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1、生物信息学实验教学大纲全套课程名称（中文）：生物信息学课程名称（英文）:Bioinformatics课程编号：课程性质：非独立设课课程属性：专业课教材及讲义：自编学时学分：总学时36总学分 1实验学时12实验学分0.5应开实验学期：四年级第一学期适用专业：生物医学工程系先修课程：计算机应用基础等一、课程简介及基本要求生物信息学实验以生物信息学理论课为基础，涵盖了世界上权威的核酸和蛋白质数据库以及常用软件的使用；同时结合生物医学工程专业的学生的特点，增加了算法的相关内容，构成一个完整的、对生物医学工程专业有针对性的课程体系。二、课程实验目的和要求生物信息学实验的目的主要是使学生在了解生物信息学算
2、法理论的基础上，对现有的权威数据库和常用的分析软件有一定的认识，把生物信息学的理论与自身的专业紧密结合，培养有自己专业特色的应用能力。生物信息学实验的要求主要是了解生物信息学的算法，以及在算法理论的基础上对常用数据库和软件的使用。三、适用专业生物医学工程。四、主要仪器设备计算机五、实验方式与基本要求1 Genbank，EMBL，DDBJ数据库的使用（3学时）。熟悉Genbank、EMBL、DDBJ数据库的建库原则、数据结构、具体的查询方式和结果分析。2 SWISSPROT和PROSITE数据库的使用（3学时）熟悉蛋白质一级数据库SWISSPROT和二级数据库PROSITE的建库原则、数据结构、
3、具体的查询方式和结果分析3 BLAST和检索工具Entrez和SAS（3学时）熟悉BLAST的使用方法，掌握BLAST的结果分析。了解Entrez和SAS的界面和查询方式。4 ExPASY（蛋白质专家分析系统）和蛋白质预测工具（3学时）了解ExPASY的总体结构，掌握常用的预测工具的适用范围、使用方法和结果分析。六、考核与报告七、实验项目设置与内容序号实验名称内容提要实验学时每组人数实验属性实验者类别开出要求1Genbank，EMBL，DDBJ数据库的使用熟悉Genbank、EMBL、DDBJ数据库的建库原则、数据结构、具体的查询方式和结果分析。31综合本科生必做2SWISSPROT和PROSITE数据库的使用熟悉蛋白质一级数据库SWISSPROT和二级数据库PROSITE的建库原则、数据结构、具体的查询方式和结果分析31综合本科生必做3BLAST和检索工具Entrez和SAS熟悉BLAST的使用方法，掌握BLAST的结果分析。了解Entrez和SAS的界面和查询方式。31综合本科生必做4ExPASY（蛋白质专家分析系统）和蛋白质预测工具了解ExPASY的总体结构，掌握常用的预测工具的适用范围、使用方法和结果分析。31综合本科生必做八、说明
