SDS法提取植物基因组DNA

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1、1=1【实验目的】学习和掌握常用基因组DNA提取方法。【实验要求】1.设计所采用实验方案并独立完成所有实验操作; 2.获得高纯度、完整 DNA 样品。一、原理:利用含高浓度SDS的抽提缓冲液在较高温度(5565C )条件下裂解植物细胞,使 染色体离析,蛋白质变性,释放出核酸,然后提高盐浓度KAc)和降低温度(冰上保温) 的办法沉淀除去蛋白质和多糖(在低温条件下KAc与蛋白质及多糖结合成不溶物),离 心除去沉淀后,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,反复抽提后用乙醇沉淀水相中的DNA。二、药品试剂及耗材: 液氮 提取缓冲液:500 mmol/L NaCl, 100 mmol/L Tris-HCl p

2、h8, 50 mmol/L EDTA p,h810 mmol/L 2-巯基乙醇(用前加入) 20% SDS ph7.2 5 mol/L KAc 氯仿:异戊醇(24:1) 异丙醇 70%乙醇TE 缓冲液:10 mmol/L Tris-HCl,l mmol/L EDTA,PH8.0耗材:移液枪,15、2.0、1.5ml离心管,篮、黄、白枪头各四套离心管架4个,离心管盒2个,水浴泡沫8个,研钵及小药勺8套 棉手套,薄膜手套,透明胶布,剪刀三、操作程序1. 将1_g植物材料于液氮速冻,然后在研钵中将其磨碎,将粉末转至2 ml离心管中。2. 加入1.2 ml预热至65C的提取缓冲液(3V),轻缓振荡混匀

3、,加入120 ul 20%SDS(达到终浓度 2%),混匀,置65C水浴中放置30分钟,不时颠倒混匀。3. 加入0.45 ml 5M的醋酸钾(1/10V),混匀,冰浴20分钟,在10000 rpm离心20 min。需要的 话,Miracloth纱布过滤除去沉淀,取上清液转入另一离心管中。4. 加入等体积氯仿:异戊醇(24: 1),轻轻颠倒混匀,12000 rpm离心15 min。5. 转移上清液到另一新离心管中,加入冰预冷异丙醇,轻轻颠倒混匀,(见丝状沉淀)-20C 放置30分钟沉淀核酸。6. 25 C, 12000 rpm,离心 10 min,收集沉淀。7. 弃上清,70乙醇洗两次。& 凉干

4、DNA,溶于50 M ddH2O (或TE biffer), 4C保存备用。各药剂作用: 平衡酚(Tris饱和):用Tris碱饱和的苯酚,其作用是去除蛋白质有机合成的中间体;重提缓冲液: 10mmol/L Tris-HCl(pH8.0)0.1mol/L EDTA ( pH8.0)螯合溶液中的金属离子(Ca2+ ;0.5%SDS阴离子表面活性剂;氯仿:抑制核酸酶,提苯酚; 异戊醇:异戊醇可快速分层,去气泡; 异丙醇:能与自由水紧密结合。结合了溶解 DNA 的水分子,使 DNA 沉淀。可常温沉淀,离心,加入 体积为0.50.7V,但,不易除去,故用70%酒精多洗几次,否则对酶切,连接有影响。无水乙

5、醇:易于从DNA沉淀中除去。但-20C放置1030min,离心T 4C,加入沉淀剂体积大(2倍), 由于使用的管多为一次性,故浪费。蛋白酶K (Proteinase K):无RNA酶和DNA酶活性,有降解天然蛋白质的能力; RNA 酶:分解 RNA。要点1:某些植物种的 DNA 由于褐色多酚类化合物的存在会出现变色现象,这种变色通常不会影响后 续的实验操作。但如果发现有影响的话,可以在一定量的 2-巯基乙醇,防止酚氧化,对 DNA 有一定 稳定作用。或在提取缓冲液中加入2% (W/V)的聚乙烯吡咯烷酮(PVP),与酚类结合,有助于除去多 酚类杂质。要点2:将SDS溶液加入到化冻的提取物中时,可能会有沉淀析出,要保证析出的SDS重新溶解,以 及65 C保温时提取物混匀。要点3:在高浓度(lmol/L)的钾离子存在的情况下,十二烷基磺酸钠(SDS)会与蛋白或多糖结合变 成不溶性的十二烷磺酸钾复合物, 这类复合物通常呈絮状, 必须要经较高转速离心和 Miracloth 纱布 过滤予以去除.要点4:若沉淀难于重新溶解,可在65C加热10min.

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