PUC57有氨苄抗性， MCS 在 lacZ 基因里面插入基因后可通过蓝白筛选挑选阳性克隆如何阅读质粒图谱第一步： 首先看 Ori 的位置 ，了解质粒的类型（原核/真核 /穿梭质粒） 第二步： 再看筛选标记 ，如抗性，决定使用什么筛选标记 （1）Ampr 水解 β －内酰胺环，解除氨苄的毒性2）tetr 可以阻止四环素进入细胞 （3）camr 生成氯霉素羟乙酰基衍生物，使之失去毒性4）neor（kanr） 氨基糖苷磷酸转移酶使 G418（卡那霉素衍生物）失活 （5）hygr 使潮霉素 β失活 第三步： 看多克隆位点（ MCS）它具有多个限制酶的单一切点便于外源基因的 插入如果在这些位点外有外源基因的插入，会导致某种标志基因的失活，而便于 筛选决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因第四步：再看外源DNA 插入片段大小质粒一般只能容纳小于10Kb 的外源 DNA 片段一般来说， 外源 DNA 片段越长，越难插入，越不稳定，转化效率越低 第五步：是否含有表达系统元件，即启动子－核糖体结合位点－克隆位点－转录终止信号 这是用来区别克隆载体与表达载体克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。
选用那种载体，还是要以实验目的为准绳 启动子－核糖体结合位点－克隆位点－转录终止信号启动子－促进DNA 转录的 DNA 顺序，这个 DNA 区域常在基因或操纵子编码顺序 的上游，是 DNA 分子上可以与RNApol 特异性结合并使之开始转录的部位，但启动 子本身不被转录增强子 /沉默子－为真核基因组（包括真核病毒基因组）中的一种具有增强邻近基 因转录过程的调控顺序其作用与增强子所在的位置或方向无关即在所调控基因 上游或下游均可发挥作用/沉默子－负增强子，负调控序列核糖体结合位点 /起始密码 /SD 序列（ Rbs/AGU/SDs）：mRNA 有核糖体的两个结 合位点 ，对于原核而言是AUG（起始密码）和SD 序列转录终止顺序（终止子）/翻译终止密码子：结构基因的最后一个外显子中有一个 AATAAA的保守序列，此位点down－stream有一段 GT 或 T 富丰区，这 2 部分共 同构成 poly（A）加尾信号结构基因的最后一个外显子中有一个AATAAA的保守序列，此位点down－stream有一段 GT 或 T 富丰区，这 2 部分共同构成poly（A） 加尾信号为什么质粒图谱上有的箭头顺时针有的箭头逆时针？那其实是代表两条DNA 链， 即质粒是环状双链DNA，它的启动子等在其中一条链上，而它的抗性基因在另一条链上. 图下方显示的序列是多克隆酶切位点。