实用pcr流程表

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1、临床PCR检验流程记录表检验日期: 检验项目: HBVDNA扩增仪中保存文件名使用说明:严格按单一流向进行实验,即试剂准备区一标本制备区一扩增区,严禁逆向移动。本记录表的流向亦遵循此流程;各项 工作执行后在相应项目前的方框内打“丿”;本记录表最后归档保存在PCR实验室扩增区的专用文件夹中,以备查找。实验前准备试剂在有效期内扩增仪、加样器、金属浴、温湿度计等仪器在校准有效期内(校准之日起1年)生物安全柜的滤膜在使用有效期内离心管、带滤芯吸头已经过质检合格各区按消毒液配制SOP配制500mg/L含氯消毒液、2000mg/L含氯消毒液和70%酒精,即用即配。打开通风设备操作者试剂准备区实验前:更换专

2、用工作服、戴口罩、帽子、鞋套 实验台面清洁(500mg/L含氯消毒液、70%酒精或水擦拭)冰箱温度:冷藏室(28C)C;冷冻室(-202C)C实验室温度。C (允许范围:1530C);相对湿度:(允许范围:30%70%)PCR试剂来源:试剂厂家:口深圳匹基生物工程有限公司批号:检验项目:HBVDNA本次实验用量:人份; 剩余量:人份其他有关试剂配制:仪器设备使用:离心机:正常不正常;振荡器:正常 不正常;生物安全柜:口正常口不正常实验后:按实验室清洁消毒SOP清洁实验室台面、地面、加样器和离心机,并进行紫外线照射30分钟以上.按实验室废弃物处理SOP处理实验废弃物。操作者样本处理区实验前:更换

3、专用工作服、戴口罩、帽子、鞋套 实验台面清洁(500mg/L含氯消毒液、70%酒精或水擦拭) 冰箱温度:冷藏室(28C)C;冷冻室(-202C)C实验室温度。C (允许范围:1530C);相对湿度:(允许范围:30%70%)HBV-DNA阳性室内质控物来源:浓度及批号:扩增位置:HBV-DNA阴性室内质控物来源:批号:扩增位置:所处理的HBV-DNA标本(对应标本接收的唯一编号)及拟扩增位置:191725334149576573818921018263442505866748290311192735435159677583914122028364452606876849251321293745

4、536169778593614223038465462707886947152331394755637179879581624324048566472808896核酸提取及加样过程:按乙型肝炎病毒DNA荧光定量PCR操作程序SOP进行。仪器设备使用:生物安全柜:正常不正常;恒温金属浴:。C;离心机:正常 不正常;振荡器:正常 不正常;低温离心机:制冷:正常 不正常;离心:正常 不正常实验后:按实验室清洁消毒S0P清洁实验室台面、地面、加样器和离心机,并进行紫外线照射30分钟以上.按实验室废弃物处理SOP处理实验废弃物。口使用后标本冷冻保存3个月,以备复查.操作者扩增及产物分析区实验前:更换专用

5、工作服、戴口罩、帽子、鞋套 实验台面清洁(500mg/L含氯消毒液、70%酒精或水擦拭) 实验室温度。C (允许范围:1530C);相对湿度:(允许范围:30%70%)LightCycler扩增仪操作:开机自检及运行正常;按LightCycler操作使用SOP进行编程、参数设定HBVDNA标准曲线计算值:Slope值:Intercept值:r2值:室内质控结果:阴性质控物结果:;阳性质控物结果:口填写室内质控记录、质控图;是否失控:口否 口是室内质控结果:阴性质控物结果:;阳性质控物结果:口填写室内质控记录、质控图;是否失控:口否 口是失控原因及分析:(失控判断标准及原因分析按室内质控SOP进

6、行)实验结果:见所附扩增仪打印结果实验结果有效性判断:有效无效(依据实验结果有效性判断SOP进行)实验后:按实验室清洁消毒S0P清洁实验室台面、地面、加样器和离心机,并进行紫外线照射30分钟以上。按实验室废弃物处理SOP处理实验废弃物.操作者1。 操作步骤:1.2.1取n个1。5ml的灭菌离心管,作好标记。(样本数+1管HCV阴性对照+1管HCV强阳性对照+1管HCV临界阳性对照)1.2.2 向上述离心管中分别加入 25ul 蛋白酶溶液。1.2.3分别加入待测样本、HCV阴性对照、HCV临界阳性对照和HCV强阳性对照各200ul.1.2.4加入200ul新鲜配制的裂解液工作液,盖上盖子,振荡1

7、5秒,充分混匀。(注意:不要把蛋白酶溶液直接加入裂解液工作液中)。1.2.51.2.656摄氏度温浴15分钟。瞬时离心,以去除管盖上的滴液.加入250ul无水乙醇,盖上盖子,彻底混匀(振荡15秒)。在室温下静置5分钟(15-25摄氏度)。注意:如果环境温度超过 25 摄氏度,无水乙醇需预冷。瞬时离心,以 去除管盖上的滴液。1.2.7将n个核酸提取柱放入收集管中,小心地将步骤1。2。6中的液体移入核酸提取 柱中。盖上盖子,600O*g离心1分钟。倒掉收集管中的废液,将提取柱重新放入 收集管中。 (如果离心后核酸提取柱中仍有部分液体,以更高的速度再次离心,确保 提取柱中无残余的液体)1.2.8小心

8、的打开核酸提取柱的盖子,加入500ul洗液1,盖上盖子,6000*g离心1分 钟,倒掉收集管中的废液,将提取柱重新放入收集管中。1.2.9小心的打开核酸提取柱的盖子,加入500ul洗液2,盖上盖子,6000*g离心1分 钟,倒掉收集管中的废液,将提取柱重新放入收集管中.1.2.10小心的打开核酸提取柱的盖子,加入 500ul 无水乙醇,盖上盖子, 6000*g 离心 1分钟,丢弃收集管,将提取柱放入新的收集管中.1.2.1120000*g高速离心3分钟,彻底去除乙醇。1.2.12 丢弃收集管,将核酸提取柱放入干净的 1。 5ml 离心管中,打开提取柱的盖子,56摄氏度温浴3分钟,以彻底去除残余

9、的液体。1.213将核酸提取柱放入另一干净的1。5ml离心管中,小心打开提取柱的盖子,加入60ul洗脱液(请将洗脱液加到膜的中央儿盖上盖子,室温静置5分钟。20000*g高速离心1分钟收集滤出液,做好标记, 4摄氏度保存备用.提取的病毒核酸应在2小时内用于PCR扩增,或在一70摄氏度下可以保存一个月。2.扩增试剂准备(PCR前准备区)从试剂盒中取出HCV RTPCR反应液、Enzyme Mix ,在室温下融化后,2000*g 离心5秒。设所需要的PCR反应管数(玻璃毛细管)为n(n=样本数+1管空白对照+1 管HCV阴性对照+1管HCV强阳性对照+1管HCV临界阳性对照+4管HCV定量标 准品

10、),每个测试反应体系配制如下表:试剂HCV RTPCR反应液Enzyme Mix用量n*13uln*2ul计算好各试剂的使用量,加入到一适当体积试管中,充分混匀均匀后2000*g离心10 秒,向各玻璃毛细管中分装15ul,转移至样本处理区。3. 加样(样本处理区)吸取10ul样本处理步骤1。2。13中收集得到的RNA溶液及HCV定量标准品分别 加入到上述反应管中(空白对照直接加入10ul洗脱液),盖紧反应管管盖,连同Roche 专用金属反应管套放在离心机中,于2000*g离心10秒,将毛细管转移到检测区。将 毛细管排放好放入荧光PCR检测仪内,记录样本摆放顺序.4。 RTPCR反应(检测区)4

11、.1 循环条件设置ProgramCyclesTemperature摄氏度IncubationTime(min:sec)Temperature Transition Rate( 摄氏度/sec)Acquisitio n ModeAnal ysisMod e115030:0020NoneNon e219515: 0020NoneNone3459500: 0520NoneQua5000: 3020Singlentifi7200: 2010Nonecation反应体系为25ul。具体设置方法请参照各仪器使用说明书。4.2 仪器检测通道选择选择F1检测通道:HCV内对照(IC)选择F2检测通道。4.3

12、样本的设定在扩增开始前条件设定时,将HCV定量标准品设为“Standard”并输入试剂盒内 给定浓度值,待检样本和对照品设定为Unknown”。结果分析条件设定1. 对HCV的曲线和HCV内对照(IC)的曲线进行分别分析。2. 分析方式选择Fit Points,基线调整选择Arithmetic,阈值(threshold)设定原则以 阈值线刚好超过正常HCV阴性对照曲线的最高点,且正常HCV阴性对照病毒滴度 为 0。 0IU/ml 为准.具体设置方法请参照各仪器使用说明书。质控标准1. 将HCV定量标准品1-4的浓度值输入,仪器将自动以HCV定量标准品的浓度值为横 坐标,以其实际测得的外标 Ct

13、 值为纵坐标给出标准曲线,标准曲线的拟和度绝对值 应大于等于0980,四个HCV定量标准品的Ct值都应V38.0,否则视为定量结果无效。2. HCV阴性对照、空白对照HCV RNA应为0.0IU/ml; HCV强阳性对照HCV RNA应 为 5。0E+O51。0E+07IU/ml;HCV 临界阳性对照应为 1。0E+031.0E+05 IU/ml; 且HCV阴性对照、HCV临界阳性对照中HCV内对照(IC)的Ct值都应小于等于33,否则此次实验视为无效。所有实验从样本处理开始重做。结果判断1. 检测样本中1.0E+03 IU/ml小于等于HCV RNA小于等于5。0E+07 IU/ml,测定结

14、果 有效,可直接报告相应的浓度值.2. 检测样本中HCV RNA大于5.0E+07 IU/ml,可按实际测得值报告相应的病毒滴度,亦 可将该样本用正常人血浆按10倍梯度稀释到本试剂盒定量检测线性范围内后重新测 定,测定结果应以稀释倍数进行校正。3. 检测样本中0.0IU/ml小于HCV RNA小于1。0E+03 IU/ml,且HCV内对照(IC)的Ct值都应小于等于33,表明病毒载量较低,可直接报告浓度值,但注明该病毒滴度 量仅供参考。4. 检测样本中HCV RNA等于0.0IU/ml,且HCV内对照(IC)的Ct值都应小于等于33, 应报告为小于试剂盒最低检测限。5. 检测样本中HCV内对照(IC)的Ct值大于33或Ct值为无数值,且HCV RNA小于 等于1。0E+03 IU/ml(包含 0.0IU/ml或无数值)时,则此样本的定量结果视为无效,应 查找并排除原因,并对此样本进行重复实验。

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