α helix: α螺旋,蛋白质中一种螺旋形的二级结构α-amanitin:α鹅膏蕈碱,一种能不同程度地抑制三种真核生物RNA聚合酶的毒素β-galactosidase::β-半乳糖苷酶,将乳糖分解为半乳糖和葡萄糖的酶β sheet:β折叠,蛋白质的一种二级结构,相对平坦,在两条平行的或反向平行的肽段之间形成氢键σ subunit:σ亚基,原核生物RNA聚合酶全酶的组成成分在启动子识别中需要ρ-dependent termination:ρ依赖型终止,原核生物中的一种转录终止方式,依赖于ρ蛋白和DNA/RNA序列引起转录终止─10 box:─10框,大肠杆菌中常见的启动子元件由于它位于转录起始为点上游约10个碱基处而得名3’g5’ exonuclease activity:3’g5’外切核酸酶活性,DNA聚合酶的活性允许在聚合反应后以3’g5’方向去除不正确的核苷酸30nm fiber:30nm纤维,一种染色质的高级结构其延长的结构宽度大约是30nm30S initiation complex:30S起始复合体,是原核生物中由mRNA、30S核糖体亚基和起始tRNA在起始密码子位置组成的复合体。
─35 box:─35框,大肠杆菌中常见的启动子元件由于它位于转录起始为点上游约35个碱基处而得名5’g3’ exonuclease activity:5’g3’外切核酸酶活性,原核生物中DNA聚合酶I的一种功能允许以DNA合成方向去除核苷酸常在去除RNA引物中使用5-bromouracil (BU):5-溴尿嘧啶(BU),具有诱变性的碱基类似物与胸腺嘧啶相似,但很容易转换成与鸟嘌呤配对的互变异构形式带有溴基团的结构与尿嘧啶相似A (aminoacyl) site:A(氨酰基)位,带有新氨基酸的tRNA与核糖体结合的第一个位置AgI editing:AgI编辑,真核生物中对mRNA进行转录后修饰的一种形式,修饰时将腺嘌呤脱氨基形成次黄苷,次黄苷是一种非普通碱基Acetylation:乙酰化作用,将一个乙酰基加到某个分子上的过程Aconitase:顺乌头酸酶,调控铁代谢的蛋白质分别控制运铁蛋白和铁蛋白的稳定性和可转译性Activators:激活蛋白,促进基因转录的蛋白质Active site:活性位点,酶分子中直接负责催化反应的位点Affinity chromatography:亲和层析,柱层析技术的一种。
柱中用能与一组特殊的蛋白质结合的分子填充Alkyl group:烷基,由碳和氢组成的一类化学基团Alleles:等位基因,相同基因的不同版本,它们之间在功能和序列上稍有不同Allosteric regulation:别构调节,调节的一种形式,通过一个小分子结合到蛋白质的调节位点而引起其活性位点结构和功能的改变Alternative polyadenylation:可变聚腺苷酸化,通过改变前体mRNA的切割位点和聚腺苷酸化位点而从一个编码区产生不同大小mRNA的能力能改变蛋白质分子的大小和mRNA的性质(如稳定性)Alternative splicing:可变剪接,通过选择包含或不包含某些内含子和外显子而从一个编码区产生不同蛋白质的能力Ames test:埃姆斯测验法,用来评价化学物质是否具有潜在诱变性的技术Amino acids:氨基酸,能聚合形成蛋白质的小分子名称来自于它们所带的氨基以及酸性的羧基Amino group:氨基,由氮原子与两个氢原子结合形成的化学基团Aminoacyl-tRNA synthetase:氨酰-tRNA合成酶,一种将tRNA与正确的氨基酸匹配的蛋白质名称来源:酶合成了将氨基酸连接到tRNA上去的酰基。
Anticodon:反密码子,tRNA上能与一个或多个密码子结合的三碱基序列Anti-parallel:反向平行的,两条平行但方向相反的链常用来描述DNA分子中的链相对于各自的方向Ara operon:ara操纵子,含有阿拉伯糖代谢基因的操纵子Attenuation:衰减作用,trp操纵子中用于确保当色氨酸存在时基因不被转录的一种机理Attenuator:衰减子,紧接在trp操纵子的启动子之后转录出来的序列,对衰减作用机理很重要能形成终止型发夹结构而使在操纵子进行的转录停止AU-rich element (ARE):富含AU元件(ARE),在调节mRNA稳定性中起作用的一些真核生物mRNA 3’UTR序列因序列中含有许多A和U而得名Autonomously replicating sequence (ARS):自主复制序列(ARS),酵母中的一种复制起点名称来源:含有此序列的DNA片段即使不是染色体的一部分也能够自主地进行复制Basal transcription:基础转录真核生物中如果只有前起始复合体存在(没有激活蛋白)的情况下所发生的低速率的转录Base analogues:碱基类似物,结构上与DNA碱基类似的分子,能被整合到DNA中。
Base excision repair (BER):碱基切除修复(BER),DNA损伤修复途径,通常用来修复DNA碱基的普通损伤Base pair:碱基对,通过氢键结合在一起的互补的核苷酸常用来度量DNA的长度Base-stacking:碱基堆积,用来描述DNA分子中碱基排布位置的术语碱基对一个接一个地平放在平行的平面上,产生一种它们是‘堆放’在那里的印象Beads-on-a-string:线珠结构,用于描述DNA组织最低一级水平的术语核小体由裸露的DNA片段连接在一起Bi-directional replication:双向复制,用来描述DNA复制从复制起点开始沿两个相反的方向进行的术语Branch migration:分支迁移,指Holliday交叉的移动,它会引起同源染色体不同区段之间发生杂交CgU editing:CgU编辑,一种形式的真核生物转录后修饰作用,修饰时将胞嘧啶脱氨基形成尿嘧啶Capping:加帽,将鸟嘌呤核苷的衍生物加到前体mRNA 5’端上去的转录后修饰作用Carboxyl group:羧基,一个碳原子连接到两个氧原子上形成的酸性化学基团Catabolite activator protein (CAP):代谢物激活蛋白(CAP),原核生物中对葡萄糖/cAMP浓度进行响应而激活转录的蛋白质。
用于增强lac和ara操纵子基因的转录,产生的蛋白在分解代谢中起作用Chaperones:伴侣蛋白,帮助其它蛋白质折叠成正确结构的蛋白质Chromatin immunoprecipitation (ChIP): 染色质免疫沉淀法(ChIP), 一种免疫共沉淀技术,用于检查特异DNA序列与特异蛋白质之间的结合Chromatin remodeling proteins: 染色质重塑蛋白, 改变组蛋白与DNA之间结合方式的蛋白质,是一种调控转录的方式Clamp loader: 滑行夹加载器, 由真核生物DNA聚合酶的一部分亚基组成的将滑行夹套到DNA上去的装置Co-immunoprecipitation (CoIP): 免疫共沉淀法(CoIP), 一种检查某种蛋白质是否与其它蛋白质或其它分子结合的技术蛋白质的免疫沉淀采用抗体进行任何与该蛋白结合的蛋白质也将被沉淀和鉴定出来Colonies: 集落, 平板上分开的细胞群体理论上说,一个集落中的所有细胞是完全相同的,因为它们都是一个细胞的后代Column chromatography: 柱层析, 使蛋白质穿过层析柱而对它们进行纯化的一套综合技术蛋白质的性质和层析柱的性质决定了蛋白质流出柱子的不同时间。
Complementary: 互补的, 用来描述能互相配对的碱基的术语Conformation: 构象, 作为‘结构’的同义词在与蛋白质有关的表述中使用Consensus sequence: 共有序列, 一个序列元件的最有可能出现的序列在日常英语中,‘consensus’指每个人都同意某件事Conservative replication: 保留复制, 一种复制模型,认为复制产生一个全新的DNA分子,而亲本DNA分子保持不变Conservative transposition: 保守型转座, 一种转座类型,转座时转座子从它的原始位置离开并插入到一个新的位置中Constitutive: 组成型的, 是生物学常用词,表示‘总是’或‘不停的’组成型lac操纵子突变体在任何条件下都一直转录lac操纵子基因Coordinate regulation: 协同调控, 一组基因在一起进行调控的转录调控方式Core histones: 核心组蛋白, 在一起形成核小体核心的组蛋白Co-repressor: 辅阻遏物, 结合到阻遏蛋白上使其产生阻遏活性的小分子Coupled transcription-translation: 偶联转录-转译作用, 当转录还在进行的时候发生的转译作用。
Covalent bond: 共价键, 两个原子共享电子形成的键Crossing-over: 交换, DNA区域在同源染色体之间发生交换的重组事件Cross-linking: 交联, 在DNA分子中位于相对链上的碱基之间形成的共价连接C-terminus: C末端, 多肽上含有羧基的末端Deamination: 脱氨基, 从一个碱基上去除一个氨基的过程在这里, Deletion: 缺失, 从DNA分子中去除碱基对的过程Denaturation: 变性, 大分子中非共价相互作用力的破坏导致三维结构改变的过程对DNA来说,变性涉及单链的分离对蛋白质来说,变性涉及多肽链的解折叠Density ultracentrifugation: 密度超速离心, 应用离心(快速旋转)根据密度对分子进行分离的技术在此技术中,离心速度是非常非常快的Deoxyribonucleases (DNase): 脱氧核糖核酸酶(DNase), 切割脱氧核糖核酸(DNA)的酶Deoxyribonucleic acid (DNA): 脱氧核糖核酸(DNA), 由脱氧核糖核苷酸聚合而来的核酸Deoxyribonucleotides: 脱氧核糖核苷酸, 与核糖核苷酸类似的核苷酸,但它们缺少─OH基团。
Depurination: 脱嘌呤, 从DNA骨架上去除嘌呤碱基的过程Dideoxy method: 双脱氧法, 依赖于使用双脱氧核糖核苷酸进行DNA序列测定的技术Dideoxyribonucleotides: 双脱氧核糖核苷酸, 与核糖核苷酸类似的核苷酸,但它们缺少两个─OH基团Dimer: 二聚体, 由两个较小的分子组成的分子乳糖就是一个二聚体的实例,它是由葡萄糖和半乳糖组成的由两个亚基组成的蛋白质也可称为二聚体Diploid: 二倍体, 每个基因有两个拷贝的生物Direct repeats: 同向重复序列, 完全相同并以相同方向出现的序列Dispersive replication: 散乱型复制, 一种复制模型,认为亲本DNA成短片段状这些DNA片段被分散,子代DNA分子是由这些片段与新合成的片段连接而成的Disulfide bond: 二硫键, 在两个半胱氨酸的R基团(─SH)之间形成的共价键D-loop: D-环, 联会之后的同源重组过程中形成的结构一条染色体上的两条DNA链被分开,形成一个环状开口DNA gyrase: DNA旋转酶。