基因工程大题

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1、2基因工程操作的基本步骤是什么? 施工材料的准备,即目的 基因、载体、工具酶和受体细胞(宿主)的准备。用限制性内切 酶分别将外源DNA和载体分子切开。(切)目的基因与载体 DNA的体外重组,形成重组DNA分子。(接) 把重组的DNA 分子引入受体细胞,并建立起无性繁殖系。(转和扩筛选出所 需要的无性繁殖系,并保证外源基因在受体细胞中稳定遗传、正 确表达。(检)3如何理解基因工程的两个特点? 答:基因工程的两个基本特点是分子水平的操作和细胞水平的表 达。分子水平的操作包括DNA分离、切割和连接(还有其他一些 DNA的修饰等)。由于体外重组DNA的最终目的是要改变生物的 遗传性,所以分子水平的操作

2、和细胞水平的表达是基因工程的两 个最基本的特点。4基因克隆是如何使含有单个基因的DNA片段得到纯化的? 答:大分子质量的DNA会含有许多特殊限制性内切核酸酶的限制 位点,因此用一种限制酶处理一完整染色体或整个基因组会产生 许多不同的DNA片段,每一个片段带有基因组的一个不同的基因 或一个不同的小片段。当全部片段与用同种限制酶处理过的载体 分子混合时(如图所示),每个片段将插入一个不同的载体分子(如 一个质粒)。同样地,当用这些质粒转化宿主细胞时,每个宿主细 胞将只接收一个质粒DNA分子,而筛选出的含重组质粒的每个菌 落实际上会含有某一特异的供体DNA片段的多个拷贝。一旦带有 待研究的特定基因的

3、克隆被确认了,此重组DNA分子可从宿主细 胞中提取出来进行纯化。5比较遗传工程、基因工程和生物技术。 答:遗传工程是遗传学和工程学相结合的一门技术科学。借用工 程技术上的设计思想,在离体条件下,对生物细胞、细胞器、染 色体或DNA分子进行按图施工的遗传操作,以求定向地改造生物 的遗传性。遗传工程的概念有广义和狭义之分。狭义的遗传工程 就是指基因工程。基因工程(gene engineering)又称基因操作(gene manipulation)、重组DNA (recombinant DNA)。基因工 程是以分子遗传学理论为基础,以分子生物学和微生物学的现代 方法手段,将不同来源的基因(DNA分子

4、),按预先设计的蓝图, 在体外构建杂种DNA分子,然后导入活细胞,以改变生物原有的 遗传特性,获得新品种,生产新产品,或是研究基因的结构和功 能。生物技术又称生物工艺学,生物工程学。是根据生物学、化 学和工程学的原理进行工业规模的经营和开发微生物、动植物细 胞及其亚细胞组分,进而利用生物体所具有的功能元件(如基因、 蛋白质)等来提供商品或社会服务的一门综合性科学技术。它包括 基因工程、细胞工程、酶工程和发酵工程等。6说明Sanger DNA测序法的原理。答:Sanger DNA测序法建立在两个基本原理之上:核酸是依赖 于模板在聚合酶的作用下由5端向3端聚合;可延伸的引物 必须能提供游离的3羟基

5、末端,双脱氧核苷酸由于缺少游离的3 精品文档羟基末端,因此会终止聚合反应的进行。如果分别用四种双脱氧 核苷酸终止反应,则会获得四组长度不同的DNA片段。通过比较 所有DNA片段的长度可以得知核苷酸的序列。11当两种限制性内切核酸酶的作用条件不同时,若要进行双酶切, 应采取什么措施?为什么?答:注意星号活性;先低盐,后高盐;先低温酶,后高温酶;并 且可以直接在换酶前将第一种酶失活,再加第二种酶,否则,易 产生星号活性,或使用通用缓冲液。12何谓限制性物理图谱?答:限制性物理图谱即限制性内切核酸酶作图(restriction mapping)。简单地说就是DNA分子中限制性内切核酸酶切割位点 的定

6、位,卩DNA分子中各种不同限制性内切核酸酶的酶切位点的 线性排列图。标明限制酶在DNA分子上的限制性位点的数目、限 制性片段大小及其线性排列的顺序。13什么是细菌的限制修饰系统 (Restriction ModificationSystem,R-M system)?答:细菌中有作用于同一DNA的两种酶,即分解DNA的限制酶和 改变DNA碱基结构使其免遭限制酶分解的修饰酶。而且,这两种 酶作用于同一DNA的相同部位,把这两种酶所组成的系统称为限 制与修饰系统。14细菌的限制修饰系统有什么意义?答:不同种的细菌或不同的细菌菌株具有不同的限制酶和修饰酶 组成的限制与修饰系统。修饰的本质是通过甲基化酶

7、将DNA中某 些碱基进行甲基化修饰,由于宿主自身DNA上的这些位点进行了 修饰,限制酶就不能进行切割。而外来的DNA在相应的碱基上没 有被甲基化,宿主的限制酶通过对该位点的识别来分辨敌我,并 将入侵的外来DNA分子降解掉。所以DNA限制作用和修饰作用为 细胞提供了保护。15说明限制性内切核酸酶的命名原则要点。 答:基本原则:属名+种名+株名十序号。 首字母:取属名的第一个字母,且斜体大写。第二个字母:取 种名的第一个字母,斜体小写。第三个字母:取种名的第二个字 母,斜体小写。第四个字母:若有株名,株名则作为第四个字母, 用正体。顺序号:若在同一菌株中分离了几种限制酶,则按先 后顺序冠以I、II

8、、III等,用正体。所有的限制酶,前面还应 带有系统的名称,如限制性核酸内切酶R. Hind III。修饰酶则在 前面加上甲基转移酶M,如甲基转移酶M. Hind III。在上下文已 清楚只涉及限制酶的地方,R可被省去。16何谓限制性内切核酸酶的切割频率?答:切割频率是指限制性内切核酸酶在某DNA分子中预测的切点 数。由于DNA是由四种类型的单核苷酸组成,假定DNA的碱基组 成是均一的,而限制性内切核酸酶的识别位点是随机分布的,那 么对于任何一种限制酶的切割频率,理论上应为l/4n,n表示该精品文档 限制酶识别的碱基数。如识别4 个碱基的限制酶,其切割频率应 为每256 个碱基有一个识别序列和

9、切点(144 = 1256),识 别5 个碱基的限制性内切核酸酶,其切割频率应为每1024 个碱基 有一个识别序列和切点,余类推。18双酶消化法(double digest)绘制限制性内切核酸酶酶谱的原 理是什么?答:双酶消化法是绘制DNA中两个或两个以上限制性内切核酸酶 图谱所采用的方法。做法是在两个限制性内切核酸酶分别单独消 化DNA分子的基础上,再用这两个酶同时或先后消化DNA,根据它 们的结果构建物理图谱。17什么是限制性内切核酸酶的星号活性?受哪些因素的影响?答:II类限制酶虽然识别和切割的序列都具有特异性,但是这种 特异性受特定条件的限制,即在一定环境条件下表现出来的特异 性。条件

10、发生改变,限制酶的特异性就会松动,识别的序列和切 割都有一些改变。改变后的活性通常称第二活性,而将这种因条 件的改变会出现第二活性的酶的右上角加一个星号表示,因此第 二活性又称为星号活性。诱发星号活性的因素有如下几种:高 甘油含量(5%, v/v);限制性内切核酸酶用量过高(100U / gDNA);低离子强度(25mmol/L);高pH(8. 0以上); 含有有机溶剂,如DMS0、乙醇等;有非Mg2+的二价阳离子存在 (如Mn2+、Cu2+、Co2+、Zn2+等)。19什么是DNA 多态性(DNA polymorphism)?答:在正常人群中,各个体DNA分子的某些位点可以发生中性改 变,这

11、些改变虽然会使DNA 级结构产生一定变化,但不影响基 因的表达,如果这种中性突变在人群中的频率不低于1%,这一现 象被称为多态性。DNA多态性本质上是染色体DNA中核苷酸数目 或排列顺序的个体差异,这些差异多数为中性突变,不引起表型 改变。20什么是限制性片段长度多态性 (restriction fragment lengt hpolymorphism,RFLP)?答:当DNA序列的差异发生在限制性内切核酸酶的识别位点时, 或当DNA片段的插入、缺失或重复导致基因组DNA经限制性内切核酸酶酶解后,其片段长度的 改变可以经凝胶电泳区分时,DNA多态性就可应用限制性内切核酸 酶进行分析,这种多态性

12、称为限制性片段长度多态性(RFLP)。22何为回文序列?答:回文序列(palindromic sequence)是一段自我互补的序列, 即同其互补链一样的序列(两者的阅读方向都是从5 3,)。根 据回文序列的结构可分为:完全的回文序列、不完全的回文序列 和间断的回文序列。完全回文序列(如GAATTC),通常是限制性 内切核酸酶的识别序列;不完全的回文序(TACCTCCAT,CGTGATA), 常是其他蛋白质的结合位点(如阻抑蛋白),在基因表达调控中有 重要作用;间断的回文序列(如GGTTXXXAACC,有一段是颠倒的重 复),它可使单链的核苷酸有可能在tRNA中所见到的一样,形成 发夹环的结构

13、。23DNA 连接酶的连接机理是什么?答:DNA连接酶是利用ATP或NAD+烟酰胺腺嘌吟二核苷酸(氧化 型)提供的能量催化DNA双链间的缺口形成磷酸二酯键。在连接 反应中,首先ATP (NAD+)与DNA连接酶反应,同连接酶生成一种 共价结合的酶-AMP复合物。其中AMP(腺苷一磷酸)通过一种磷酸 酰胺键同DNA连接酶的赖氨酸残基的氨基相连。同时释放出焦 磷酸或烟酰胺单核苷酸(NMN)。AMP激活DNA 条链的5 -末端 磷酸基团,并转移到磷酸基团上,形成DNA-腺苷一磷酸复合物。 最后,3 -OH对激活的磷原子作亲核攻击,形成磷酸二酯键,同 时释放出AMP。连接反应是由在形成酶-腺苷酸复合体

14、时,焦磷酸 水解和释放提供的能量驱动下进行的。在以ATP作为能源的连接酶 中,一个磷酸二酯键的形成消耗掉两个高能磷酸键。29列举质粒载体必须具有的基本条件。 答:(1)能独立复制;(2)具有选择标记; (3)有独特的酶切位点;(4)能转化但不扩散。24DNA 连接酶的作用特点有哪些?连接反应需要在一条DNA链的3末端具有一个游离的-0H,而 另一条DNA链的5末端具有一个磷酸基团(-P)的情况下,才能 发挥其连接DNA分子的功能作用,而在末端带有5-羟基和3- 羟基;5-磷酸和3-二脱氧核苷基团的两个DNA片段之间不起 连接作用。连接反应中需要ATP或NAD+和Mg2+为辅助因子 和激活因子;

15、DNA连接酶不能够连接两条单链的DNA分子,被 连接的DNA链必须是双螺旋的一部分。DNA连接酶只封闭双螺 旋DNA骨架上的缺口 (Nick),即在双链DNA的某一条链上两个相 邻核苷酸之间失去一个磷酸二酯键所出现的单链断裂,而不能封 闭双链DNA的某一条链上失去一个或数个核苷酸所形成的裂口25影响DNA连接酶连接反应的因素主要有哪些?答:1)反应温度:最佳反应温度37C,但黏性末端之间退火形成 的氢键结合不稳定,连接黏性末端的最佳温度,一般认为420C 比较合适。2) DNA片段末端:不仅要考虑反应体系中DNA末端的 总浓度,还要考虑载体与插入片段的末端浓度的比例。原则上应 保证一个DNA分

16、子的末端有较高的几率与另一 DNA分子连接,减 少同一个分子两个末端之间的自身连接。载体与插入片段 3:1 1: 3。3)连接酶浓度:平末端DNA分子的连接反应,最适酶量大 约是12单位;而黏末端DNA片段间的连接,在同样的条件下, 仅为 0.1 单位时,便能得到最佳连接效率。28切口平移法制备DNA探针的原理是什么?答:在Mg离子存在时,用低浓度的DNA酶I (DNase I)处理双链 DNA,使之随机产生单链断裂。然后用DNA聚合酶I的5 - 3外 切酶活性可以从断裂处的 5 端除去一个核苷酸,而其聚合酶活 性则将一个单核苷酸添加到断裂处的 3 端。随着反应的进行, 即5 端核苷酸不断去除,而 3 端核苷酸同时掺入,导致断裂形 成的切口沿着DNA链按合成的方向移动,这种现象称为切口平移。 如果在反应体系中加入放射

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