亚克隆方法

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1、试剂的配制和器皿的灭菌:亚克隆试剂储液配制一览表:名称储存浓度储存条件Ampicillin100mg/ml分装为1ml,-20Co葡萄糖lmol/L0.22um滤膜过滤除菌,分装为1ml,-20CX-gal20mg/ml二甲基甲酰胺溶解,分装为1ml,用铝箔包裹,-20C。IPTG20%0.22um滤膜过滤除菌,分装为1ml,-20C。1. 培养基的配制和保存:1) LB 液体培养基的配制和保存:100ml200 ml500 ml1000 ml胰化蛋白胨(g)12510酵母提取物(g)0.512.55氯化钠(g)12510用容积适当的三角锥瓶盛放 LB 液体培养基,用滤菌膜封住瓶口,高温高压

2、灭菌,冷却后,放置于4C保存,备用。2) LB 固体培养基的配制和保存:100ml200 ml500 ml1000 ml胰化蛋白胨(g)12510酵母提取物(g)0.512.55氯化钠(g)12510琼脂粉(g)1.537.515用容积适当的三角锥瓶盛放 LB 固体培养基,用滤菌膜封住瓶口,高温高压灭菌,冷却后,标记为Amp-,放置于4C保存,备用。亦可以稍冷却一段时间至60C (微烫,尚可以忍受)时,立刻配制平板(培 养皿已提前灭菌,烘干)。在超净工作台中风吹4h,或者在烘箱中烘干。平板制 好后,用灭菌的塑料袋密封,标记为Amp-放置于4C保存,备用。用预先离心的 1.5ml 离心管分装 8

3、00ul1.0ml 左右灭菌的液体培养基,按照 1ul Amp/lml培养基的比例,加入Ampicillin,标记为Amp+放置于4C保存,备 用。4)LB固体培养基(Amp +)的制备和保存:灭菌后的固体培养基,冷却至50C左右时,分装一部分至另一灭菌备用的 三角锥瓶中,按照75ul/100ml加入Ampicillin (100mg/ml),倒入培养皿,制备 Amp+平板,将培养皿盖子打开一点,以避免水珠凝结。待Amp+平板凝固,加入适当体积的X-gal和IPTG混合液(用时混合),用 涂布棒涂布均匀,放置于超净工作台风吹4h,或者放置于烘箱中烘干。用已经灭菌的大小合适的塑料袋把做好的平板密

4、圭寸,标记为Amp+,放置于 4 C保存,备用。2. 葡萄糖溶液的配制和保存:配制1 mol/L的葡萄糖溶液,经过过滤除菌,分装为1ml,冻于-20C,备用。3. X-gal 和 IPTG 溶液的配制和保存:1) X-gal 溶液的配制和保存:X-gal是5-溴-4-氯-3-吲哚-卩-D半乳糖苷。用二甲基甲酰胺溶解X-gal,配置 成 20mg/ml 的储存液。使用玻璃或聚丙烯管保存储存液。装有 X-gal 溶液的试管 需用铝箔包裹,防止因光照而被破坏,并储存于-20C。2) IPTG 溶液的配制和保存:IPTG为异丙基硫代P-D半乳糖苷。用8ml蒸馏水溶解2gIPTG,用蒸馏水 定容至10m

5、l,配置成20%的溶液。用0.22um过滤器过滤除菌。分装为1ml1份, -20 C保存。3) X-gal 和 IPTG 直接用于琼脂板:涂布 X-gal 的时候应特别小心,培养板中央的克隆由于 X-gal 浓度的差异也 许会产生更深的蓝色。具体操作:a、在含有氨苄的预制90mm琼脂板(LB)中央滴加40ul 2%X-gal和7ul 20%IPTG。如用 150mm 培养基,则应加入 100ul2%X-gal 和 20 ul 20% IPTG。b、用无菌涂布棒均匀涂布X-gal,使之分散于培养板整个表面。于37C 温育直至全部液体消失(由于二甲基甲酰胺挥发性低,如用新鲜琼 脂板,这一过程要持续

6、 34h)。c、接种后,待接种液完全吸收,将平板倒置于37C培养12 19hd、取出培养板,在4C放置数小时,使蓝色在这一期间充分显色。4. Amp 溶液的配制和保存:配制 100mg/ml Ampicillin 溶液, 0.22um 过滤除菌。分装成 1ml 左右, -20C 保存。5. 转化缓冲液(1XTSS)的制备:1 X TSS溶液的配制:85%高压灭菌的LB液体培养基、10%聚乙二醇 (PEG,wt/vol, MW3350)、5% DMSO (vol/vol)和 50mM MgC12 (pH6.5)将除LB液体培养基以外的成分混合,0.22um过滤除菌,然后高压灭菌的 LB液体培养基

7、混和,置于4C保存,可保存6个月。二、感受态细胞的制备:1. 从-70C中拿出冻存的DH5a菌株,不待融化,迅速用牙签(接种环) 挑取一些冰渣,在LB培养板(Amp-)上划线,37C培养过夜。2. 挑取1个单菌落,放入100ml的盛放于250ml三角锥瓶中的LB液体 培养基(Amp-)中,37C,220rpm摇菌过夜。3. 对上述菌液测量OD值在0.4 0.5之间时,取出锥瓶,转入50ml离心 管,置冰上, 4C, 3000rpm, 10minuts 离心收集细胞,将上清液倒尽。4.加入10ml预先冰冷的TSS溶液在冰上重悬细胞。勿使细胞下沉,迅 速将感受态细胞悬液分装为100u 1/管,丢入

8、液氮速冻,并转移到-70C 冰箱储存备用。三、PCR 产物的纯化:按照Qiagen胶回收试剂盒说明书进行操作。四、PCR 产物的连接:按照 pMD-19T 载体试剂盒说明书进行操作。Vector0.3ul (50ng /ul)Insert DNA1ulDDW1.2ulLigate mixture2.5ulTotal5.0ul将上述试剂在冰上混合后,立刻放置于4C连接过夜或者16C连接8h。然 后放置于4C,备用。五、重组质粒的转化:1. 将保存于-70C的感受态细胞取出放置于冰上解冻,并立即加入5u1连接 产物,并在冰上放置 60min。2. 42C热激90sec,立刻冰浴2min。3. 向转

9、化后的细菌中加入780U1LB液体培养基和20u1 1M葡萄糖储液。室 温下, 150rpm 温和摇菌 30min, 37C 200rpm 摇菌 30min。六、重组菌株的培养和阳性克隆的筛选:1、重组菌株的培养将复苏后的重组细菌在常温下,4000rpm离心5min,吸取800u1澄清LB 液体培养基。用200u1黄枪头,小心吹打离心后的细菌,使成悬液,并将其加入到预先冻存的LB平板(Amp+,含X-gal和IPTG)。用涂布棒小心涂布均匀,在超净工作台中放置(半开盖),待菌液完全被吸收(约10分钟),倒置于37C生化培养箱中培养1218h。2、阳性克隆的筛选取出培养基,在冰箱中4C放置数小时,直到显现蓝色菌斑。用灭菌牙签挑取白色菌斑,在10ul反应体系(载体测序引物与扩增cDNA 特异引物组合)PCR管内蘸洗12次,然后再在事先标记好的培养皿的方格区 域内接种4 5个菌落(注意PCR管和培养皿方格标记一致,培养皿标记方式如 下图,牙签回收灭菌,重复利用。培养菌的同时,做菌落 PCR。菌落 PCR 做完,1.2的琼脂糖凝胶进行电泳,根据目的条带大小确定阳性 克隆菌斑并判断DNA插入的方向,并在对应的培养皿的方格上做标记(如上图)。挑选已标记的阳性菌斑,放入800ul LB液体培养基(Amp+)中于37 C 300rpm 摇菌数小时。扩大培养的菌液亚克隆测序。

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