近年来,利用计算机进行文献检索已逐步代替传统的手工检索,随着Internet的普及,我们可以随时随地通过国际互联网来检索获得免费的医学文献,这是一条文献检索新捷径[1],特别是进行MEDLINE检索,既简单又实用[2]现在有多个机构提供免费的网上MEDLINE检索服务,其中由美国国立医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)建立的PubMed数据更新快[3],检索系统完善,深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎由于PubMed检索系统在不断完善和加强,要快速、全面、准确地在近4千种医学期刊、1千1百万条数据中检索出符合自己要求的资料[4],并不容易下面介绍最新版本(2000年9月版)的PubMed使用方法1. 进入PubMed 在浏览器的地址栏内输入Pubmed的网址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ 后按回车键,就进入PubMed的主页,开始检索2. 普通检索 在检索式提问框中输入一个或更多的词(例如:vitamin c common cold),然后按回车键或用鼠标点击"Go"按钮,PubMed就会利用"自动词语匹配"功能将重要的词或词组用"AND"组合在一起进行检索(见图1)。
输入的词可以是自由词、主题词、或其他指定字段由于主题词检索的文献更全面、更准确,应尽量使用主题词/副主题词检索对于某些新的技术词汇、新药、新方法、新疾病等,还没有相应的主题词时,应该用自由词检索3. 高级检索 使用逻辑词AND, OR, NOT(例如:vitamin c OR zinc)、指定文献记录字段名称检索、使用医学主题词(MeSH)/副主题词组配格式检索,如neoplasms/diet therapy[mh]不久返回检索结果,检索提问框仍出现在页面顶端,并显示您刚才输入的检索词您可以在提问框内、点击"Details"或"Limits"按钮再修改检索词3.1 PubMed检索规则和语法 ①布尔运算符AND,OR,NOT必须大写,例如,vitamin c OR zinc; ②PubMed从左至右进行布尔运算不过,你可以通过加圆括符改变运算顺序,如common cold AND (vitamin c OR zinc)括弧内的字段是作为一个整体来处理的 ③如果输入的字段含有主题词组,PubMed优先按词组检索如果不希望这样,应该加布尔运算符例如输入:air bladder fistula,PubMed会将"air bladder"作为词组。
此时应输入:air AND bladder AND fistula ④字段标记符(tag)使用规则:只能在词后加字段标记符,如:romatherapy [mh],必须用封闭的方括弧[ ],大小写和空格会被忽略,如crabs [mh] = Crabs[MH] ⑤日期格式:采用YYYY/MM/DD[DP]格式,如1998/03/06[dp],1999/10 [EDAT]月和日可以不写输入日期范围则用冒号连接,如1996:1998[dp],1998/01:1998/04[dp]日期字段标记符有3个:Date of Publication [DP] :出版日期Entrez Date [EDAT] :进入PubMed的日期 MeSH Date [MHDA]:该引文被 MeSH 主题词编入索引的日期 ⑥期刊标记符有3个: jsubseta - Abridged Index Medicus 只检索《医学索引》的期刊jsubsetd - Dental 只检索《牙科文献索引》的期刊jsubsetn - Nursing 只检索《护理学索引》的期刊例如: neoplasms AND jsubseta ⑦检索须有摘要的文献,使用 "hasabstract"。
如: neoplasms AND hasabstract ⑧检索印刷前的引文,使用"pubstatusaheadofprint" 例如: pubstatusaheadofprint AND gene 3.2. PubMed的检索语法 检索语法格式是:检索词[tag] 布尔运算符 检索词[tag] 例如:要检索作者Dr. Crick在1993年撰写的关于DNA的文献,格式是:dna [mh] AND crick [au] AND 1993 [dp] 要检索关于热或潮湿与多发性硬化的关系,格式是:(heat OR humidity) AND multiple sclerosis 检索学龄前儿童哮喘治疗的英文综述文献,格式是: asthma/therapy [mh] AND review [pt] AND child, preschool [mh] AND english [la] 3.3 作者姓名检索 输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写,不用标点符号)的格式,例如SmithJAPubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写如果只输入作者的姓,PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索,但如果作者的姓是一个MeSH词的时候除外,例如输入Yang,则PubMed将只检索:Yin-Yang[MeSH]或Yang[Text Word]。
此外,如果使用双引号""将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来,并用作者检索字段标识符[au]限制,如"smith j"[au],PubMed将关闭自动截词,且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者3.4 期刊名检索 包括期刊名全称(如molecular biology of the cell)、期刊名MEDLINE缩写(如mol biol cell)、国际标准连续出版物号(ISSN,如1059-1524)例如,如果输入"New England Journal of Medicine",PubMed将按"N Engl J Med[ta]"查询应注意: ① 如果杂志名也是一个MeSH词,例如Gene Therapy, Science, 或 Cell,PubMed只会按MeSH词来检索,要想检索杂志名,必须加字段标记[ta],如 gene therapy [ta] ② 对一个单词的杂志名,也必须加字段标记[ta] ③ 尽量使用期刊名全称和期刊名MEDLINE缩写检索,在早期的文献中,ISSN号是不能保证检索完全的 ④ 如果杂志名带有参数或引号,应该去掉这些参数或引号,如:J Hand Surg [Am]应该以 J Hand Surg Am 键入。
3.5 截词检索 可以在词尾加*号,来检索有一样词头的所有词, 如输入 bacter*,则会检索 bacter, bacteria, bacterium, bacteriophage 等词,但不会检索带有空格的词组,如 bacteria controlPubMed只能检索前150个相符合的词此外,截词检索将关闭自动词语匹配功能,也不能进行扩展检索如:heart attack*不会匹配MeSH词,也不会扩展检索myocardial infarction、myocardial stunning、shock、cardiogenic这些方面的文献3.6 强制词组检索(规定Pubmed检索一个词组) 一般情况下,如果PubMed检索在常用词组列表中已有的词组,如poi-son ivy,PubMed就会把它作为一个词组来检索但有时Pubmed可能找不到相应的词组,如果输入的词组,在PubMed的词组表中没有时,PubMed 会拆分词组,如您输入:single cell,PubMed会分成 "single" 和 "cell" 分别检索,如要强制检索single cell,必须加双引号,使得PubMed将其当作一个词来进行检索,即写成 "single cell"。
需注意的是,使用双引号规定PubMed进行词组检索,PubMed就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能3.7 检索细节 点击Details按钮,可以查看和编辑检索情况,即可以增加或删除检索词,如图2 还可以从检索细节窗口保存检索项目:点击URL按钮后,用浏览器的书签(或收藏夹)菜单将目前的检索项目作为URL地址以书签形式保存,以便下次再检索4. 限定检索(Limits) 如图3,可以对多个选项限定检索,以缩小检索范围,提高检索准确率完成后将出现如图4的核对框,显示限定的字段限定字段检索的项目有:4.1 字段选择 可选择:所有字段(All Fields)、作者地址、作者姓名、期刊名、ISSN号码、语种、MeSH词、副主题词、页码、出版日期、自由词、标题词、期刊卷号、数据库更新代码、物资名称等22个选项,默认选项为All Fields4.2必须有摘要的文献(Only Items with Abstracts ) 为复选框,选中后检索出的文献均有摘要注意1975年前的文献是没有摘要的4.3 出版形式(Publication Types) 包括:Clinical Trial 临床试验Editorial 编辑按语Letter 读者来信Meta-Analysis 荟萃分析Practice Guideline 实践指南Randomized Controlled Trial 随即对照试验Review 综述4.4 出版语种(Languages ) PubMed 引用了近40种语言的期刊。
但下拉式菜单中只有最常检索的几种语言供选择:英语、法语、德语、意大利语、日语、俄语和西班牙语如您没有限制语言,PubMed会检索所有语种出版的文献语种的字段标记符一般取英文的前3个字母表示,如汉语为[chi],德语为[ger],但日语例外,为[jpn]4.5 年龄(Ages ) 可在下拉式菜单中选择其中一项All Infant: birth-23 month 出生到23月龄的婴儿All Child: 0-18 years 0~18岁的儿童All Adult:19+ years 所有成年人(19岁以上)Newborn: birth-1month 新生儿(出生到1个月)Infant: 1-23 months 婴儿Preschool Child: 2-5 years 2~5岁的学龄前儿童Child: 6-12 years 6~12岁儿童Adolescent: 13-18 years 青春期13~18岁Adult:19-44 years 19~44岁成年人Middle Aged:45-64 years 45~64岁Aged:65+ years 65岁以上80 and over: 80+ years 80岁以上4.6 性别(Gender)4.7 人或动物(Human or Animal) 4.8 子项(Subsets ) 包括:目前有9个数据库或过滤检索系统可选:AIDS、AIM、Dental、MEDLINE、Nursing、PreMEDLINE 、Publisher、PubRef、Toxicology。
其中MEDLINE, PreMEDLINE和出版商直接提供的电子出版物文献( Publishers)较常用4.9 文献进入MEDLINE的时间 有30天、60天、90天、180天、1年、2年、5年和10年选择4.10 出版或进入MEDLINE的时间段 应输入时间范围按照年/月/日的格式5. 利用预览/索引(Preview/Index)检索 使用预览/索引可以:预览。