中药色谱指纹图谱相似度评价系统的操作规范(版本 A)SOP of Similarity evaluation system for chromatographic fingerprint of TCM(Version A)目 录一、 软件系统的功能简介:二、 附录1:附常用色谱工作站AIA(*.cdf)格式文献的导出三、 附录2:本软件波及术语的注释,新增功能和常用问题及解答一. ﻬ简介1.版本简介:本软件系统涉及两个应用版本:研究版( A)和检查版( B)研究版重要用于科学研究工作,具有生成对照图谱功能检查版侧重于色谱指纹图谱的检查工作,功能简化,不具有生成对照图谱的功能2.系统运营环境规定:(1). 最低配备:CPU主频533 MHz以上,内存64M,硬盘剩余最小空间100M,操作系统Windows 98以上,屏幕辨别率800×6002). 推荐配备:PVI以上CPU,内存128M,硬盘空间20G,操作系统Windows 以上,屏幕辨别率1024×768二. 安装措施点击setup.exe后,进入安装程序,如果无其她特殊需要,可以直接点击下一步至安装结束图 1三. 功能本软件系统涉及文献导入,数据库管理,谱图解决,分析检查和协助等功能。
安装完本系统后,运营“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”执行程序,进入登陆界面(图2),这时需要顾客输入顾客名和相应的密码(现暂无设立密码)点击拟定进入启动界面(图3),三秒钟后自动进入本系统运营主界面若顾客不想在启动界面等待三秒钟,可以直接点击启动界面(图3),这样可以迅速进入系统主界面(图4)图2图3绘图区文献信息区图4 系统主界面系统主界面中(图4),文献信息区(即图谱列表)显示样本编号(如(S1))及文献的途径名称等信息,绘图区显示相应的色谱指纹图谱和样本的编号(如(S12))1 文献打开(1)打开文献(全谱导入)(图5):图5本系统支持三种格式文献的导入:AIA(即*.cdf)文献,文本文献(*.txt)和Scp(*.Scp)格式文献的导入(图5)建议采用通用的AIA(*.cdf)格式文献导入注意AIA(*.cdf)文献中应涉及样本图谱的峰面积信息,在色谱工作站导出AIA(*.cdf)文献前应现进行积分否则导出的AIA(*.cdf)文献也许因不涉及峰面积信息而无法导入为了以便顾客的使用,附录中给出了重要色谱工作站的(AGILENT,WATERS,和SHIMADZU)AIA(*.cdf)数据格式的文献导出简介。
文本文献(*.txt)的导入需要采用特殊的格式,可以参照本系统导出的文本文献格式Scp(*.Scp,即Standard Chromatographic Project的简写)是本系统为生成的对照图谱的导入提供的一种特殊的文献格式2)导出文献(保存图谱)本系统支持将导入的图谱数据文献以文本文献(*.txt)导出保存(图6)图6(3)导出图象将导入绘制的色谱图谱可以图象形式寄存,文献格式为*.bmp(图7)图7(4)图谱删除本系统提供谱图删除功能(图8)可以选中某一图谱删除(“删除目前图谱”功能),也可将导入的图谱所有删除(“清除所有图谱数据”)在文献信息区选中某同样本图谱,然后在文献菜单栏中点击“删除目前图谱”,即可将选中的样本图谱删除若点击“清除所有图谱数据”,所有样本图谱所有删除 图82 数据库功能:数据库管理涉及药材信息建档(图9)、制剂信息建档(图10)和参照图谱建档功能(图11),便于顾客信息管理图9图10图113 谱图解决:(1) 数据剪切数据剪切功能可使顾客选择一定期间范畴内的色谱数据进行匹配点击“谱图解决”中的“数据剪切”功能,系统会提示顾客与否需要恢复原始数据,点击拟定后进入“数据剪切”功能对话框,如图(12):图12 数据剪切功能对话框通过该对话框顾客可以剪切样本图谱起始阶段的溶剂峰,也可剪切样本图谱尾部阶段的“杂峰”。
在对话框中输入剪切溶剂峰的“终结时间”(系统默觉得5分钟)和尾部剪切的“起始时间”(系统默觉得60分钟),可以将所有样本在剪切溶剂峰的“终结时间”前和尾部剪切的“起始时间”后的图谱数据剪切掉2) 放大和缩小本系统提供了两种图谱放大和缩小功能一种为“信号放大一倍和缩小一倍”(图13),另一种为信号的直接拖放放大这里只简介“信号放大一倍和缩小一倍”功能信号放大一倍和缩小一倍功能”使得目前显示图谱的沿y轴方向成比例放大和缩小一倍,便于顾客观测图谱信号的整体概貌和细节部分持续点击“信号放大一倍”两次,即将原始图谱沿y轴方向放大四倍图13 谱图解决涉及的功能(3)色谱峰匹配色谱峰匹配涉及指定参照峰,指定基准峰和自动匹配下面逐个简介:· ﻩ指定参照图谱:顾客可以任意选择一条色谱图谱作为指定参照图谱点击“谱图解决”®“色谱峰匹配”中的“指定参照图谱”,弹出如图14所示的对话框,选择参照图谱编号“拟定“后即可将该编号相应的图谱指定为参照图谱图谱颜色变为红色,以区别于其她图谱在此对话框中还提供了“对照图谱的生成措施”和“时间窗宽度”的参数设立对照图谱的生成措施”(详见“3 谱图解决中(4)生成对照图谱、单独显示对照图谱及导出对照图谱”),这里只简介“时间窗宽度”的参数设立。
时间窗宽度是指相对于参照图谱峰位置的可选保存时间范畴,其单位根据横坐标轴的单位而定(这里是分钟)时间窗宽度越大,可选的时间范畴就越大在色谱峰匹配时,选择一种合适的时间窗宽度是非常重要的一般状况下,时间窗宽度在较小范畴内变化(如0.1-0.5),自动匹配成果变化较大时间窗宽度在较大范畴内变化(如0.5-1.5),自动匹配成果比较稳定建议:先在一定范畴内逐渐增长时间窗宽度(如0.1-1.0),然后观测匹配成果(可以通过相似度的计算成果拟定)若时间窗宽度增长到一定数值后,匹配成果比较稳定(相似度计算成果稳定),这时相应的时间窗宽度参数较为适合图14 参数设立对话框· 多点校正(即设立匹配点或设立Mark峰):系统支持“多点校正”功能点击“谱图解决”®“色谱峰匹配”中的“多点校正”(或直接点击状态栏中的“多点校正”按钮),系统进入“多点校正”模式,这时鼠标变成“+”顾客根据需要直接在图谱上设立匹配点(匹配点数不限,设立后的匹配点为红色点表达,详见图36和37)进行多点校正若设立成果不满意,可以再次点击设立的匹配点即可取消已设立的匹配点为了使顾客尽快找到色谱峰的峰位置,进行匹配点的设立,可以点击“谱图解决”中的“显示色谱峰”(详见“3 谱图解决中(5)显示色谱峰”,图20),这样所有样本图谱的所有色谱峰所有显示出来。
样本图谱数量较多时,有些峰面积较大峰的设立较为不变;或者所有样本图谱匹配点设立完毕,但又觉得某些样本图谱匹配点的设立不够抱负,这时可以采用“单谱显示”模式(详见工具栏中“单谱显示”按钮),逐个图谱进行设立和修正若对所有样本图谱设立的匹配点(Mark峰)不满意,但愿重新设立,可以通过如下两种措施实现:①直接点击右键,弹出对话框(图15)图15点击“拟定”后即可取消所有样本图谱已经设立的匹配点,然后再重新设立②点击工具栏中“数据恢复”按钮(图16),图16点击“是”后,样本图谱恢复到匹配点设立此前的状态· 自动匹配:本系统提供自动匹配功能,可实现色谱峰的自动匹配自动匹配时,需要顾客设立时间窗宽度,系统默认值为0.1(图14)顾客可以调节此参数以调节色谱峰的匹配成果图17 自动匹配成果匹配成果以蓝色虚线将匹配的色谱峰联接起来表达(见图17)顾客也可点击工具栏中“匹配数据”按钮,直接观测样本图谱的匹配成果(详见6工具栏中的“匹配数据”按钮简介)一般状况下,若导入的样本图谱视觉上排列整洁,较为相似,可以直接进行自动匹配4)生成对照图谱、单独显示对照图谱及导出对照图谱对照图谱的生成需要先进行谱峰匹配然后才干生成对照图谱。
其生成措施涉及均值法和中位数法顾客可以根据需要选择合适的措施生成对照图谱(可以在图14所示的对话框中选择措施生成对照图谱的编号为R见图18中图谱),并可单独显示(点击“谱图解决”中的“单独显示对照图谱”,见图19),便于顾客观测生成的对照图谱以特殊格式导出(对照图谱不能在“文献”菜单中以“导出文献”导出,必须以图13所示菜单中“导出对照图谱”)对于注射剂建议采用均值法产生对照指纹图谱;对于中药材,建议采用中位数法产生对照指纹图谱图18图19 对照图谱的单独显示(5)显示色谱峰“显示图谱峰”功能使绘图区的样本图谱的色谱峰以点标记的方式显示出来(如图20),便于顾客设立匹配点和观测分析图20(6)着色目前谱图和随机着色谱图:顾客根据需要可以选择某一图谱进行着色,也可对图谱进行随机着色(图13)4 分析检查:(1)相似度计算:对照图谱生成后,顾客通过“相似度计算”功能进行色谱图谱样本与对照图谱的相似度评价评价成果以表格形式显示,并可保存,或将成果拷贝到剪贴板上,再粘贴到Excel表格中以以便顾客使用(图21和22)图21 图22 相似度计算成果(2)打印报告:顾客通过“打印报告”功能将分析成果打印出来(图21)。
打印报告中涉及报表信息输入(图23)和分析报告两部分(图24和25)其中分析报告涉及原始指纹图谱,匹配后图谱和相似度评价成果图23图24图255 协助为以便顾客使用,本系统提供简洁完整的联机协助6 工具栏按钮简介:工具栏按钮如图所示(图26)其中大部分按钮的功能在前面已经简介过,不再赘述这里将重点简介“数据恢复”,“匹配数据”,“图谱间距”和“单谱显示”功能1)数据恢复“数据恢复”功能是使目前解决成果恢复到图谱数据刚刚导入的状态2)匹配数据:“匹配数据”按钮可使顾客直接观测峰匹配的成果(图27)非共有峰图27 匹配数据成果在匹配成果中,共有峰(白色)和非共有峰(灰色)以不同颜色表达,便于顾客观测匹配成果也可保存为文本文献,或拷贝到剪贴板上,再粘贴到Excel表格中以以便顾客使用(类似于“相似度计算”成果)3)图谱间距“图谱间距”可以调节绘制图谱间的距离,便于顾客观测和分析点击工具栏上“图谱间距”按钮,弹出“设立谱图间距”对话框(图28),输入相应数值以调节谱图间距图28(4)单峰显示“单峰显示”可使选中的图谱单个显示,便于顾客观测和分析单个样本图谱四 卸载可以采用本系统提供的卸载程序进行卸载。
也可在控制面板中,采用添加/删除程序卸载本程序五 应用实例为以便顾客迅速掌握本系统,我们以一例子加以简介例:对获取的色谱指纹图谱建立对照图谱,进行相似度评价,并打印报告基本流程图如下(图29):自动匹配多点校正对照图谱生成相似度评价成果打印报告样本图谱数据导入(AIA格式)设参照图谱匹配成果匹配成果不满意,可调节匹配参数设立匹配不满意,调节多点校正参数图291 样本图谱数据导入(AIA格式(*.cdf),图30和31)图31图322 设参照图谱(图33)图343 自动匹配图35 自动匹配成果4多点校正多点校正(这里为2点)。