基因工程的下游技术 重组蛋白的表达、纯化和分析,重组蛋白的表达 表达体系: 表达载体 原核 受体细胞 真核,选择表达载体常用的关键元件: 启动子和调节序列(表达强弱、细胞或组织特异性、表达调节等,如本实验的乳糖操纵子 融合基因(纯化、标签,或增强蛋白可溶性等如多聚His标签6His,便于镍柱亲和层析纯化GST融合蛋白用GST柱亲和层析) 分泌信号 筛选标记 其它,6His,重组蛋白的纯化 亲和层析 离子交换层析 凝胶过滤层析 ,本单元实验流程: 细菌(pEF-GFPuv),亲和层析,IPTG诱导,细菌总蛋白,重组蛋白融合蛋白,乳糖操纵子的特性,SDS-PAGE,初步分析,实验十 重组DNA在大肠杆菌中的诱导表达,实验目的 实验原理 材料与试剂 实验仪器 操作步骤 注意事项 实验安排 思考与讨论,实验目的 了解和掌握IPTG诱导表达的原理 了解降解物阻遏的现象及其机理实验原理 操纵子是基因表达的协调单位通常由2个以上功能相关的结构基因以及一些调节序列(如启动子序列、操纵序列等)组成 乳糖操纵子由三个结构基因Z、Y、A和操纵序列、启动子、CAP结合位点等调节序列组成乳糖操纵子的诱导表达 当没有乳糖存在时,调节基因lacI表达,转录的mRNA翻译成阻遏蛋白。
阻遏蛋白与操纵序列lacO结合,阻碍了结合在旁边启动子的RNA聚合酶向前移动,使结构基因不能转录,也就不能翻译出蛋白质也就是说,当没有乳糖存在时,乳糖操纵子处于阻碍状态乳糖操纵子的诱导表达(续) 当有乳糖存在时,乳糖转化为异乳糖,异乳糖作为诱导物与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白的构象发生改变,而不能结合到操纵序列上,RNA聚合酶可以从启动子向3端移动,于是,结构基因可以转录出mRNA,然后翻译出蛋白质也就是说,当有乳糖存在时,乳糖操纵子被诱导 乳糖操纵子的诱导物是异乳糖IPTG是异乳糖的结构类似物由于IPTG不会被分解,它的诱导作用是持久的乳糖操纵子的诱导表达(续) 本实验所使用的表达载体上含有乳糖操纵子的调节序列,目的基因为绿色荧光蛋白基因在IPTG的诱导下,目的基因表达可增强105倍然而,诱导表达常常受到温度和诱导物的影响乳糖操纵子的降解物阻遏 当细菌在含有葡萄糖和乳糖的培养基中生长时,通常优先利用葡萄糖,而不利用乳糖只有当葡萄糖耗尽后,细菌才能充分利用乳糖,这种现象称葡萄糖效应,其实质是由葡萄糖降解物引起的阻遏作用,所以又称降解物阻遏(catabolic repression)乳糖操纵子的降解物阻遏(续) 降解物阻遏的机理:代谢物基因激活蛋白(Catabolite gene Activation Protein,CAP),又称cAMP受体蛋白(cAMP Receptor Protein,CRP)属于激活蛋白的一种,对乳糖操纵子进行正调节。
CAP分子内分别有DNA结合区和cAMP结合区当CAP与cAMP结合后,就可结合到CAP结合位点上,促进转录 葡萄糖降解物能抑制腺苷酸环化酶的活性,并活化磷酸二酯酶的活性,从而降低cAMP的浓度,抑制转录阻遏蛋白负调节与CAP正调节的协调 当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能发挥作用;而没有CAP存在时,即使没有阻遏蛋白与操纵序列结合,操纵子仍无转录活性只有在CAP存在且没有阻遏蛋白与操纵序列结合时,或者说只有高乳糖低葡萄糖时,操纵子发挥最大转录活性 这种协调与细菌对碳源的优先利用相一致The structure of lac operon,调节序列,结构基因,Repressor and negative regulation,异乳糖,异丙基硫代半乳糖苷,异乳糖,CAP and positive regulation,低乳糖时,高乳糖时,在协调调节下,lac operon的强诱导作用发生在高乳糖、低葡萄糖的状态材料与试剂 材料 含pUC18质粒工程菌及含pGFPuv质粒工程菌 试剂 LB 液体培养基 : 蛋白胨(tryptone)10g、酵母粉(yeast extract)5g、NaCl 10g,加800mL双蒸水溶解,用10M NaOH调pH至7.2-7.5,定容至1000mL。
分装,高压灭菌,4保存氨苄青霉素溶液: 无菌双蒸水配成100mg/mL,分装,-20保存,使用终浓度为50g/mL或100g/mL IPTG溶液: 将238.3mg IPTG溶解于10mL双蒸水,0.22m细菌滤器过滤除菌,分装,-20保存备用,贮存浓度为100 mM 20%葡萄糖溶液: 20g葡萄糖溶解于适量双蒸水,定容至100mL,121,15min 灭菌,4保存实验仪器 超净工作台、 恒温摇床、离心机等操作步骤 挑取含pUC18质粒工程菌及含pGFPuv质粒工程菌单菌落,分别接种于含氨苄青霉(终浓度为100g/mL,以下同)的5mL的LB培养基中,于37、250rpm过夜培养12h-14h至对数生长期 取3支已灭菌的大试管,分别加入5mL含有氨苄青霉素的LB培养液,编号为1#,2#,3#,另取一个250mL的灭菌三角瓶,编号为6#,加入50mL含氨苄青霉素的LB培养液1#:接50L空载工程菌(含pUC18)过夜培养物,25-28培养10 h-12h; 2#:接50L重组菌(含pGFPuv)过夜培养物,25-28培养10 h-12h; 3#:接50L重组菌(含pGFPuv )过夜培养物,37培养至O.D600约为0.5(约3h-4h),然后加入20%葡萄糖50L至终浓度为0.2%,及100mM IPTG 5L至终浓度为0.1mM,25-28培养8h-10h或过夜; 6#:接500L重组菌(含pGFPuv)过夜培养物,37培养至O.D600约为0.5(约3h-4h),然后只加入100mM IPTG 50L至终浓度为0.1 mM,25-28培养8h-10h或过夜。
4. 收集菌体分别将1#-3#全部培养物收集到三个7mL离心管中,编上相应编号,离心弃上清;三角瓶培养的50mL菌液混匀后取5mL于7mL离心管中(编号为4#),离心,上清收集到另一个指管,编号为5#,其余的培养液用 50mL离心管于5000rpm,4,离心10min,弃上清,菌体用裂解缓冲液重悬后用超声波破碎细胞或保存于20备用(见实验十二) 5. 于紫外灯下观察1# -5#管收集的菌体或上清液,观察哪支管有荧光,记录观察到的现象 注意:把1#和2#管置4保存分别标Sample1和Sample21,2,3,6,pUC18,pGFPuv,挑取单菌落,接种于5mLLBA培养基中37过夜培养按1:100接种,对照,IPTG+Glc,IPTG,1,2,3,6,1,2,3,4,5,25 -28培养过夜,5000rpm离心,收菌体,取5mL离心,其余离心收菌体,提取蛋白,注意事项 本实验的目的是比较该重组DNA在大肠杆菌中表达时受IPTG和葡萄糖存在的影响在转管培养及收菌时要注意各管编号要相应对好,不能混乱 1#、2#管不加IPTG和葡萄糖3#管除加IPTG外还加入葡萄糖(浓度要大于0.2%以上)。
6#瓶仅加IPTG 不同的重组DNA在不同的宿主菌中蛋白的表达量往往受到IPTG浓度和培养温度的影响在科研中一般都采用不同温度或不同浓度的IPTG来诱导,以获得最大的蛋白表达量 本实验所表达的绿色荧光蛋白基因,其产物在大肠杆菌中有很强的荧光离心后收集的菌体在紫外线的照射下可见黄绿色荧光,所以把1#、2#、3#、4#沉淀菌体放在紫外灯下观察其是否有荧光以及荧光的强弱,就可判断其是否有表达及其所表达的强度实验安排 第一天: 上午配试剂,灭菌; 下午开始接种,约3 h-4h后开始诱导步骤2、3) 第二天: 收菌、紫外观察结果和拍照; 破碎细菌,分离上清,待过柱思考与讨论 对紫外灯下观察到的结果作出解释 为什么诱导表达的大肠杆菌要在其OD600浓度约为0.5时加入IPTG? 大肠杆菌的诱导表达常受哪些因素的影响?,实验十二 金属鳌合亲和层析分离目的蛋白质,实验目的 实验原理 材料与试剂 实验仪器 操作步骤 注意事项 实验安排 思考与讨论,一实验目的 学习亲和层析的原理 掌握亲和层析法分离蛋白质的技术与操作实验原理 以普通凝胶作载体,连接上金属离子制成螯合吸附剂,用于分离纯化蛋白质,这种方法称为金属螯合亲和层析。
蛋白质对金属离子具有亲和力是这种方法的理论依据已知蛋白质中的组氨酸和半胱氨酸残基在接近中性的水溶液中能与镍或铜离子形成比较稳定的络合物,因此,连接上镍或铜离子的载体凝胶可以选择性地吸附含咪唑基和巯基的肽和蛋白质过渡金属元素镍在较低pH范围时(pH 6-8),有利于选择性地吸附带咪唑基和巯基的肽和蛋白质在碱性pH时吸附更有效,但选择性降低 金属螯合亲和层析在很大程度上,由被吸附的肽和蛋白质分子表面咪唑基和巯基的稠密程度所支配,吲哚基可能也很重要 用IPTG诱导表达的蛋白质含有特定的组氨酸标签,这种可溶性蛋白质能用金属亲和层析法进行分离,且操作简单,快速,纯化效率高材料与试剂 材料 含pUC18质粒工程菌及含重组pGFPuv质粒工程菌经诱导表达的细胞裂解蛋白 试剂 0.05mol/L EDTA-0.5mol/L NaCl溶液 50mL 2mol/L NaCl 溶液 50mL 1mol/L NaOH溶液 50mL 0.2mol/L NiSO4溶液 30mL,起始缓冲液:50mmol/L Tris-HCl; 500mmol/L NaCl; pH7.0 500mL Chelating Sepharose Fast Flow 4-5 mL 大肠杆菌细胞裂解蛋白样品 10-20mL 洗涤液:50mmol/L咪唑;50mmol/L Tris-HCl; 0.5mol/L NaCl,pH 7.0 洗脱液:300mmol/L咪唑;50mmol/L Tris-HCl;0.5mol/L NaCl,pH7.0,实验仪器 1.5cm X 50cm层析柱、自动分部收集器、紫外分光光度计、紫外检测仪及记录仪等。
操作步骤 样品的制备: 细胞的培养及荧光蛋白表达见实验十,细胞的破碎及蛋白的收集如下: 收集在25培养的细胞培养液,5000r/min,离心10min,去上清液,菌体用起始缓冲液洗涤一次,离心收集菌体,用三分之一(细胞培养液)体积(15mL)的起始缓冲液充分悬浮,冰浴下进行超声波处理,功率为400W,工作4秒,间隙4 秒,为一次,99次为一周期共处理六周期然后8000r/min,离心30min,取上清液放冰箱备用亲和层析柱的安装 把层析柱固定在铁支架上,柱下端出口封闭加入少量的无离子水,排去下端的空气泡取出20%乙醇浸泡的螯合凝胶4mL到烧杯中,加入少量的无离子水制成糊状,沿着贴紧柱内壁的玻璃棒把糊状凝胶倒进柱内,打开下端的排水口,让亲和凝胶剂随水流自然沉下亲和层析剂为4-5mL亲和凝胶的再生处理: 用10 倍柱体积的再生溶液(0.05mol/L EDTA、 0.5mol/L NaCl)过柱,流速3mL/min1drops/2s! 用5倍柱体积的2 mol/L NaCl 溶液洗亲和层析柱除去多余的EDTA流速3mL/min 用5倍柱体积的1 mol/L NaOH溶液洗涤层析柱,流速2mL/min。
用10倍柱体积的无离子水洗至pH8-9,流速3mL/min 用2倍柱体积的0.2mol/L的硫酸镍溶液过层析柱,使凝胶金属镍离子结合, 流速2mL/min过完后放置5 分钟 用10倍柱体积的无离子水洗涤层析柱除去多余的镍离子流速3mL/min 用5 倍柱体积的起始缓冲溶液平衡层析柱,备用上样: 先从15mL裂解上清液中取出50L准备用于电泳,作为亲和层析分离前上清液中的总蛋区带对照图谱(Sample3)然后以每分钟1mL的流速上层析柱,分部收集流出液,每管3mL,(测得的OD280值曲线为穿流峰,取最高的一管样品液用作。