中南大学医学信息检索(医学信息专业四年制适用)教案第4章外文数据库检索

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1、科目:文献信息检索 任课教师姓名:黄碧云授课对象:本科生 专业:医学信息学 学年制:4年 年级:2007级 人数:56 次数:1次授课章节、内容:第四章 外文数据库检索(上)授课时数:405分钟 学时:9学时 【目的与要求】1. 了解OVID、OCLC FirstSearch等全文数据库;2. 熟悉Medline和如何获取全文数据库中的文献;3. 熟悉PubMed的各种检索方法;4. 掌握针对具体课题利用PubMed进行检索。【重点】1. Medline和PubMed的检索;2案例教学【难点】1. PubMed基本检索;2. 利用PubMed如何有效地查找文献。【板书设计的要求】第四章 外文数

2、据库检索第一节 Medline与PubMed一、MEDLINE概述二、PubMed概述三、PubMed检索途径与方法四、PubMed检索实例五、PubMed检索相关问题六、如何有效地利用PubMed查找所需文献 第二节 外文全文数据库检索一、概述二、OVID三、Kluwer Online Journals四、OCLC FirstSearch五、如何获取全文数据库中的文献第三节 案例教学案例:鸡卵黄免疫球蛋白应用于常见寄生虫病免疫学诊断的研究教学教具 多媒体教学课件 详细教案第四章 外文数据库检索第一节Medline与PubMed一、MEDLINE概述v 外文文摘数据库检索 Medline与Pu

3、bmed, EMBASE, SciFinder Scholar, BioSIS Previews, Engineering Village, Dialogv 外文全文数据库检索OVID Full Text, EBSCOhost, Elsevier SDOS, SpringLink, ProQuest Medical Library, Kluwer Online Journals ,OCLC FirstSearchMedline:1.书目数据库: NLM, 最重要2.来源:5200+期刊(LSTRC), 90%英文,涉及医学各领域3获取:印刷型检索工具:Index Medicus(Cumulat

4、ed Index Medicus, CIM), Index to Dental Literature, International Nursing Index光盘检索: 1980s至今; SilverPlatter Medline on CD(银盘)网络检索:多种检索系统(OVID、Cambridge、Dialog);免费(PubMed、Gateway)二、PubMed概述1. Pubmed的文献来源v Medlinev In-process citationsv Publisher-Supplied Citations2. PubMed记录的字段v 可供检索和显示的字段共40多个MEDLIN

5、E格式MESH字段举例:Breast Neoplasms 三、PubMed检索途径与方法v 基本检索v 高级检索:Advanced Searchv 其他:Pubmed Tools,Pubmed Resources1基本检索: 检索方法(规则)v 不区分大小写v 逻辑组配检索 (1) NOT ,AND, OR (2)不输入默认为AND (3)字段检索举例:查找入学前儿童的哮喘治疗的(4)日期检索格式:YYYY/MM/DD date fieldv 2009/10/06 edatv 2008 dpv 2008:2010 dpv 2009/01:2010/03 edat(5)子集检索sbv topic

6、v citation status v journal/citationv 其它Topicsv AIDS v Bioethics v Cancer v Complementary Medicine (CAM)v History of Medicine v Space Life Sciences v Systematic Reviews v Toxicology 举例: Asthma AND systematicsb 1777篇Citation Statusv publisher v in process v medline v oldmedline v pubmednotmedline 举例:

7、v N engl j med AND medlinesb 60997篇Journal/Citation Subsets举例v P53ti AND jsubsetAIM 1245 篇其他v p53ti AND pubmed pmcsb 2183篇 v free full textsb p53ti AND free full textsb 7103篇v Ahead of Print Citations Pubstatusaheadofprint AND p53ti 167篇(6)自动词语匹配检索v automatic term mapping:输入未加任何限定的检索词时,系统依次在下表中进行匹配、

8、转换和检索: MeSH translation table,Journals translation table,Full Author translation table, Author index,Full Investigator (Collaborator) translation table,Investigator (Collaborator) index. 如无匹配,则将词语拆分再依次在上述表中进行检索;仍无匹配,则在所有字段中查找拆分的单个词并以AND进行组配检索。举例:liver cancer AND gene therapy 2744篇(7)精确短语检索:使用引号举例:“l

9、iver cancer” 6987篇 liver cancer 146836篇 (8)截词检索:加*(截取前600个截词) 举例:Immun*(9)著者检索姓在前用全称,名在后用首字母,举例: Smith jQ:如何查询著者Yang发表的论文?Yang Yin-Yangmh OR YangTW 用:YangAU (10)limitsv Q:利用基本检索时,如果要作一些限定,如何实现?(举例:检索“颅脑外伤对青少年及儿童生长激素的影响”) 2高级检索3其他v Journals Database(查询期刊信息并检索)v MeSH Database(获取主题词信息并检索) v Single Cita

10、tion Matcher (从文献外表特征查找单篇或一组论文)v Batch Citation Matcherv Clinical Queries(临床文献查询)v Topic-Specific Queries v Linkout(外部链接)v Clinical Trials举例:查找夏家辉教授发表在“Nat Genet,1998;20(4):370-3”的关于神经性耳聋基因的论文及相关信息Clinical Queries:检索临床研究方面的课题v 按临床问题分类检索v 可以根据需要选择检索文献更多一些或更少一些MeSH Databasev Q:如何利用MeSH Database 查询“颅脑外

11、伤对青少年及儿童生长激素的影响”相关文献? 选择Search Box with AND进行检索四、PubMed检索实例1输入提问检索结果:SummarySummaryv 提供的信息:TI,AU,SO + 链接(Related articles+Full text)v 三个细节:Filter your results;Find related Data;Search details如何转换显示格式?v 选择文献Display settingsv 直接点击文献标题2 Display settings:AbstractAbstract:MESH和LinkoutAbstract:全文链接+相关文献+引

12、用+其他链接Q:如何获取更详细的信息?Display Settings: MEDLINE格式3结果输出:send to4获取全文五、PubMed检索相关问题Q1:如何显示系统转换后的详细检索策略?Summary格式:search detailsQ2:如何一次检索多个数据库?选择:all databases统一检索界面NLM Gateway(http:gateway.nlm.nih.gov)Q3:从我校医学图书馆检索PubMed有何差别?Q4:利用其他系统检索MEDLINE和PubMed检索MEDLINE有差别吗?主要差别v 费用: 免费:PubMed,gateway 收费:OVID、First

13、Search、WOK、 EMBASEv 可检数据库v .检索界面v 检索功能自动词语匹配(PubMed 、Gateway、EMBASE)v 获取全文Q5:如何在PubMed中得到个性化服务?可在主页选择其他数据库检索My NCBI六、如何有效地利用PubMed查找所需文献1. 选择最准确的提问词v 例1:如何查找IFN-的相关文献? 2 选择最合适的检索功能例2:疯牛病的流行病学研究例3: 多奈哌齐(Donepezil) 治疗阿尔茨海默病(Alzheimer Disease)的预后和系统评价的文献例4:性腺淋巴瘤与Fas、Fasl的关系 3. 调整检索策略v 检出文献过少扩大检索v 检出文献过

14、多缩小检索扩大检索v 利用“自动转换检索词”特性v 增加相关词(增加OR组配面)v 减少AND组配面v 扩展检索v 采用截词v 举例:白血病患者锌、铁、铜等微量元素的变化缩小检索v 采用主题词v 采用专指词v 字段限定v 增加AND组配面v 用NOT排除次要概念v 外表特征限定v 自由词检索用引号举例:查找细胞死亡相关文献 第二节 外文全文数据库检索一、概述OVID Full Text, EBSCOhost, Elsevier SDOS, SpringLink, ProQuest Medical Library, Kluwer Online Journals,OCLC FirstSearch二、OVID 1检索界面: Basic Search2检索文献题录McCaffer

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