细胞筛选一嘌吟霉素(一)确定最优筛选浓度 当用于筛选特定细胞的嘌吟霉素合适浓度未知时,需进行滴定, 或制定针对那种细胞的嘌吟霉素杀菌曲线一般而言,嘌吟霉素浓度范围在2-10微克/毫升 时是足以杀灭大多数未转染的哺乳动物细胞系1. 培养待转染(而不是转染后)的细胞筛选的目的是杀灭未转染的细胞)2. 取对数生长期的细胞(一般在铺满培养器皿底部的70%〜80%时),用新鲜无抗无血清的 培养基制成1.5X105个/ml的细胞悬液3. 向96孔培养板中加细胞悬液,每孔100微升(使每孔细胞数在1.5X104个),然后向 每孔加新鲜无抗无血清的培养基适量,培养箱中静置培养过夜这样做是为了保证在固 定细胞密度下确定最佳G418药物筛选浓度4. 第二天用嘌吟霉素浓度分别为0, 2, 4, 6, & 10微克/毫升的新鲜无抗无血清培养基溶液替 换各孔中的旧的培养基每个浓度可用两个复孔,相当于每个浓度测定三次)注意: 对于多数细胞种类而言,过量的嘌吟霉素能引起许多非必需的表型的反应5. 每日检查细胞活力,根据细胞活力,每三天 即每隔两天)更换含嘌吟霉素的新鲜无抗无 血清培养基溶液一次如细胞生长过快,可以缩短换液时间(每隔一天)。
6. 在正常的实验操作规程时,一种细胞最优筛选浓度的确立时间随细胞的生长率和一般生 存时间而定,大 概需3到14天在所需时间之后,嘌吟霉素的导致所有细胞死亡的最小浓 度就是应该用于该细胞和该实验的浓度最优浓度为在3-5天内杀死所有细胞的浓度二)转染细胞1. 第一天:在60mm培养皿内种植细胞,细胞密度为能使第二天细胞融合能达到70%-80% 的密度,CO2孵箱过夜培养2. 第二天:准备3ml无抗生素无血清培养基,加入Polybrene使其终浓度为8 m g/ml将已 经制备的病毒颗粒0.5 ml加至上述培养基,轻吹混匀去除60mm培养皿内的旧的培养基, 加入含病毒培养基Polybrene能够增加病毒感染的效率,然而,有时候Polybrene对细胞 有毒性这时,可以用Protamine Sulfate代替Polybrene)(三)筛选细胞1. 病毒感染后24小时,可以换用含最优浓度puromycin的培养基2. 如果病毒对细胞有毒性,可以减少感染时间至4-6小时,然后换用新鲜培养基,24-48 小时后换加含最优浓度puromycin的培养基最好设立一个对照皿,不加病毒液,加入 Ploybrene,观察Polybrene是否对细胞有毒性;如果 Polybrene没有毒性,还可以加入 puromycin,作为puromycin是否有效的对照。
3. 以后每隔一天换用新鲜含puromycin的无抗生素无血清培养基,以替换含大量死细胞的培 养基直到抗性群落能被识别出(一般是在筛选后10到12天)4. 待抗性细胞长满以后,细胞转入10cm培养皿,同时,留一部分细胞在原来的60mm平皿 内5.60mm平皿内细胞长满后,收获细胞,在蛋白或mRNA水平鉴定基因敲低效率6. 10cm 培养皿内的细胞待长满后传代,首先每种稳定细胞系冻存4-5支细胞,待基因敲低鉴定清楚 后,解冻冻存细胞,进行表型观察分析通常情况下,由于慢病毒为复制缺陷型病毒,受感 染的细胞不能产生新的病毒,因此从加入病毒颗粒开始,经过5-6次换液后,培养基内已不 存在病毒颗粒,可以移至普通细胞培养室内培养研究二 G418(一) 确定最优筛选浓度由于每种细胞对G418的敏感性不同,而且不同的厂家生产的相同浓度的G418的活性不尽 相同,所以在筛选之前,一定要确定G418的最佳筛选浓度1. G418的配制:取1g G418溶于1ml 1mol/L的HEPES液,加蒸馏水定容至10ml (使 G418终浓度为0.1g/ml ,HEPES终浓度为100mmol/L),过滤消毒,4度保存。
HEPES的 化学全称为羟乙基呱嗪乙硫磺酸(N' -a-hydroxythylpiperazine-N' - ethanesulfanic acid ), 分子量238.31,是一种氢离子缓冲剂,能较长时间的控制溶液的pH处于恒定的范围,而对 细胞无毒性作用1mol/L HEPES的简单配置:HEPES 23. 83g,溶解于80ml的双蒸水中, 用10mol/L的NaOH调节pH至7.2-7.4,定容至100ml,0.22um小滤器过滤HEPES使用 终浓度为10-50mmol/L2.制备筛选培养基:在 100ug/ml~ 1000ug/ml 范围内按 0ug/ml、100ug/ml、200ug/ml、 300ug/ml、400ug/ml, 500ug/ml、600ug/ml、700ug/ml、800ug/ml, 900ug/ml、1000ug/ml 浓度用无抗无血清培养基稀释G418制成筛选培养基心得:由于特性明确的细胞系G418 的最佳用量还是比较稳定的,所以有时候不需要在这么大范围内进行筛选比如说你要转染 NIH3T3细胞,现在我告诉你我测试过NIH3T3细胞对G418的敏感性,我用的筛选浓度是 200 ug/ml。
这时你就可以做150ug/ml、200ug/ml、300ug/ml三个浓度进行筛选3. 培养待转染(而不是转染后)的细胞筛选的目的是杀灭未转染的细胞)4. 取对数生长期的细胞(一般在铺满培养器皿底部的70%〜80%时),用新鲜无抗无血清 的培养基制成1X104个/ml的细胞悬液5. 向96孔培养板中加细胞悬液,每孔100微升(使每孔细胞数在1X103个),然后向 每孔加新鲜无抗无血清的培养基适量,培养箱中静置培养这样做是为了保证在固定细 胞密度下确定最佳G418药物筛选浓度汇合度:实际上就是指细胞占培养表面的比例, 如果细胞铺满了整个容器,我们就认为它们100%汇合,也就是汇合度100%汇合度对G418 筛选结果的影响很大,一般筛选时汇合度不宜超过50% !6. 培养6小时左右开始加药加筛选培养基筛选:吸除培养孔中培养基,PBS洗涤一次, 每孔中加入不同浓度的筛选培养基适量7. 换液:每日检查细胞活力,根据细胞活力和培养基的颜色,每三天即每隔两天)更换筛 选培养基一次如细胞生长过快,可以缩短换液时间(每隔一天)有死细胞勤换液,可 以减少对存活细胞的影响8. 确定最佳筛选浓度:在正常的实验操作规程时,一种细胞最优筛选浓度的确立时间随细 胞的生长率和一般生存时间而定,在筛选10〜14天内能够杀死所有细胞的最小G418浓度 即为最佳筛选浓度。
在第一轮就筛选出最佳G418浓度的可能性不大,最有可能的是出现 这种情况:用某一浓度G418的量在筛选14天后还不能杀死细胞,而用下一个梯度的G418 的量在10天前就看不到活细胞了假如是400ug/ml不能杀死细胞,而800ug/ml在第5天 就把所有细胞都杀死了,则可以再用500ug/ml、600ug/ml、700ug/ml进一步筛选,以确定最 佳筛选浓度二) 转染细胞1. 第一天:在60mm培养皿内种植细胞,细胞密度为能使第二天细胞融合能达到70%-80% 的密度,CO2孵箱过夜培养2. 第二天:准备3ml无抗生素无血清培养基,加入Polybrene,终浓度为8“g/m l将已经 制备的病毒颗粒0.5 ml加至上述培养基,轻吹混匀去除60mm培养皿内的旧的培养基, 加入含病毒培养基Polybrene能够增加病毒感染的效率,然而,有时候Polybrene对细胞有毒性这时,可以用Protamine Sulfate代替Polybrene)3. 转染后培养24小时或者更长,到细胞增长接近70%汇合时按1: 4密度传代,继续培养, 待细胞密度增至50%〜70%汇合时开始筛选三)筛选细胞1.加G418:去掉培养液,PBS洗一次,加入按最佳筛选浓度配制好的G418筛选培养基(无 抗无血清)(实 际应用时可以比最佳筛选浓度高一级别)。
2. 换液:根据培养基的颜色和细胞生长情况,每3〜5天更换一次筛选培养基当有大量 细胞死亡时,可以把G418浓度减半维持筛选筛选10〜14天后,可见有抗性的克隆出现, 停药用完全培养基培养3. 待其逐渐增大后,挑出单克隆:制备细胞悬液,细胞计数,用培养基稀释细胞到1个 /10ul在96孔板中加入培养基150ul/孔,再加入细胞悬液10ul/孔待其逐渐增大后转入 到48孔中增殖4. 单克隆鉴定:细胞大量扩增后,提取总RNA,做RT-PCR检测目的基因是否存在 典型贴壁细胞平板密度塔养板大小生长面和(cm2)大约细胞数培养基容和(E)组织培养皿((pEOmm)286. 6X1O55-6石孔培养板(tp 35mm)9.53X 1Q51-212孔塔养板(p 22.6mm)41. 3X1O50. 5-124孔土口养板(
嘌吟霉素作为氨酰-tRNA分子3,末端的类似物,能够与核糖体的A位点结合并 掺入到延伸的肽链中但是嘌吟霉素同A位点结合后,不会参与随后的任何反应,从而导致蛋白 质合成的提前终止并释放出C-末端含有嘌吟霉素的不成熟多肽抗性基因:对嘌吟霉素的抗性取决于编码嘌吟霉素N-乙酰转移酶(PAC)的Pac基因,遗传工程研究使用的Pac 基因分离自嘌吟霉素产生菌Streptomyces alboniger最普遍应用:1)嘌吟霉素如今普遍应用于筛选和维持培养含Pac基因的哺乳动物稳定转染细胞嘌吟霉素在细 胞稳转株筛选中的普遍应用与慢病毒载体的特性有关,现在商业化的慢病毒载体多数都携带pac 基因2)在某些特定情况下,嘌吟霉素亦可以用来筛选转化携带pac基因质粒的大肠杆菌菌株化学特性: 化学名称:3 (a -Amino-p-methoxyhydro cinnamamido)- 3—deoxy- N,N—dimethyladenosine・2HClCAS No.: 58-58.2,分子式:C22 H29 N7 O5 .2HCl,分子量:544.43 g/mol纯度:>98% (HPLC),易溶于水5-50mg/mL, -20度保存。
应用浓度:哺乳动物细胞的推荐使用浓度为1-lO^g/mL,最佳浓度需要杀灭曲线来确定LB琼脂培养基筛选稳定转化pac基因的大肠杆菌,使用浓度为125^g/mL使用嘌吟霉素筛选大 肠杆菌稳转株需要精确的pH值调节,而且受宿主细胞本身的影响使用步骤:(哺乳动物细胞筛选)►嘌吟霉素杀灭曲线的确定(shRNA稳定转染细胞株,仅作参考)为了筛选到稳定表达待研究shRNA的细胞株,确定杀死未转染/转导细胞的最低浓度嘌吟霉素至 关重要所以初次做实验的客户一定要建立适合自己体系的杀死曲线(kill curve)1) 24孔板内以5~8 x 104 cells/孔的密度铺板,铺足够量的孔以进行后续的梯度实验细胞孵育 过夜;(2) 准备筛选培养基-含不同浓度嘌吟霉素的新鲜培养基(如0-15gg/mL,至少5个梯度);(3) 细胞孵育过夜后加入筛选培养基,孵育细胞;(4) 约2-3天更换新鲜的筛选培养基;(5) 每日监测细胞观察存活细胞比例嘌吟霉素的最佳作用时间一般在1-4天之间6) 最小的抗生素使用浓度就是指从抗生素筛选开始1-4天内杀死所用细胞的最低。