噬菌体展示技术解析

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1、噬菌体展示技术解析噬菌体展示技术解析噬菌体展示技术经过近20年的发展和完善,已被广泛应用于抗原抗体库的建立、药物设 计、疫苗研究、病原检测、基因治疗、抗原表位 研究及细胞信号转导研究等。噬菌体展示系统模 拟了自然免疫系统,使我们有可能模拟体内抗体 生成过程,构建高亲和力抗体库。由于噬菌体展 示技术实现了基因型和表型的有效转换,使研究 者在基因分子克隆基础上实现了蛋白质构象体 外控制,从而为获取具有良好生物学活性的表达 产物提供了强有力手段。另外,噬菌体展示技术 已成为不经过免疫获取特异性人源抗体的新途 径,为获取对人类和动物疾病有诊断和治疗价值 的单克隆抗体提供了重要手段。应用面这么高大上,那

2、么原理到底是什么 呢?那接下来将由小编为您揭开其神秘的面纱!一、噬菌体展示技术的原理噬菌体展示技术(phage display )是将多 肽或蛋白质的编码基因插入噬菌体外壳蛋白结 构基因的适当位置,在阅读框正确且不影响其他 外壳蛋白正常功能的情况下,使外源多肽或蛋白与外壳蛋白融合表达,融合蛋白随子代噬菌体的 重新组装而展示在噬菌体表面。展示到噬菌体表 面的多肽或蛋白保持相对独立的空间结构和生 物活性,可以与靶分子结合和识别。噬菌体展示 的肽库或蛋白库与固相抗原结合,洗去未结合的 噬菌体,然后用酸碱或者竞争的分子洗脱下结合 的噬菌体,中和后的噬菌体感染大肠杆菌扩增, 经过3-5轮的富集,逐步提高

3、可以特异性识别靶 分子的噬菌体比例,最终获得识别靶分子的多肽或者蛋白。下图粗略展示了技术筛选的过程:二、噬菌体展示系统的分类1. M13噬菌体展示系统M13噬菌体属于单链环状DNA病毒,其基因 组为6.4 kb,编码10种蛋白,其中5种为结构 蛋白,包括主要衣壳蛋白的 PW和次要衣壳的 pM、pF、P% 和 PK 。其中,pH 和 PW 是 噬菌体展示中最常用的两种蛋白,构建了 pH和 PW展示系统。pH蛋白分子量为42 kDa,分 布在噬菌体颗粒的一端。一般一个噬菌体有 3-5 个拷贝的pH蛋白,可在N端的柔性连接区插 入外源蛋白或者多肽。pH系统的主要优点是对 展示的外源蛋白大小无严格的要

4、求, 该系统可以 用来展示分子量较大的蛋白。PW蛋白的分子量 为5.2 kDa,主要分布在噬菌体颗粒的两侧。由 于该蛋白的分子量很小,只适合用来展示外源短 肽。外源肽段的太大会影响病毒包装, 不能形成 有功能的噬菌体。但由于pH蛋白拷贝数较多,该系统比较适合用来筛选低亲和力的配体。pixpVIIIpvi2. 入噬菌体展示系统入噬菌体是长尾噬菌体科的一种温和噬菌 体,有直径55nm的二十面体头部,末端有细长 尾丝。基因组为48.5 kb的线性双链DNA分子, 有黏性末端即单链延伸12个核苷酸,感染后线 性基因组可立即环化。噬菌体的头部由D蛋白和 V蛋白构成,可以构建D蛋白和V蛋白的展示系 统。入

5、噬菌体是在宿主细胞内完成装配的,无需 将外源肽或蛋白分泌到细菌胞膜外,可展示有活 性的大分子蛋白质(100 kDa以上蛋白质)及宿主 细胞有毒性的蛋白质,适用范围极广。3. T4噬菌体展示系统T4噬菌体基因组DNA为双链线形,呈环状 排列,噬菌体衣壳的有两种非必需外壳蛋白: SOC(small outer capsid protein) 禾口 HOC(highly antigenic outer capsid protein)。 T4噬菌体表面展示是将外源多肽或蛋白质分别 与SOC位点的C末端和HOC位点的N末端融合 而展示于T4噬菌体表面。T4噬菌体的主要优点 是可以实现SOC位点和HOC位

6、点同时展示,展示 的拷贝数也较多。4. T7噬菌体展示系统T7噬菌体基因组为线性双链 DNA其衣壳 蛋白通常有两种形式,即10A(344个氨基酸残基 和10B(397个氨基酸残基),10B衣壳蛋白区存 在于噬菌体表面,所以被用来构建噬菌体展示系 统。T7噬菌体展示系统可以高拷贝展示 50个氨基酸的多肽,以低拷贝量(0.1-1/噬菌体)或以中 拷贝量(5-15/噬菌体)展示1200个氨基酸残基 的多肽或蛋白质。因此,广泛应用于筛选不同分子量,不同亲和力的蛋白质0000 龜PVII/DVIIIPVIPIII三、噬菌体展示技术的应用1. 抗体筛选将抗体可变区的基因插入噬菌体基因组中, 表达的抗体展示

7、到噬菌体的表面,构建噬菌体展 示抗体库,可以在体外模拟抗体生成的过程,筛 选针对任何抗原的抗体。相对于杂交瘤技术,通 过噬菌体展示抗体库技术筛选抗体,可以不经过 免疫,缩短抗体生产的周期。也可以筛选在体内 免疫原性弱,或者有毒性的抗原的抗体,适用范 围广。噬菌体展示抗体库技术不受种属的限制, 可以构建各种物种的抗体库。从人天然库中筛选 到的抗体,可以不经过人源化过程,直接用于抗 体药物研究。2. 新受体和配体的发现将随机多肽序列展示到噬菌体的表面,获得 噬菌体展示多肽库。用细胞作为筛选靶标,经过 差异筛选,获得出识别特定细胞的多肽。通过研 究该多肽序列,可以进一步得到细胞表面特异性 表达的受体

8、蛋白。用HCT116细胞筛选12肽库, 从库中筛选出了可以特异性行识别结肠癌细胞 的多肽。进一步分析分析发现,该多肽可以特异 性识别a-enolase。该蛋白有望作为结肠癌治疗 的靶标,筛选结肠癌治疗药物。获得的多肽序列, 也可以作为抗癌药物的运送载体。3. 蛋白质相互作用研究蛋白质的相互作用是生命过程中所不可缺 少的,噬菌体展示的多肽文库是由特定长度的随 机短肽序列组成。用靶蛋白质(如受体)对该随机 文库进行亲和淘选,就可以获得与之结合的短肽 序列。对所得序列测序分析,并合成相应的短肽, 从而可以来研究两个蛋白质之间的相互作用。 利 用这种方法已经成功鉴定出多个重要大分子,如 生长激素受体、

9、胰岛素受体、胰岛素样生长因子 受体和TNF-a受体的激动剂和颉颃剂等。4. 抗原表位分析用抗体作为筛选的蛋白,从噬菌体展示的随 机多肽库中,筛选出可以与抗体特异性结合的噬 菌体,经测序分析,获得该抗体识别的抗原表位。 该技术为抗原抗体反应机制研究,诊断试剂开 发,疫苗制备等提供依据。目前的表位鉴定技术能够实现: 单抗药物及诊断用单抗的制备; 研制包括“通用”目标在内的治疗性和预防性 重组多价肽疫苗; 研制单表位或重组多表位肽检测抗原; 筛选基于表位基序的疾病、肿瘤等新的特异诊断标志物; 高通量发现同源蛋白中全部保守性和特异性 表位; 筛选功能性抗体表位或者抗体中和性及可及 性表位; 为表位水平

10、分析病毒遗传进化和变异,提供抗 原漂移和转移的直接证据。5. 抗体人源化改造单抗人源化比例不断升高,单抗的药物靶位 逐渐多样化,除了传统的细胞表面抗原,还包括 了常见的细胞因子,部分研制中的单抗药物甚至 可以识别多个抗原表位,而且单抗药物的结构也 不限于完整的单抗分子。联合小分子等的治疗方 案逐渐增加,日益受到医疗工作者的重视。因此, 作为一种高科技含量的药物,单抗药物企业的科 技水平决定了其竞争力,也决定了药物的治疗效 果和市场价值。6. 双特异性抗体(BsAb制备通过基因工程手段将两个分别靶向不同抗 原的抗体片段组合在一起,具有两种抗原结合位点,可以发挥协同作用,进而提高治疗效果。但 是双

11、特异性抗体的种类较多,选择时根据最终的 应用来做判断。7. 酶抑制剂筛选3 -酮脂酰-ACP还原酶是原核生物脂肪酸 生物合成代谢中高度保守和广泛存在的酶, 用此 蛋白为筛选的靶蛋白,从噬菌体肽库中筛选出了 该酶的抑制剂,可以作为新型的抗菌剂。已针对 乙酰胆碱酯酶、海藻糖酶、乙酰乳酸合成酶、乙 酰CoA羧化酶和谷氨酰胺合成酶等靶标酶,开 发和研制了一系列高效的杀虫剂和除草剂。8. 蛋白质的定向改造蛋白质的定向改造是指用盒式突变、 错误倾 向PCR等方法来突变蛋白质或者结构域的某一 特定编码序列,产生蛋白质或结构域的突变文库 呈现在噬菌体表面,通过亲和筛选获得所需的已 定向改变的噬菌体克隆,他们的

12、一级结构可以从 DNA勺序列中推导出来,可用来筛选具有更强受 体结合能力的细胞因子、新的酶抑制剂、转录因 子的DNA吉合新位点、新的细胞因子拮抗剂、新型酶和增强生物学活性的蛋白质等。三、金开瑞噬菌体展示定制服务类型1. 天然/免疫抗体库构建(人、小鼠、兔、羊驼 等)2. 抗原表位鉴定3. 蛋白质相互作用研究4. 抗体筛选5. 抗体人源化6. 抗体亲和力成熟7. 重组抗体改造参考文献:Azzazy, H. M. and W. E. Highsmith, Jr. (2002). Phage display technology: clinical applicati ons and rece nt

13、 inno vati on s. Cli n Biochem 35(6): 425-445.Dai, M., J. Temirov, E. Pesavento, C. Kiss, N. Velappan, P. Pavlik, J. H. Werner andA. R. Bradbury (2008). Usi ng T7 phage display to select GFP-based bi nders. ProteinEng Des Sel 21(7): 413-424.Dunn, I. S.(1995).Assemblyof functionalbacteriophagelambda

14、virions incorporatingC-terminalpeptideor proteinfusions withthe major tailprotein. J Mol Biol 248(3):497-506.Kristan, K., T. Bratkovic, M. Sova, S. Gobec, A. Prezelj and U. Urleb (2009). Novelin hibitors of beta-ketoacyl-ACP reductase from Escherichia coli. Chem Biol In teract178(1-3): 310-316.Pande

15、, J., M. M. Szewczyk and A. K. Grover (2010). Phage display:concept, innovations,applicatio ns and future. Biotech nol Adv 28(6): 849-858.Paschke, M. (2006). Phage display systems and their applicati on s. Appl Microbiol Biotechnol 70(1): 2-11.Ren,乙 J., G. K. Lewis, P. T. Wingfield, E. G. Locke, A. C. Steven and L. W. Black(1996). Phage display of in tact doma ins at high copy n umber: a system based on SOC,the small outer capsid protein of bacteriophage T4. Protein Sci 5(9): 1833-1843.Smith, G. P. (1985). Filame ntous fusi on phage: no vel expressi on vectors that display cloned antigens o

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