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一种基于仿真的预测癌细胞致死基因的 方法许扬郑浩然中国科学技术大学计算机科学与技术学院摘要:冃的癌细胞致死基因的研究是治疗癌症的重要尝试,其发现依赖于生物学上的 基因敲除实验。鉴于此类实验的高代价、长周期等不足,本文给出一种基于计算 机仿真的预测癌细胞致死基因的方法,旨在运用计算机仿真技术预测对癌细胞 研究有价值的信息,为基因敲除的牛物实验提供线索,帮助降低实验成本。方法 计算机仿真实验基于人类全基因组代谢网络,融合癌细胞的基因表达数据,用 一种基于约束建模的方法,以预测癌细胞代谢网络中有活性的反应,并将这些 反应命名为“core Teactions”,将4Uthresholfl,则将基因i标记为1;反之,如果在超 过半数的样本中,基因i都表现出gXL.u-esHoK.,则将基因i标记为除此之外 的所有基因均标记为0o第二步,将基因的表达状态