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1、PFAFFL Method for real time PCR简介:荧光定量PCR方法:用于相对定量。适用条件:目标基因与内标基因扩增效率相差较大,特别适用于国内习惯于将内标与目标分开扩增。优点:不需要标准曲线,结果比delta-delta-Ct法更加精确。缺点:需要知道在Ct值处的扩增效率,好在OM3已经可以提供该值。数学推导:M01:处理1目标基因初始拷贝数 Mn1:处理1目标基因n次循环后拷贝数M02:处理2目标基因初始拷贝数 Mn2:处理2目标基因n次循环后拷贝数N01:处理1内标基因初始拷贝数 Nn1:处理1目标基因n次循环后拷贝数N02:处理2内标基因初始拷贝数 Nn2:处理1目标
2、基因n次循环后拷贝数EM:目标基因扩增效率 EN:内标基因扩增效率CtM2:处理2目标基因的Ct值 CtM1:处理1目标基因的Ct值CtN2:处理2内标基因的Ct值 CtM1:处理1内标基因的Ct值目标基因扩增结果:Mn2=M02(1+ EM)nMn1=M01(1+ EM)n将Ct带入:Mct2=M02(1+ EM)CtM2=A(域值)Mct1=M01(1+ EM) CtM1=A(域值)两式相除得:M02/M01=(1+ EM) CtM2CtM1 1同理得:N02/N01=(1+ EN) CtN2CtN1 2两个处理的目标基因相对表达量为:(利用1式和2式)(M02/N02) :(M01/N01)=(1+ EM) CtM2CtM1/(1+ EN) CtN2CtN1