细胞思考题2015粗制版

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1、定量检测几十万个分散的细胞的DNA含量应用流式细胞检测技术(FCM)1.收集单细胞悬液(1 106个),缓慢加入1 ml预冷的70乙醇,于4固定过夜,或-20长期固定。2离心收集细胞,再以1ml PBS彻底洗去乙醇;3去上清后加入染色液(包含50ug/ml PI,100ug/ml RNase A,0.2% Triton X-100),37 染色30min后上机检测。4DNA荧光染料能与DNA结合,DNA含量的多少与荧光染料的结合量成正比,荧光强度反应了DNA吸收荧光分子的多少。通过流式检测就能反映细胞内DNA的含量。看线粒体内外膜结构以及此处的某种蛋白颗粒看线粒体内外膜结构及蛋白颗粒要用透射电

2、镜。定量检测一批光镜切片上含有某种蛋白质的细胞的数目首先对切片上的全部细胞进行针对目的蛋白的荧光探针特异性标记(荧光染色,荧光标记抗体,外源导入荧光蛋白),同时对细胞行核复染。再以荧光显微镜或激光扫描共聚焦显微镜观察。荧光探针的特异性标记:即荧光强度与特异性标记蛋白的表达量成正相关了解细胞发生死亡时的形态学和某个酶的改变首选以流式细胞术通过对检测细胞以Annexin V/PI双染法或亚二倍体(Sub-G1)峰的检测分选出凋亡细胞。再荧光标记凋亡细胞的要检查的酶,以激光扫描共聚焦显微镜观察酶的变化。对细胞电子染色后以扫描电子显微镜观察其形态。了解某个新基因所编码的蛋白质的功能1.首选以North

3、ern blot检测该蛋白在各组织中的表达。选出表达丰度最高组织细胞。2设立该组织细胞的cDNA文库,从中筛选出与该蛋白有相互作用的蛋白(编码基因)。3.以酵母双杂交法及GSTpulldown方法对所筛选蛋白做验证。4.由所筛选出的蛋白功能来分析推测该蛋白功能并用分子生化技术及细胞生化技术检测。透射电子 当样品厚度小于100nm时,部分电子可穿透样品,将穿透样品的电子叫做透射电子,利用透射电子信息成像的电子显微镜称为透射电镜。二次电子 在入射电子的轰击下,样品表面550nm深度激发出来的电子称为二次电子,利用二次电子信息成像的电子显微镜称为扫描电镜。电子显微镜:电子显微镜镜以电子射线作为照明源

4、,以电磁场作为透镜,具有高分辨率和放大倍率的显微镜。电镜用于研究组织和细胞的超微结构。分辨率 表示人眼和光学仪器能够辨别两点之间最小距离的标志。免疫电镜技术 免疫电镜技术是将免疫学方法与电子显微镜技术相结合,利用抗原与抗体特异结合的特性,在超微结构水平定位特异大分子的技术。如果需要了解细胞内部的超微结构变化,请问应选择哪种类型的电镜?TEM透射电镜样本取材时必须做到快、小、轻、冷,为什么?快:1分钟内固定,尽可能保持其生活状态,因为瞬间的拖延都会导致细胞超微结构的变化。 小: 约1mm的小块,组织块过大其中央得不到及时固定会发生细胞自溶现象。轻: 不要牵拉、锯、挤压组织,避免细胞受到损伤。冷:

5、 低温操作,4保存,降低酶的活性,避免组织发生自溶。没有及时固定的组织细胞透射电镜下会出现何种改变? 自溶扫描电镜取材必须注意哪些?因为扫描电镜观察的是样品表面结构,必须充分暴露并保护好观察面,避免损伤要观察的部位,材料要新鲜,取材部位要准确,样品块要尽量小一些,用锋利的刀片,尽快固定。气管、胃、肠粘膜可固定在滤纸上展平,要将表面的血液、粘液用生理盐水或缓冲液仔细漂洗干净。贴壁细胞: 进口玻璃盖玻片1cm1cm ,生长细胞,缓冲液漂洗,戊二醛固定12小时游离细胞: 玻璃盖玻片表面涂10%多聚赖氨酸(10分 钟),未完全干燥时涂一层细胞(10分钟),戊二醛固定12小时简述激光共聚焦显微镜的工作原

6、理。在显微镜基础上配置激光光源、扫描装置、共轭聚焦装置和检测系统而形成的新型荧光显微镜系统。以激光作为激发光源,对样本进行断层扫描,同时采用光源针孔与检测针孔共轭聚焦技术,最终获得高分辨率光学切片图像的荧光显微镜系统。简述激光共焦显微镜与荧光显微镜的差别。它有哪些优缺点?光源不同(激光Vs普通光),扫描方式不同(断层扫描VS一次成像),聚焦不同(光源针孔+检测针孔双聚焦VS透镜聚焦),图像采集处理不同(计算机采集处理VS目视)优点:高水平及垂直分辨率,可经计算机处理成三维结构,缺点:1.逐点扫描,成像速度慢。2.观测厚度:50-100m3.分辨率极限:0.15m简述激光共聚焦显微镜的功能。观察

7、标记荧光素的样品:1.薄层断层扫描2.多通道同时成像3.ZOOM成像4.多维度成像5.荧光定量分析负显性突变:对影响蛋白质功能的关键位点进行突变,所得突变体不仅丧失了原有功能,并且可以抑制内源性蛋白质的功能。DNA microarray:是一种用于分子生物学和医学领域的高通量技术. 它由一系列成千上万个精微的DNA寡核苷酸点排列而成,这些DNA寡核苷酸含有百亿分之一摩尔特定序列的。它们或者是一小截基因,或者是DNA的其他成分。它们被作为探针,在非常严格的条件下和一个叫做靶分子的cDNA 或 cRNA样本杂交。由于靶分子带有荧光标记,因此通过探针-靶分子的杂交,并根据杂交后荧光的有或无 ,强或弱

8、,对靶分子中特定核酸序列的丰度进行检测。共激活因子:是一种蛋白,本身不能与DNA结合,但能够通过与具有DNA结合结构域的激活因子(或转录因子)结合来增强基因的表达。共激活因子可调节转录的许多其他过程,如转录的延长、终止、 RNA剪接以及激活因子和共激活因子复合体的降解等。报告基因: 是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相融合,在调控序列控制下进行表达,从而利用它的表达产物来标定目的基因的表达调控。 si RNA(small interfering RNA):也被称为短干扰RNA

9、(short interfering RNA)或沉默RNA(silencing RNA),通常为人工合成的长约20到25个核苷酸的双股RNA,利用其可与特定信使RNA(mRNA)发生同源性结合并使之降解的特点,诱导序列特异的目标基因发生沉默,从而阻断特定基因的表达。具有靶向、高效、易于操作的特点,是一种研究细胞内基因表达的新技术。染色质免疫沉淀技术(CHIP): 研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,

10、从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA):是一种研究核酸结合蛋白和其相关的核酸结合序列相互作用的技术。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一同保温,在非变性的聚丙烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针。DNA-蛋白复合物或RNA-蛋白复合物比非结合的探针移动得慢。在竞争的特异和非特异片段的存在下,依据复合物的特点和强度来确定特异结合。同位素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,可是双链或单链。检测可用纯化蛋白、部分纯化蛋白或核细胞抽提液。研究蛋白质在细胞内的活动情况需要从哪些方面入手?由以下几个方面决定:合成速率:mRNA 水平。 稳

11、定性:蛋白水平。定位:细胞核、细胞质、细胞器。活性:酶活性:激酶、NADPH氧化酶、组蛋白脱乙酰酶(HDAC)等转录活性:主要指转录因子(TF),促进靶基因转录的活性(注意:转录因子活性受到co-activator或co-repressor的调节)和哪些蛋白在一起相互作用、相互影响?通常有哪些实验手段可以用来研究蛋白和DNA的相互作用?体内 :染色质免疫沉淀技术(CHIP)。体外:凝胶电泳迁移率改变分析(EMSA)可用哪些技术对细胞内某个蛋白的水平进行干预? 它们有什么区别?增减合成该蛋白的必需氨基酸,促进或抑制编码该蛋白的DNA转录SiRNA对编码该蛋白的RNA沉默。免疫细胞化学技术:是利用

12、免疫化学反应来定位组织细胞中特异大分子的一类技术。原位杂交技术:将分子生物学与细胞化学技术结合起来,以标记的核酸分子为探针,在组织细胞原位,与细胞内需探测的核酸杂交以检测特异核酸分子的技术,可以反映特异核酸分子的量,同时也可以反映与组织、细胞、细胞器或染色体结构的位置关系。第二抗体:能够识别一抗的种属特异性,并因此结合一抗,称为二抗(抗种属抗体)原位杂交技术严格度:也叫严紧度。决定探针是否与含不相配碱基的核酸序列结合的条件,是决定杂交双链间形成氢键稳定性的条件,从而最终影响特异性。简述免疫荧光技术和免疫亲和技术的比较。免疫荧光技术将荧光素作为标记物使组织细胞中形成的抗原抗体复合物在荧光显微镜下

13、可见,从而显示抗原物质的定位。亲和细胞化学技术是利用亲和物质之间高度亲和能力而互相结合,以定位特异分子的技术。(亲和物质 具有多价能力的物质,与另一种亲和物质有高度亲和力,又能与抗体、蛋白质及各种标记物(荧光素、酶、胶体金等)结合)亲和技术优点:灵敏度高,特异性强,稳定性好。根据标记物的不同可用荧光显微镜,光镜,电镜等多种观察方法.如何在培养细胞水平或临床标本上了解新发现蛋白质的定位?如需了解蛋白质定位和定量的信息,可综合采用哪些技术?(分子生物学和细胞生物学)免疫组织化学,免疫细胞化学,免疫荧光技术,免疫胶体金技术,免疫酶技术,免疫亲和技术以免疫酶技术为例,简述操作流程。(“流程”的意思).

14、 免疫酶技术是将酶作为标记物将组织细胞中形成的抗原抗体复合物得到标记,再通过酶细胞化学反应产生显微镜下可见的显色物质,间接显示抗原物质的定位。流程:组织细胞固定石蜡包埋或冷冻切片(保持原位)-化学反应显色反应观察如何应用免疫荧光技术分析2种蛋白质的共定位,简述原理和操作流程。免疫荧光技术将荧光素作为标记物使组织细胞中形成的抗原抗体复合物在荧光显微镜下可见,从而显示抗原物质的定位。基本过程:固定(组织脱水,包埋、切片)-免疫细胞化学反应,抗原与抗体标记系统反应。原位杂交技术中如何应用了其他几种细胞化学技术?基本实验过程:使含有特异序列、经过标记的核酸单链即探针,在适宜条件下与组织细胞中的互补核酸单链即靶核酸发生杂交,再以放射自显影或免疫细胞化学方法对标记探针进行探测,从而在细胞原位显示特异的DNA或RNA分子。探针标记纯化(变性) 涂覆乳胶 放射自显影 原位杂交杂交体探测:加酶联抗体加酶底物显色 金银染色 样品制备切片通透处理1) 同位素标记探针放射自显影2) 加入底物四唑氮蓝和吲哚酚酶细胞化学技术3) 核酸探针杂交分子生物学技术4) 地高辛抗体与探针结合免疫细胞化学技术为什么说原位杂交技术是分子生物学和细胞化学技术的结合?原位杂交技术中,先将标记的核酸探针与组织细胞中靶核酸分子结合形成杂交体,这是分子生物学技术,然后用同位素或免疫细胞化学技术探测杂交体。如 用地高辛标记

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