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1、梨果皮色泽变异品种(系)的AFLP与SRAP标记鉴定-论文网论文摘要:本试验利用AFLP和SRAP标记对3组果皮色泽的变异品种(系)进行鉴别,54对AFLP引物共检测1089个位点,其中多态性条带数为688,多态性比率为63.2%;20对SRPA引物可检测210个位点,其中多态性条带为76条,多态性比率为36.2%。分析结果表明,7对AFLP引物、3对SRAP引物可区分南果与其红色变异系;3对AFLP引物、1对SRPA引物可区分考密斯、红考密斯、早红考密斯与其绿色变异系;所检测的引物均无法区分红安久及其绿色变异系。综合AFLP与SRAP标记的检测结果,获得4个品种(系)的特征谱带,SRPA引物
2、em11/me5可区分除红安久及其变异系以外的所有供试材料,可应用于各品种(系)的分子鉴别。论文关键词:梨,皮色,变异前言果皮的色泽是果实外观品质的核心指标,也是影响其商品价值的重要指标。梨属植物种质资源按果皮颜色划分主要有绿皮、褐皮和红皮三种类型。在世界范围内的栽培种中只有西洋梨具有较多的红色品种;而中国大面积主栽的白梨、砂梨和秋子梨品种均以绿色、褐色为主,果皮色泽偏淡,在众多色泽鲜艳的果品中难以形成视觉竞争优势。为了满足市场消费的需求,培育红色果皮的梨新品种成为种质创新的一个发展热点。梨是高度杂合的多年生木本植物,易发生自然变异。目前,有关梨果皮色泽的变异品种或株系在各地均有发现,但由于传
3、统的突变鉴定的方法主要是依据表观性状的测定和描述,难以确定其是否为饰变,即由外界环境条件改变而非遗传物质变异,此类变异易随环境条件的改变而恢复原表型,且不能遗传给后代。近年来快速发展的DNA分子标记技术可直接检测遗传物质分子水平的变化,成为目前研究者认同的鉴定变异材料的可靠依据,并成功应用于苹果、梨、石榴、甜橙以及葡萄等果树芽变系的鉴定研究中。关于梨果皮色泽变异的鉴定,Yamamoto等曾利用9对SSR(Simplesequencerepeat)引物对巴梨及其芽变红巴梨进行分析,均无法区分原种及其芽变;张东等利用SSR标记技术对29个砂梨品种进行鉴定,认为红皮砂梨很可能源于绿皮砂梨的芽变。路娟
4、等曾尝试采用SSR标记对红考密斯和考密斯进行鉴定,也未能获得成功。鉴于目前对梨果皮色泽变异的分子鉴定尚未有成功鉴定的相关报道,本文拟采用AFLP和SRAP标记方法对收集的几组色泽变异品种或株系进行鉴定,以期从分子水平揭示色泽变异品种(系)与原始品种的差异,从而为变异新品种的早期鉴定和保护提供更加科学、有力的技术支持,并为开展梨果皮色泽形成的分子机理奠定基础。1材料与方法1.1试验材料供试材料为3组色泽变异的品种资源或株系,品种名称及色泽性状如表1。样品分别采自南京农业大学、河北昌黎果树研究所以及辽宁省农科院果树研究所。于春季采集各材料健康植株上的幼嫩叶片,置于冰桶中,带回实验室洗净、擦干后,液
5、氮速冻并于-20冰箱保存备用。表1供试的品种(系)Table1Cultivarsorstrainsusedinthisstudy 编号 No. 品种或株系 Cultivars(strains) 外观色泽 Colour of appearance 样品采集地 Place of sample collection 1 南果Nanguo 绿色 green 辽宁Liaoning 2 南果红色变异系 Red variant strain of Nanguo 红晕 red flush 辽宁Liaoning 3 考密斯 Doyenne du Comice 绿色 green 南京Nanjing 4 红考密斯
6、Red Doyenne du Comice 紫红色 dark red 南京Nanjing 5 早红考密斯 Early red Doyenne du Comice 紫红色 dark red 河北 Hebei 6 早红考密斯绿色变异系Green variant strain of Early red Doyenne du Comice 绿色 green 河北Hebei 7 红安久Red dAnjou 红色 red 河北Hebei 8 红安久绿色变异系Green variant strain of Red dAnjou 绿色green 河北Hebei 1.2试验方法1.2.1基因组DNA的提取采用改
7、良CTAB法提取基因组DNA,利用核酸分析仪检测DNA的浓度,0.8%琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量,并根据实验需要进行合理稀释,于-20保存备用。1.2.2AFLP标记分析反应体系参考LuisaMonte-Corvo的研究,并结合本试验材料进行合理优化,试验采用三碱基选择性引物,引物序列参照李元军,引物合成由英潍捷基(上海)贸易有限公司完成,MseI/EcoRI内切酶和T4DNA连接酶均购于纽英伦生物技术(北京)有限公司。酶切反应体系为20L,DNA模板2L、NEBBuffer2L、BSA1000.3L、MseI0.5L、EcoRI0.3L、ddHO14.9L,37下酶切5小时,置于6515m
8、in;连接反应是将EcoRIadapter1L、MseIadapter1L、TBuffer1L、ddHO1.5L混合后加入酶切产物中,连接12小时,置于6515min。选择性扩增的PCR产物采用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染显色,以获得电泳图谱。1.2.3SRAP标记分析SRAP引物序列参照路娟的研究,PCR反应体系采用本试验室优化的体系。取4LPCR产物于1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,若与预期片段大小相近且条带清晰,再通过8.0%的变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)分离,银染后观察、拍照。1.3数据统计与处理对于同一引物的扩增产物,有带记为“1”,无带记为“0”,弱带及分辨不清的条带忽略不计。将
9、数据录入Excel表格,形成二元矩阵,根据Nei和Li计算相似系数,用NTSYSpc2.02软件中的SHAN程序对色泽变异品种(系)进行聚类,并作聚类图。2结果与分析2.1基因组DNA扩增结果利用64对AFLP引物组合对供试品种进行PCR扩增,其中54对引物扩增出稳定、清晰的条带,扩增条带大小范围在100500bp之间,部分引物扩增的电泳图谱如图1。对扩增条带的统计结果分析表明,54对引物在3组色泽变异品种及株系中共检测1089个位点,平均每对引物检测位点数为20,其中多态性条带数为688,多态性比率为63.2%。采用30对SRAP引物组合对供试品种进行检测,有20对引物可扩增稳定、清晰的条带,扩增产物大小在1001000bp范围内,部分扩增条带如图2。对扩增条带的统计分析表明,20对引物在3组色泽变异品种及株系中共检测210个位点,平均每对引物检测位点数为10.5,其中多态性条带为76条,多态性比率为36.2%。