核酸、蛋白技术参数资料、分子量标准及常用试剂的配制

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1、欢迎阅读本文档,希望本文档能对您有所帮助!-核酸、蛋白技术参数资料、分子量标准及常用试剂的配制窗体顶端一、核酸及蛋白质常用数据 1核苷三磷酸的物理常数化合物分子量max(pH7.0)1摩尔溶液(pH7.0)中max时的最大吸收值OD280/OD260ATP507259154000.15CTP48327190000.97GTP523253137000.66UTP484262100000.38dATP494259152000.15dCTP46727193000.98dGTP507253137000.66dTTP48226796000.712常用核酸的长度与分子量核酸核苷酸数分子量DNA48502(

2、双链环状)3.0107pBR3224363(双链)2.810628SrRNA48001.610623SrRNA37001.210618SrRNA19006.110519SrRNA17005.51055SrRNA1203.6104tRNA(大肠杆菌)752.51043常用核酸蛋白换算数据(1)重量换算1g=10-6g 1pg=10-12g 1ng=10-9g 1fg=10-15g (2)分光光度换算:1A260双链DNA=50g/ml 1A260单链DNA=30g/ml 1A260单链RNA=40g/ml (3)DNA摩尔换算:1g 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端1g

3、 pBR322 DNA=0.36pmol 1pmol 1000bp DNA=0.66g 1pmol pBR322=2.8g 1kb双链DNA(钠盐)=6.6105道尔顿1kb单链DNA(钠盐)=3.3105道尔顿1kb单链RNA(钠盐)=3.4105道尔顿(4)蛋白摩尔换算:100pmol分子量100,000蛋白质=10g 100pmol分子量50,000蛋白质=5g 100pmol分子量10,000蛋白质=1g 氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿(5)蛋白质/DNA换算:1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7104MW蛋白质10,000MW蛋白质=270bp DNA 30,000

4、MW蛋白质=810bp DNA 50,000MW蛋白质=1.35kb 100,000MW蛋白质=2.7kb DNA 4常用蛋白质分子量标准参照物(1)高分子量标准参照(2)中分子量标准参照(3)低分子量标准参照肌球蛋白分子量磷酸化酶B97,400碳酸酐酶31,00肌球蛋白212,000牛血清白蛋白66,200大豆脻蛋白酶21,500-半乳糖甘酶B116,000谷氨酶脱氢酶55,000抑制剂磷酸化酶B97,400卵白蛋白42,700马心肌球蛋白16,900牛血清白蛋白66,200醛缩酶40,000溶菌酶14,400过氧化氢酶57,000碳酸酐酶31,000肌球蛋白(F1)8,100醛缩酶40,0

5、00大豆脻蛋白酶21,500肌球蛋白(F2)6,200抑制剂肌球蛋白(F3)2,500溶菌酶14,4005常用DNA分子量标准参照物DNA/HindDNA/EcoR/Hind+EcoRpBR322/Hae23130212262122758712394167421514840510465575804497350489436156434268458802322484335304346420273530202726757564190423451125158421321137519218974184118311247564125常用抗生素溶液 抗生素贮存液a工作浓度浓度保存条件严紧型质粒松弛型质粒氨苄

6、青霉素50mg/ml(溶于水)-2020g/ml60g/ml羧苄青霉素50mg/ml(溶于水)-2020g/ml60g/ml氯霉素34mg/ml(溶于乙醇)-2025g/ml170g/ml卡那霉素10mg/ml(溶于水)-2010g/ml50g/ml链霉素10mg/ml(溶于水)-2010g/ml50g/ml四环素b5mg/ml(溶于乙醇)-2010g/ml50g/mla:以水为溶剂的抗生素贮存液通过0.22m滤器过滤除菌。以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。b:镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB培养基)。五、常用

7、贮存液的配制130%丙烯酰胺溶液【配制方法】将29g丙烯酰胺和1g N,N-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。加热至37溶解之,补加水至终体积为100ml。用Nalgene滤器(0.45m孔径)过滤除菌,查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温。【注意】丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收,其作用具累积性。称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具。可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能会含有少量未聚合材料。一些价格较低的丙烯酰胺和双丙烯酰胺通常含有一些金属离子,在丙烯酰胺贮存液中加入大约0.2体积的单床混合树脂(MB-1Mallinckrodt),

8、搅拌过夜,然后用Whatman 1号滤纸过滤以纯化之。在贮存期间,丙烯酰胺和双丙烯酰胺会缓慢转化成丙烯酰和双丙烯酸。240%丙烯酰胺【配制方法】把380g丙烯酰胺(DNA测序级)和20g N,N-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为600ml的蒸馏水中。继续按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法处理,但加热溶解后应以蒸馏水补足至终体积为1L。【注意】见上述配制30%丙烯酰胺的说明,40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列测定。3放线菌素D溶液【配制方法】把20mg放线菌素D溶解于4ml 100%乙醇中,1:10稀释贮存液,用100%乙醇作空白对照读取OD440值。放线菌素D(分子量为1255)纯品在水溶液中的摩尔消

9、化系数为21,900,故而1mg/ml的放线菌素D溶液在440nm处的吸光值为0.182,放线菌素D的贮存液应放在包有箔片的试管中,保存于-20。【注意】放线菌素D是致畸剂和致癌剂,配制该溶液时必须戴手套并在通风橱内操作,而不能在开放在实验桌面上进行,谨防吸入药粉或让其接触到眼睛或皮肤。药厂提供的作治疗用途的放线菌素D制品常含有糖或盐等添加剂。只要通过测量贮存液在440nm波长处的光吸收确定放线菌素D的浓度,这类制品便可用于抑制自身引导作用。40.1mol/L腺苷三磷酸(ATP)溶液【配制方法】在0.8ml水中溶解60mg ATP,用0.1mol/L NaOH调至pH值至7.0,用蒸馏水定容1

10、ml,分装成小份保存于-70 510mol/L乙酸酰溶液【配制方法】把770g乙酸酰溶解于800ml水中,加水定容至1L后过滤除菌。610%过硫酸铵溶液【配制方法】把1g过硫酸铵溶解于终量为10ml的水溶液中,该溶液可在4保存数周。7BCIP溶液【配制方法】把0.5g的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸二钠盐(BCIP)溶解于10ml 100%的二甲基甲酰胺中,保存于4 82BES缓冲盐溶液【配制方法】用总体积90ml的蒸馏水溶解1.07g盐溶液BESN,N-双(2-羟乙基)-2-氨基乙磺酸、1.6g NaCl和0.027g Na2HPO4,室温下用HCl调节该溶液的pH值至6.96、然后加入蒸馏水

11、定容至100ml,用0.22m滤器过滤除菌,分装成小份,保存于-20。91mol/L CaCl2溶液【配制方法】在200ml蒸馏水中溶解54g CaCl26H2O,用0.22m滤器过滤除菌,分装成10ml小份贮存于-20。【注意】制备感受态细胞时,取出一小份解冻并用蒸馏水稀释至100ml,用Nalgene滤器(0.45m孔径)过滤除菌,然后骤冷至0。102.5mol/L CaCl2溶液【配制方法】在20ml蒸馏水中溶解13.5g CaCl26H2O,用0.22m滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20。111mol/L二硫苏糖醇(DTT)溶液【配制方法】用20ml 0.01mol/L乙酸钠溶

12、液(pH5.2)溶解3.09g DTT,过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20。【注意】DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。12脱氧核苷三磷酸(dNTP)溶液【配制方法】把每一种dNTP溶解于水至浓度各为100mmol/L左右,用微量移液器吸取0.05mol/l Tris碱分别调节每一dNTP溶液的pH值7.0(用pH试纸检测),把中和后的每种dNTP溶液各取一份作适当稀释,在下表中给出的波长下读取光密度计算出每种dNTP的实际浓度,然后用水稀释成终浓度为50mmol/L的dNTP,分装成小份贮存于-70。 碱基波长(nm)消化系数()L/(molcm)A2591.54104G2531.

13、37104C2719.10103T2607.40103比色杯光径为1cm时,吸光度=M 130.5mol/l EDTA(pH8.0)溶液【配制方法】在800ml水中加入186.1g二水乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na2H2O),在磁力搅拌器上剧烈搅拌,用NaOH调节溶液的pH值至8.0(约需20g NaOH颗粒)然后定容至1L,分装后高压灭菌备用。【注意】EDTA二钠盐需加入NaOH将溶液的pH值调至接近8.0,才能完全溶解。14溴化乙锭(10mg/ml溶液)【配制方法】在100ml水中加入1g溴化乙锭,磁力搅拌数小时以确保其完全溶解,然后用铝箔包裹容器或转移至棕色瓶中,保存于室温。【注意】小心:溴化乙锭是强诱变剂并有中度毒性,使用含有这种染料的溶液时务必戴上手套,称量染料时要戴面罩。152HEPES缓冲盐溶液【配制方法】用总量为90ml的蒸馏水溶解1.6g NaCl、0.074g KCl、0.027g Na2PO42H2O、0.2g葡聚糖和1gHEPES,用0.5mol/l NaOH调节pH值至7.05,再用蒸馏水定容至100ml。用0.22m滤器过滤除菌,分装成5ml小份,贮存于-20。16IPTG溶液【配制方法】IPTG为异丙基硫代-D-半乳糖苷(分子量为238.3),在8ml蒸馏水中

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