细胞色素C的抗原决定基

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1、多肽计算器细胞色素 C 多肽氨基酸残基个9Pit数:1字符:AYLKKATNE3 字符:Ala-Tyr-Leu-Lys-Lys-Ala-Thr-Asn-Glu分子量:1037.18 g/mol等电点:9.6PH=7 时的净电荷:1.0平均亲水性:0.4亲水残基比例:44 %Net ChargeHydrophilicity结果氨基酸残基个数:1字符:GDVEKGKKI3 字符:Gly-Asp-Val-Glu-Lys-Gly-Lys-Lys-Ile分子量:973.14 g/mol等电点:9.8PH=7 时的净电荷:1.0平均亲水性:1.3亲水残基比例:56 %Net Charge Hydrophi

2、licity多肽序列输入1 序列输入您可以在“序列”下的方框内输入您的多肽序列(氨基端一羧基端),输入的格式可以为氨基酸的1字符 或3 字符,也可两者混合输入。2 多肽 N/C 端修饰的选择 氨基端可供选择的修饰有乙酰化、生物素标记、焦谷氨酸化;羧基端可选择酰胺化。 结果分析1 分子量 输入目标序列,可很迅速的计算出该多肽的分子量。2 等电点等电点即为目标多肽所带净电荷为零时的PH,其计算方法以最具权威的“Lehninger Principles of Biochemistry ”为依据。3 PH为7时的净电荷PH为7时的净电荷是指在PH=7的溶液中目标多肽所带的净电荷;当然,您还可以根据“N

3、et charge”图 表了解到在不同PH条件下目标多肽的净电荷情况。4 平均亲水性 平均亲水性是根据多肽序列中各氨基酸残基以及不同修饰的亲/疏水值来得到的。从一条肽的平均亲水性值 我们可以判断其在水的溶解性如何。平均亲水性值为23:说明该多肽的溶解性非常的好;即使多肽短暂的与空气接触,也有吸潮的可能。为解决这个问题,强耀生 物建立了能将空气湿度大大降低的 GMP 级实验室,所 有多肽的分装工作都在此实验室中完成;同时,在发 货的时候我们也会在多肽包装盒内放置高效的吸潮 剂,最大限度的降低了多肽吸潮的可能性。平均亲水性值为 02:一般来讲,这样的多肽在水中溶解性都很好;无需添 加助溶剂亦可取得

4、较好的溶解效果。平均亲水性值为=0:多肽在水中的溶解性一般;可以通过以下方法来增加多肽的溶解性:1调整溶液的ph助溶;2超声助溶; 3调整溶液温度(W30C)助溶;4添加助溶剂(如 DMSO,DMF 等),建议先将肽溶于有机溶剂,再缓慢加 入水或其它缓冲溶液。 5 对于碱性肽,建议用 10%乙 酸溶解,对于酸性肽,建议用10%NH4HC03溶解。平均亲水性值为0-2:多肽在水中的溶解性较差;您可以利用以上5种方法 助溶,同时也可在多肽序 列中增加亲水性氨基酸,以 增加多肽的亲水性。平均亲水性值为-2-3: 多肽在水中的溶解性非常的差;导致多肽很难纯化, 多肽纯度亦很难提高,客 户在运用这种多肽的时候, 也会遇到多肽异常难溶的问题。遇到这种情况,我们 一般会建议客户更换序列或在现有序列中加入亲水性 氨基酸。另外,多肽的溶解度还与其二级结构、修饰标记物的性质以及溶剂类型和终浓度有关系。5 亲水残基比例指多肽序列中亲水性氨基酸残基数占总残基数的百分比。

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