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实验一CTAB法提取植物基因组DNA

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实验一 CTAB法提取植物基因组DNA实验目的:学习从植物组织中(幼叶)提取基因组DNA的基本原理和方法实验原理:采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类),其对DNA的抽提产生不利的影响,所以在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜并与核酸形成复合物该复合物在高盐的溶液中(>0.7mol/L NaCl)是可溶的,通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀(CTAB能溶于乙醇)即可使核酸分离出来CTAB溶液在低于15度时会形成沉淀洗出,因此再将其加入冰冷的植物材料中之前必须预热(65度),且离心温度不要低于15度实验步骤:1、取幼嫩的植物叶片(3-5g)剪碎液氮研磨成粉,转入1.5ml离心管内加入等体积的65℃预热的DNA提取缓冲液置于65℃的恒温水浴摇床上1-2h(1.5h)2、加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),轻轻上下颠倒5分钟,静置5分钟,之后于12000rpm离心10分钟。

3、吸取上层水相,重复步骤2一次4、吸取上层水相,加入预冷2/3体积的异丙醇,轻缓颠倒2分钟并置-20℃冰箱内10min,待DNA沉淀后于12000rpm离心收集,收集的DNA于70%乙醇中洗2-3次将弃去乙醇风干后的DNA加适量水使其溶解5、待DNA完全溶解后加入1-2μl不含RNAaseA(10mg/ml),37℃保温1h以除去DNA中的RNA6、于Eppendorf管中加入1mL氯仿:异戊醇(24:1)轻轻上下颠倒10分钟后10000rpm离心10分钟7、吸取上层水相并先后加入1/10体积的3M醋酸钠及2倍总体积的预冷的无水乙醇,接着置于-20℃冰箱,10分钟后10000rpm离心10分钟,弃去无水乙醇,加入70%乙醇洗涤2-3次,风干,最后将DNA溶于适量(200-500μl) TE中8、待DNA完全溶解后进行1%琼脂糖凝胶电泳,检查DNA的质量并据已知的DNA 分子量标准估计其浓度调整浓度后的DNA置于-20℃备用实验试剂:1、1M Tris-HCL(pH8.0)121.1g Tris溶于800ml无菌水中,加浓HCL调pH到8.0,定容至1L,高压灭菌2、0.5M EDTA(pH8.0)186.1g EDTA-Na·2H2O溶于800ml无菌水中,需用磁力搅拌器剧烈搅动,用NaOH调pH值到8.0(约20g),定容至1L,高压灭菌。

3、3.5M NaCL204.75g NaCL溶于1L无菌水中,高压灭菌4、10% CTAB溶液10gCTAB溶于80ml无菌水中,定容至100mL,高压灭菌5、DNA提取液(500ml)3.5M NaCL200mlTris-HCL50mlEDTA50ml10%CTAB100mlWater100ml6、氯仿-异戊醇(24:1体积比)7、RNAaseA8、异丙醇9、无水乙醇10、3M醋酸钠11、1×TE缓冲液实验仪器:液氮罐、1.5ml离心管、1.5ml离心管架、恒温水浴摇床、枪及枪头(1ml和200ul)、离心机(转速可调至4000rpm和10000rpm)、剪刀注意事项(1)叶片磨得越细越好2)移液器的使用3)由于植物细胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性外,第一步的操作应迅速,以免组织解冻,导致细胞裂解,释放出DNA酶,使DNA降解。

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