掉一分子的“OH”剩下一分子“O”。根据分析可知，如果只含有1个天门冬氨酸，该十二肽含有15（212-11=13，13+2=15）个“O”；每增加1个天门冬氨酸，该十二肽都会增加2个“O”。即，如果CXHYNZOW（Z12，W13）含有15个“O”，水解后的天冬氨酸分子数为 =1；如果CXHYNZOW（Z12，W
