乳腺癌项目临床及科研合作方案

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1、乳腺癌项目临床及科研合作方案一、研究背景1、乳腺癌介绍乳腺癌是我国妇女恶性肿瘤发病率排第一的癌症，根据 WHO 的数据显示， 2008 年中国女性乳腺癌新增病例达到16.9万例，死亡人数为 4.5 万例。在我国， 广州上海等大城市的乳腺癌发病率明显高于其他中小城市。乳腺癌的生存率在世 界范围内差异很大，北美为 80%，中等收入地区为 60%，而低收入地区则为不到 40%。各地区生存率差异大的一个重要原因在于欧美发达国家早在19世纪60年代 就开始了乳腺癌普查，到达90 年代已经从中明显获益。我国乳腺癌筛查工作也 在国家支持下进行之中，采用了临床乳腺检查、钼靶 X 线检测以及彩超检测多种 手段。

2、对于我国乳腺癌患者早期诊断、生存率提高和中国人特色乳腺癌资料的获 得和积累都有重大意义。在所有乳腺癌患者中，有 5%-10% 是由属于遗传性乳腺癌，其发生与 BRCA1/BRCA2 基因密切相关。在 BRCA1 突变携带者中，70 岁前发生乳腺癌的机 率为 65%；在 BRCA2 突变携带者中，70 岁前发生乳腺癌的 45%。现在欧美国家 已经有了 BRCA1/BRCA2 基因突变的临床检测，尤其是美国和丹麦不仅开展了相 关的基因检测，还进行了 BRCA1/BRCA2 基因突变携带者进行预防性用药、预防 性乳房切除的研究。对于 BRCA1/BRCA2 基因突变高危人群进行基因检测，对于患者个人

3、和全社 会都有着极高的益处。该检测的阳性检出者可以选择进行预防性用药或预防性乳 房切除，或是着重进行乳腺癌筛查的检测。这些措施都能降低乳腺癌发病率，提 高患者的早期诊断率、生存率。而高危人群中检出 BRCA1/BRCA2 阴性的女性， 则可以进行如同普通女性一样的筛查频率和强度。所以 BRCA1/BRCA2 基因突变 筛查与临床检测筛查相结合，可以更加合理、高效的利用国家的医疗资源，增加 高危人群的获益，降低普通人群的过度诊断和过度治疗。其对于全国乳腺癌筛查 的意义在于基因检测和临床手段相结合可以作为一个新筛查模式起到带头作用， 建立中国女性 BRCA1/BRCA2 基因突变与遗传性乳腺癌的宝

4、贵数据（欧美已经有所研究），将来对乳腺癌筛查工作起到很好的指导作用。2、开展遗传性乳腺癌基因筛查的意义目前应用于筛查的乳腺癌常规检测技术主要有临床手诊、B超检查、钼靶X 线检查。深圳华大临床检验中心的乳腺癌筛查技术利用最新的高通量测序技术提供 遗传性乳腺癌相关基因检测。将传统的检测方法与最新测序技术相结合，在原有的基础上增加对遗传性乳 腺癌 BRCA1/BRCA2 的筛查，将会使我国的乳腺癌筛查项目更加全面，有利于今 后有目的的对高危人群进行着重筛查，提高一部分乳腺癌患者的早期诊断率。早 期诊断和治疗能大大提咼乳腺癌的治愈率，I、II期患者五年生存率能咼达90% 左右，所以积极开展检查争取早期

5、发现十分有必要。同时建立中国人群特有的乳 腺癌 BRCA1/BRCA2 突变基因数据库，缩小与欧美发达国家在乳腺癌早期筛查等 工作上的差距，对提咼我国人群的健康具有深远意义。3. 乳腺癌个体化治疗的意义根据乳腺癌分子生物学的发展，发现乳腺癌是一个异质性的疾病，这就要求 该疾病的治疗从常规的一般化治疗逐渐过渡至个体化的治疗。因而，个体化治疗 成为了乳腺癌治疗的最新方向。虽然同样是乳腺癌患者，但是每个人的病理类型 和分子生物学类型特征是不同的，所以如果采用统一的治疗方式，取得的治疗效 果不一定都会很好；采取同样的预防措施，效果也不一定好。内分泌治疗是乳腺 癌个体化治疗的典型案例。他莫昔芬是乳腺癌内

6、分泌治疗应用最为广泛的药物， 但是该药物治疗的乳腺癌患者在药物反应及毒副反应方面具有明显的个体差异， CYP2D6基因的多态性与他莫昔芬的药物代谢密切相关,CYP2D6活性障碍的患者, 接受他莫昔芬治疗时，体内Endoxifen血药浓度较低，临床预后不良。由此可见， 利用基因检测技术,指导乳腺癌个体化治疗方案的选择、预测乳腺癌治疗的疗效 具有重要意义。4. 妇科肿瘤早期诊断的意义在癌症的发生发展中，多种基因的编号发生着重要作用，而借助于高通量检 测，可实现检测技术的高灵敏性。如在患者的外周血浆及宫颈脱落细胞即可检测 到肿瘤相关基因变异，可应用于妇科癌症的早期发现。通过高通量测序平台，高 准确的

7、检测乳腺癌、宫颈癌、子宫内膜癌和卵巢癌中的突变基因，阐明常见基因 突变与妇科四大肿瘤的相关性，进行癌症的早期检测，从而有效预防癌症的发生， 为临床干预提供科学依据。深圳华大临床检验中心开展的该项目首次提出在基因 组水平检测女性四癌，并应用于女性肿瘤的早期筛查，为女性健康起到指导作用。 二、乳腺癌可合作内容：1. 遗传性乳腺癌筛查（门诊及体检开展项目）（1）检测内容对符合条件的人群进行知情同意，同意参与检测者进行基因突变检测。同时， 获取受检者三代详细家族史，获取肿瘤患者医疗记录以及手术史。对受检者进行 乳腺肿瘤的体格检查，必要时进行相应临床检测。综合受检者临床信息，家族史 以及基因检测结果，给

8、出乳腺癌风险评估以及风险管理方案。检测基因：BRCA1、BRCA2（2 个基因）或BRCA1，BRCA2，CHEK2，PALB2，BRIP1，TP53，PTEN，STK11，CDH1，ATM，BARD1，MLH1，MRE11，MSH2，MSH6，MUTYH，NBN，PMS1，PMS2, RAD50，RAD51C（21 个基因）对于未检出上述基因存在突变，但有明显家族史的受检者，扩大检测另外 94 个肿瘤易感基因，结合检测结果分析是否有别的综合征导致了受检者或亲属 存在乳腺癌，或者是否有新的基因与乳腺癌遗传易感性相关。（2）筛选人群：建议参与该基因检测的人群如下： 两位一级亲属患乳腺癌，其中一位

9、在 50 岁之前确诊 三位或三位以上一级或二级亲属患有乳腺癌 一级和二级亲属患有乳腺癌和卵巢癌（一种癌症/ 人） 一位一级亲属患有双乳癌 两位或两位以上一级或二级亲属患有卵巢癌 一位一级或二级亲属同时患有乳腺癌和卵巢癌 一位男性亲属患有乳腺癌 另外，在条件允许情况下，基于预防医学之观点，一般健康人群亦可接受此 项基因检测，从而对其身体健康起到良好的指导作用。(3) 取样、运送：由医院或体检机构主导进行，不低于5mL的外周血，装 于EDTA抗凝采血管中，严禁使用肝素抗凝，充分颠倒混匀，避免凝固。置于-20C 冰箱保存，干冰或冰袋运输。(4) 检测：由华大基因临检中心进行，经过样本质检，对未出现采

10、血管破 损、血样污染的样本进行高通量测序，数据分析，并出具检测报告。( 5)预后：相关基因突变检测阴性者可与正常人群一样接受常规乳腺疾病 筛查，对于相关基因突变阳性者需遵照医生建议定期到合作医院进行 B 超检查、 钼靶X线检查及其他治疗、预防措施，发现乳腺肿块及时进行治疗。2. 乳腺癌个体化治疗基因检测(门诊开展项目)(1) 检测内容：对接受乳腺癌药物治疗的患者进行知情同意，同意参与检 测者进行基因突变检测。同时，获取患者临床使用治疗药物史。综合受检者临床 信息，以及基因检测结果，给出乳腺癌患者个体化治疗方案。检测套餐1：(7 个基因， 4 种药物)药物检测项目临床意义样本类型化疗 药 物铂类

11、药物ERCC1基因多态性预测疗效2-3mL外周血XRCC1基因多态性预测疗效2-3mL外周血GSTP1基因多态性预测疗效2-3mL外周血5-FUDPYD基因多态性预测毒副作用2-3mL外周血MTHFR基因多态性预测疗效2-3mL外周血吉西他滨CDA基因多态性预测毒副作用2-3mL外周血他莫西芬CYP2D6基因多态性预测疗效2-3mL外周血检测套餐2：(461个基因，113种药物)INiJps SNVs C NVs?夕卜显子突变基312 Diff-ExpGene可解读基因113可解读药物融合 基因21匕TumorCareT癌症个体化治疗基因检测V1.0/importantFusions /甌药物

12、 化疗药物 激素治疗 疫苗药物 药物代谢 放疗相关 预后相关891071351018127其它癌症热点突变基因176该项目是综合现有已知所有与肿瘤相关的基因，从中选取能够解读的 461 个基因(该数据仍在不断更新中)。在此基础上，进一步对基因突变类型进行细 分，根据其突变与药物之间的关联，比如药物敏感或耐药等，对重点基因的热点 区域进行检测，因而也是目前最全的肿瘤基因检测项目，该技术能检测出相关基 因点突变、插入缺失、拷贝数等变异，由于其涵盖基因数量较广，最终能够解读 出的信息量较多，能够找到与肿瘤对应的药物信息也会相应增多，一方面针对性 加强，另一方面选择范围更大，该产品现已成为我们的核心产

13、品推荐，特别针对 那些尚未找到合适药物或原有药物出现耐药情况的肿瘤病人。其特点是涵盖基因 数量多，能够反映出更多肿瘤突变相关信息，增强对用药的指导作用。(2) 筛选人群：1：临床初诊时，期望进行个性化用药检测且适合手术取样的肿瘤病人。2：现有治疗方案不佳，期望更换用药方案且适合手术取样的肿瘤病人。3：肿瘤复发或转移，治疗方案无效，需重新制定用药方案且适合手术取样 的肿瘤病人。(3) 取样、运送：由医院主导进行，套餐1所需样本类型为2-3mL外周血，EDTA抗凝管采集，严禁使用肝素管采集。置于-20C冰箱保存，干冰或冰袋运输。 套餐 2 所需样本类型及送检要求详见附件 1。( 4)检测：由华大基

14、因临检中心进行，经过样本质检，对符合检测要求的样本进行San ger测序或高通量测序，数据分析，并出具检测报告。（5）预后：根据基因检测的结果并结合临床信息，由临床医生给出最合适 的个体化治疗方案。3. 乳腺癌早期诊断基因检测（科研项目）（1）研究内容：本项目通过采集肿瘤组织标本和不同病理阶段的宫颈脱落 细胞标本，外周血标本，分类保存实验，并跟踪随访并系统性分析。 研究分析引起乳腺癌、宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌的常见基因突变； 比较同一个癌症患者的三类不同标本（癌组织、宫颈脱落细胞，外周血浆 循环DNA）的基因突变检测一致性。评估利用宫颈脱落细胞及外周血浆早期检测 乳腺癌、宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌的可能性； 监测患者血清中乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌肿瘤抗原标志物水 平，比较血清中肿瘤标志物水平高低与基因突变频率高低的关系； 通过对比分析癌症患者，早期病变患者以及正常妇女人群中的血浆和宫颈 脱落细胞DNA检测结果，验证该技术检测的敏感性，特异性和准确性。该项目目前在做技术攻关，待成功后可开展科研合作。