蛋白质CD光谱定性解析总结

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1、蛋白质的圆二色性 (1)由氨基酸通过肽键连接而成; (2)光学活性基团:肽键、芳香氨基酸残基、二硫桥键; (3)蛋白质有多个结构层次,相同的氨基酸序列,因蛋白质的折叠结构不同,基团的光学活性受到影响。蛋白质的圆二色特征 (1)光学活性基团及折叠结构; (2)250nm以下的光谱区,肽键的电子跃迁引起; (3)250300nm光谱区,侧链芳香基团的电子跃迁引起; (4)300700nm光谱区,蛋白质辅基等外在生色基团引起。蛋白质CD光谱的波长范围:远紫外区(185-245nm)、近紫外区(245-320nm)分子构象电子跃迁形式极值的波长*103Deg.cm2/dmol-螺旋(-helix)n2

2、21222nm(-)207210nm(-)191nm(+)-38-40-36-407286-折叠(-sheet)n217218nm(-)195197nm(+)-19-212842-转角(-turn)n227nm(-) 弱200205nm(+)192.5(-)强无规卷曲(random coil)230nm(-)215218nm(+)195202nm(-)强-1.612-25-50圆二色谱法分析多肽二级结构圆二色谱是一种特殊的吸收谱,它通过测量蛋白质等生物大分子的圆二色光谱,从而得到生物大分子的二级结构,简单、快捷,广泛应用在蛋白质折叠,蛋白质构象研究,酶动力学等领域。圆二色谱紫外区段(190-2

3、40nm),主要生色团是肽链,这一波长范围的CD谱包含了生物大分子主链构象的信息。-螺旋构象的CD谱在222nm、208nm处呈负峰,在190nm附近有一正峰。-折叠构象的CD谱,在217-218nm处有一负峰,在195-198nm处有一强的正峰。无规则卷曲构象的CD谱在198nm附近有一负峰,在220nm附近有一小而宽的正峰。蛋白浓度与使用的光径厚度和测量区域有一定关系,对于测量远紫外区德氨基酸残基微环境的蛋白而言,浓度范围在0.11.0mg/ml,则光径可选择在0.10.2cm之间,溶液体积则在200500ul。而测量近紫外区的蛋白质三级结构,所需浓度要至少比远紫外区的浓10倍方能检测到有效信号,且一般光径的选择均在0.21.0cm,相应的体积也需增加至12mL缓冲液可选50100mmol trs-HCl、PBS等,尽量除去EDTA。远紫外近紫外二硫键一般都是不对称的,它在圆二色性光谱上,于195-200nm和250-260处有谱峰色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸残基的侧链其谱峰在230-310nm之间,色氨酸残基侧链的谱峰一般集中在290- 310nm之间,但有时也会向短波长方向移动从而与酪氨酸残基侧链的谱峰重叠在250-260nm之间,苯环的谱峰又与二流键的谱峰重叠 / 文档可自由编辑打印

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