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1、河北科技师范学院本科毕业论文（设计）开题报告16SrRNA基因序列分析在细菌分离鉴定中的应用院（系、部）名称：动物科技学院专业名称：动物医学学生姓名：师清博学生学号： 0362100214指导教师：陈丽凤2013年07月05日河北科技师范学院教务处制一、课题来源 指导老师提供二、主要依据长期以来，对病原菌的传统分类鉴定主要采用分离培养、形态特征、生化反应和免疫学等方法， 但这些方法均存在耗时长、特异性差、敏感度低等问题，难以满足现代细菌学研究的发展要求随着分 子生物学技术的迅速发展，特别是聚合酶链式反应（PCR）技术的出现及核酸研究技术的不断完善，产生 了许多新的分类方法，如质粒图谱、PCR指
2、纹图、16S核糖体核糖核酸（ribosomalRNA，rRNA）序列分析 等。这些技术主要是对细菌染色体或染色体外的3NA片段进行分析，从遗传进化的角度和分子水平进行 细菌分类鉴定，从而使细细菌分类更科学、更精确。特别是16SrRNA基因序列析技术的出现，使细菌进 化与否可以通过试验研究来证实，这是细菌分类史上的一次革命。16SrRNA基因序列分析就是从微生物样品中提取16SrRNA的基因片段，通过克隆、测序或酶切、探 针杂交获得16SrRNA基因序列信息，再与16SrRNA数据库中的序列或其他数据进行比较，确定其在进化 树中的位置，从而鉴定样本中可能存在的微生物种类。由于16SrRNA基因序
3、列的保守性和存在的普遍性， 应用16SrRNA作为分子指标已逐渐成为微生物检测和分类鉴定的一种强有力的工具。本试验试图从我校动物医院提供的分离自水貂的一株细菌中提取16SrRNA的基因片段，通过测序获 得16SrRNA基因序列信息，再与16SrRNA数据库中的序列或其他数据进行比较，从而鉴定细菌的种类。三、研究内容（一）收集病料，进行细菌培养（二）提取分离自水貂细菌的基因组DNA（三）引物的设计与合成（四）进行分离自水貂细菌基因的PCR检测（五）对PCR产物进行序列测定四、研究计划及预期成果研究计划：1、2013年08月一12月在河北科技师范学院动物医院熟悉水貂的养殖情况，了解水貂常见细菌病 的发病表现，收集资料。2、2014年02月一04月 进行细菌分离培养、DNA提取、PCR检测、电泳等。3、2014年05月一06月实验结果分析、对数据的审查及整理、整理资料并完成论文及答辩。预期成果：1、扩增出目的基因2、测得目的基因序列五、特色或创新之处对我校动物医院分离自水貂巴细菌进行基因的检测，并分析其基因特性与临床症状、病理变化之 间的关系，为临床上防治水貂细菌病提供科学依据。六、已具备的条件和尚需解决的问题已具备的条件：实验室具有全部使用器材及实验所需试剂。有待解决的问题：PCR序列的测定七、指导教师意见指导教师签名：年 月 日
