基本程序是：1发生收支，2收支转结余，3年终通过结余分配科目分配（亏损不分配）：一般40%提取专用基金-福利，其余转入事业基金-一般基金，4结余转入分配有关科目如下：第306号科目事业结余1.本科目核算事业单位在一定期间除经营收支外各项收支相抵后的余额(不含实行预算外资金结余上缴办法的预算外资金结余)2.期末，计算结余时，应将“财政补助收入”、“上级补助收入”、“附属单位缴款”、“事业收入”、“其他收入”等科目余额转入本科目，借记“财政补助收入”、“上级补助收入”、“附属单位缴款”、“事业收入”及“其他收入”科目，贷记本科目；将“拨出经费”、“事业支出”、“上缴上级支出”、“销售税金(非经营业务)”、“对附属单位补助”、“结转自筹基建”等科目余额转入本科目，借记本科目，贷记“拨出经费”、“事业支出”、“上缴上级支出”、“销售税金”、“对附属单位补助”、“结转自筹基建”等科目3.本科目贷方余额为当期实现的结余4.年度终了，单位应将当年实现的结余全数转入“结余分配”科目，结转后，本科目无余额第307号科目经营结余1.本科目核算事业单位在一定期间各项经营收入与支出相抵后的余额2.期末计算经营结余时，应将“经营收入”科目余额转入本科目，借记“经营收入”科目，贷记本科目；将“经营支出”、“销售税金”等科目余额转入本科目，借记本科目，贷记“经营支出”、“销售税金”科目。
3.本科目贷方余额为实现的经营结余，如为借方余额，则为经营亏损4.年度终了，单位应将实现的经营结余全数转入“结余分配”科目，结转后本科目无余额，如为亏损则不结转第308号科目结余分配1.本科目核算事业单位当年结余分配的情况和结果2.本科目一般应设置“应交所得税”、“提取专用基金”等明细科目有所得税缴纳业务的单位计算出应交纳的所得税，借记本科目(应交所得税)，贷记“应交税金”科目单位计算出应提取的专用基金，借记本科目(提取专用基金)，贷记“专用基金”科目本人注：职工福利基金一般是按40%提取）3.年终，应将当年事业结余和经营结余全数转入本科目，借记“事业结余”、“经营结余”科目，贷记本科目4.本科目贷方余额，为未分配结余5.分配后，单位应将当年未分配结余，全数转入“事业基金——一般基金”科目，借记本科目，贷记“事业基金——一般基金”科目结转后，本科目应无余额6.单位年终结账后发生以前年度会计事项的调整或变更，涉及到以前年度结余的，凡国家有规定的，从其规定；没有规定的，应直接通过“事业基金”科目进行核算，并在会计报表上加以注明四)收人类第401号科目财政补助收入1.本科目核算事业单位按照核定的预算和经费领报关系收到的由财政部门或上级单位拨入的各类事业经费。
为加强预算资金的核算管理，主管会计单位应编报季度分月用款计划在申请当期财政补助时，应分“款”项”填写“预算经费请拨单”，报同级财政部门事业单位在使用财政补助时，应按计划控制用款，不得随意改变资金用途款”、“项”用途如需调整，应填写“科目流用申请书”，报经同级财政部门批准后使用2.收到财政补助收入时，借记“银行存款”等科目，贷记本科目；缴回时作相反的会计分录平时本科目贷方余额反映财政补助收入累计数3.年终结账时，将本科目贷方余额全数转入“事业结余”科目，借记本科目，贷记“事业结余”科目4.年终结账后，本科目无余额5.本科目应按“国家预算收入科目”的“款”级科目设明细账第403号科目上级补助收入1.本科目核算事业单位收到上级单位拨入的非财政补助资金2.收到上级补助收入时，借记“银行存款”科目，贷记本科目3.年终将本科目余额全数转入“事业结余”科目，借记本科目，贷记“事业结余”科目4.年终结账后，本科目无余额第404号科目拨入专款1.本科目核算事业单位收到财政部门、上级单位或其他单位拨入的有指定用途，并需要单独报账的专项资金2.收到拨款时，借记“银行序款”科目，贷记本科目；缴回拨款时，作相反的会计分录。
平时，本科目贷方余额反映拨入专款累计数3.年终结账时，对已完工的项目，将本科目与“拨出专款”、“专款支出”科目对冲，借记本科目，贷记“拨出专款”、“专款支出”科目，其余额按拨款单位规定办理4.本科目应按资金来源和项目设明细账，进行明细核算第405号科目事业收入1.本科目核算事业单位开展专业业务活动及辅助活动所取得的收入单位收到的从财政专户核拨的预算外资金和部分经财政部门核准不上缴财政专户管理的预算外资金，也在本科目核算但收到应返还所属单位的预算外资金，主管部门要通过“其他应付款”科目核算2.收到款项或取得收入时，借记“银行存款”、“应收账款”等科目，贷记本科目；对属于一般纳税人的单位取得收入时，按实际收到的价款扣除增值税销项税额，贷记本科目，按计算出的应交增值税的销项税额，贷记“应交税金——应交增值税(销项税额)”经财政部门核准，预算外资金实行按比例上缴财政专户办法的单位取得收入时，应按核定的比例分别贷记“应缴财政专户款”和本科目实行预算外资金结余上缴财政专户办法的单位，平时取得收入时，先全额通过本科目反映，定期结算出应缴财政专户资金结余时，再将应上缴财政专户部分扣出，借记本科目，贷记“应缴财政专户款”科目。
3.期末，应将本科目余额转入“事业结余”科目，借记本科目，贷记“事业结余”科目结转后本科目应无余额4.事业单位应根据事业收入种类或来源，设置明细账第409号科目经营收入1.本科目核算事业单位在专业业务活动及辅助活动之外开展非独立核算经营活动取得的收入2.取得(或确认)经营收入时，借记“银行存款”、“应收账款”、“应收票据”等科目属于小规模纳税人的单位，按实际收到的价款贷记本科目；属于一般纳税人的单位，按实际收到的价款扣除增值税销项税额，贷记本科目，按计算出的应交增值税的销项税额，贷记“应交税金——应交增值税(销项税额)”3.发生销货退回，不论是否属于本年度销售的，都应冲减本期的经营收入，属于小规模纳税人的事业单位借记本科目，贷记“银行存款”科目；属于一般纳税人单位，按不含税价格借记本科目，按销售时计算出的应交增值税的销项税额，借记“应交税金——应交增值税(销项税额)”科目，货记“银行存款”科目单位为取得经营收入而发生的折让和折扣，应当相应冲减经营收入4.期末，应将本科目余额转入“经营结余”科目，结转后，本科目无余额5.单位可根据收入种类设置明细科目，也可以并设若干总账科目第412号科目附属单位缴款1.本科目核算事业单位收到附属单位按规定缴来的款项。
2.单位实际收到款项时，借记“银行存款”科目，贷记本科目，发生缴款退回则作相反的会计分录3.年终，将本科目贷方余额全数转入“事业结余”科目，借记本科比贷记“事业结余”科目结转后，本科目无余额4.本科目应按缴款单位设置明细账第413号科目其他收入1.本科目核算事业单位除上述各项收入以外的收入如对外投资收益、固定资产出租、外单位捐赠未限定用途的财物、其他单位对本单位的补助以及其他零星杂项收入等2.其他收入以单位实际收到数额予以确认取得收入时，借记“银行存款”等科目，贷记本科目，收入退回时作相反的会计分录3.年末，将本科目贷方余额全数转入“事业结余”科目，借记本科目，贷记“事业结余”科目结转后本科目应无余额4.本科目应按收入种类，如“投资收益”、“固定资产出租”、“捐赠收入”等设置明细账五)支出类第501号科目拨出经费1.本科目核算事业单位按核定的预算拨付所属单位的预算资金2.事业单位拨出经费时，借记本科比贷记“银行存款”科目，收回拨出经费时，借记“银行存款”科目，贷记本科目3.年终，将本科目借方余额全数转入“事业结余”科目，借记“事业结余”科目，贷记本科目结转后本科目无余额4.对附属单位拨付的非财政性补助资金或专项资金不通过本科目核算。
5.本科目应按所属单位名称设置明细账第502号科目拨出专款1.本科目核算主管部门或上级单位拨给所属单位的需要单独报账的专项资金2.拨出专项资金时，借记本科目，贷记“银行存款”科目收回时，做相反的会计分录3.所属单位报销专款支出时，应区别情况处理1)专项资金如系上级单位拨入的，则借记“拨入专款”科目，贷记本科目2)属于本单位用自有资金设置对所属单位的专项拨款，按资金渠道借记有关科目，贷记本科目4.本科目借方余额为所属单位尚未报销数5.本科目按所属单位的名称或项目设置明细账第503号科目专款支出1.本科目核算由财政部门、上级单位和其他单位拨入的指定项目或用途并需要单独报账的专项资金的实际支出数2.专款支出主要有科研课题经费、挖潜改造资金、科技三项费用等指定项目或用途的支出3.事业单位按指定的项目或用途开支工、料费时，借记本科目，贷记“银行存款”，“材料”等科目；项目完工向有关部门单独列报时，借记“拨入专款”科民贷记本科目4.本科目按专款的项目设明细账第504号科目事业支出1.本科目核算事业单位开展各项专业业务活动及其辅助活动发生的实际支出有财政补助收入的事业单位，其财政补助资金必须按拟定的用途使用，不得自行改变资金用途。
2.事业支出应按以下科目进行明细核算：基本工资、补助工资、其他工资、职工福利费、社会保障费、助学金、公务费、业务费、设备购置费、修缮费和其他费用3.事业支出的报销口径规定如下：(1)对于发给个人的工资、津贴、补贴和抚恤救济费等，应根据实有人数和实发金额，取得本人签收的凭证后列报支出2)购入办公用品可直接列报支出购入其他各种材料可在领用时列报支出3)引社会保障费、职工福利费和管理部门支付的工会经费，按照规定标准和实有人数每月计算提取，直接列报支出4)固定资产修购基金按核定的比例提取，直接列报支出5)购入固定资产，经验收后列报支出，同时记入“固定资产”和”固定基金”科目6)其他各项费用，均以实际报销数列报支出4.发生事业支出时，借记本科目，贷记“现金”、“银行存款”等科目当年支出收回时作冲减事业支出处理实行内部成本核算的事业单位结转已销业务成果或产品成本时，按实际成本，借记本科目，贷记“产成品”科目5.有经营活动的事业单位应正确划分事业支出和经营支出的界限对于能分清的支出，要合理归集，对于不能分清的，应按一定标准进行分配，不得将应列入经营支出的项目列入事业支出，也不得将应列入事业支出的项目列入经营支出。
6.年终，将本科目借方余额全数转入“事业结余”科目，借记第505号科目经营支出1.本科目核算事业单位在专业业务活动及其辅助活动之外开展非独立核算经营活动发生的各项支出以及实行内部成本核算单位已销产品实际成本2.经营支出一般应按以下项目进行明细核算：基本工资、补助工资、其他工资、职工福利费、社会保障费、助学金、公务费、业务费、设备购置费、修缮费和其他费用等经营业务种类较多的单位，应按经营业务的主要类别进行二级明细核算3.事业单位发生各项经营支出时，借记本科目，贷记“银行存款”或有关科目实行内部成本核算的事业单位结转已销经营性劳务成果或产品时，按实际成本借记本科目，贷记“产成品”科目4.期末应将本科目余额全部转入“经营结余”科目，借记“经营结余”，贷记本科目5.本科目应按单位经营业务的主要类别设置明细账第509号科目成本费用1.本科目核算实行内部成本核算的事业单位应列入劳务(产品、商品)成本的各项费用2.业务活动或经营过程中发生的各项费用，借记本科目，贷记“材料”、“银行存款”等有关科目；产品验收入库时，借记“产成。