新版新版PubMed检索检索浙江中医药大学图书馆 刘春金1技术课件 新版PubMed检索uPubMed及NCBI相关数据库uPubMed数据范围u认识新版PubMeduPubMed检索方法uPubMed RSS学科跟踪2技术课件 PubMed及相关数据库及相关数据库uNCBI(National Center for Biotechnology Information，美国国立生物技术信息中心)uNCBI是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一，其成立的原因是为已故的参议院议员Claude Pepper发现计算信息处理方法对生物医学研究的重要性，因此，在1988年11月4日成立NCBINCBI是National Institutes of Health（NIH）底下的National Library of Medicine（NLM）的部门之一由于NLM具有建立与维护生物医学数据库经验，且因它是NIH的单位，因此可执行计算分子生物计划NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位 uNCBI成立的主要任务为：u提供生物医学的分析与计算工具，协助研究人员了解生物的语言--DNA在健康与疾病中所扮演的角色u发展新技术协助了解调控健康与疾病的基本分子与遗传过程， 包括建立储存与分析分子生物、生化与遗传学知识的自动系统；促 进研究与医学社群使用数据库与软件；协调生物技术信息的传递与 管理；执行以计算机为基础的进阶信息分析过程，用以分析生物重要分子的结构与功能。
3技术课件 NCBI组织架构组织架构uComputational Biology Branch （CBB）uInformation Engineering Branch（IEB）uInformation Resources Branch（IRB）4技术课件 NCBI组织架构组织架构uComputational Biology Branch（CBB）u处理运算、数学及分子生物、生物与遗传学理论问题的基础与应用研究，包括基因体分析、序列比对、序列搜寻方法、巨分子结构、动力学与交互作用、结构/功能预测等u建立NIH实验室、政府机构、学术单位与产业界之生物学家、化学家、数学家与计算机科学家间的计算分子生物合作研究计划u提供研究分子生物分析工具的咨询与建议u与分子生物社群互动，利用计算与理论方法提高实验研究质量5技术课件 NCBI组织架构组织架构uInformation Engineering Branch（IEB）u进行数据表现与分析的应用研究，包括在分子生物、遗传学与生物化学的计算机储存、管理与检索系统u设计各种呈现分子生物信息的数据库架构与规格书，包括核酸、蛋白质与结构信息u设计与发展分布式软件系统，提供研究人员本机与远程的计算服务。
u协调公开序列、遗传、结构、目录信息，建立管理与整合数据库或连结至外部数据库u建立NIH内部与外部学术单位的信息学合作研究计划u提供软件与数据库设计咨询与建议u发展与提倡数据库、数据交换与生物命名的标准6技术课件 NCBI组织架构组织架构uInformation Resources Branch（IRB）u计划、监督与管理NCBI的计算机技术操作，包含用来研究、发展与存取公开数据库的计算机系统u提供NCBI人员与外来使用者技术支持u提供NCBI服务之网络操作指导u规划使用NCBI资源的教育训练与研讨会u计划、发展与管理政府合约与合作协议书，已获得支持NCBI信息u功能的设备与服务u作为基因体计划使用者与服务办事处之联络人u执行应用研究与发展，提供技术支持与指导，鉴定使用者需求；u管理生物使用社群之问卷调查，以评估NCBI发展的软件使用情形u协调政府其它办事处与生物信息资源，促进NCBI数据储存的发展7技术课件 NCBI组织架构组织架构uNCBI还有一个跨多学科的基础研究群，组成人员包括计算机科学家、分子生物学家、数学家、生化学家与物理学家，共同致力于计算分子生物的基础与应用研究他们一起研究利用数学与计算机方法解决分子层面的基本生物医学问题，这些问题包含了基因结构侦测与分析、序列分析、立体结构预测、重复序列类型（Pattern）、建立基因体图谱、HIV感染动力学的数学模型、分析序列错误对数据库搜寻的影响、发展数据库搜寻与多重序列比对的新算法、建立无重复的序列数据库、使用数学模型评估序列相似性在统计学上的重要性、建立文章检索的载体（Vector）模型等。
除此之外，这些研究人员尚与NIH的研究单位、学术单位的研究实验室与政府机构的研究实验室间维持合作关系，目前仍有多项研究计划正在进行当中8技术课件 NCBI资源资源uNCBI目前提供的生物信息资源主要分为u生物数据库u生物信息工具9技术课件 NCBI资源资源u生物数据库u生物数据库是一个永久数据的大的组织体，通常结合计算机软件执行更新、查询与存取数据的功能对于研究人员而言，数据库必须符合：容易取得信息以及只取得回答特殊生物问题的信息两项功能uNCBI的数据库搜寻与存取系统-Entrez，可用来获取单一数据库或许多数据库的整合数据例如Entrez蛋白质数据库除了可查询蛋白质信息，同时亦可连结到生物分类数据库查询生物分类信息目前，NCBI提供的公开（Open Access）数据库包括如下：10技术课件 11技术课件 Entrez以及以及BLASTuEntrez是NCBI的为用户提供整合的访问序列，定位，分类，和结构数据的搜索和检索系统Entrez同时也提供序列和染色体图谱的图形视图Entrez是一个用以整合NCBI数据库中信息的搜寻和检索工具这些数据库包括核酸序列，蛋白序列，大分子结构，全基因组，和通过PubMed检索的MEDLINE。
Entrez的一个强大和独特的特点是检索相关的序列，结构和参考文献的能力PubMed是一个网络搜索界面，可以提供对在MEDLINE上的九百万杂志引用的访问，包含了链接到参与的出版商网络站点的全文文章 uBLAST是一个NCBI开发的序列相似搜索程序，还可作为鉴别基因和遗传特点的手段BLAST能够在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索NCBI提供的附加的软件工具有：开放阅读框寻觅器（ORF Finder），电子PCR，和序列提交工具，Sequin和BankIt所有的NCBI数据库和软件工具可以从HTTP或FTP来获得12技术课件 Entrez可以检索的数据库可以检索的数据库uBooks 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库uCancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、临床与文献相关数据uConserved Domain Database（CDD），蛋白质功能区块保留序列数据库u3D Domains，蛋白质功能区块立体结构数据uGene，包含许多物种的基因数据库uGenome，包含超过800种物种的基因组数据库uGENSAT，小鼠中枢神经系统基因表现图谱uGEO Datasets，基因表现实验与生物芯片数值结果数据uGEO Profiles，基因表现图谱uHomoloGene，同源基因批注数据库uJournals，期刊文献（包含PubMed）uMeSH，医学主题词数据库uNCBI Web Site，所有NCBI网页uNLM Catalog，美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录uNucleotide sequence database，核酸序列数据库（包含GenBank、RefSeq和PDB等三大序列数据库）13技术课件 Entrez可以检索的数据库可以检索的数据库uOnline Mendelian Inheritance in Man (OMIM)，人类遗传疾病相关文献数据库uPopSet，族群演化分析相关研究资料uProtein sequence database，蛋白质序列数据库（包含Swiss-Prot、PIR、PRF、PDB等数据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译之蛋白质序列资料）uPubChem BioAssay，化学成分之生物活性筛选资料uPubChem Compound，小分子化学物质结构uPubChem Substance，具生物活性之化学物质筛选数据uPubMed，科学文献报导数据库uPubMed Central，科学文献数字全文数据库uSite Search，可搜寻NCBI的网页与FTPuSNP，单点核酸多样性数据库(dbSNP)uStructure，分子模型数据(MMDB) uTaxonomy，以核酸或蛋白质为基础的分类学信息uUniGene，人类unique基因序列数据库uUniSTS，unique序列卷标地址数据库14技术课件 PubMed数据范围数据范围u数据类型：期刊论文、综述以及与其他数据资源链接。
u特点：u免费提供题录和文摘u提供与原文的网址链接(部分免费获取） u提供检索词自动转换匹配u操作简便、快捷15技术课件 PubMed数据范围数据范围uMEDLINEu4800余种生物医学期刊，内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科这些期刊来源于美国和世界上70多个国家和地区u文献量达1千2百多万条记录，并回溯到1966年u记录中用[PubMed-indexed for MEDLINE]标记表示[注] 截止2006年3月15日PubMed公布的数据16技术课件 uIn process citationu提供MEDLINE尚未经规范处理的数据u获MeSH词后，再加入MEDLINEu记录中用[PubMed-in process]标记表示17技术课件 uPublisher Supplied Citationsu出版商直接向PubMed提供电子记录u包括MEDLINE未收录的部分记录u记录中用[PubMed-as supplied by publisher]标记表示18技术课件 uOldMedlineu1950-1965年间发表的200多万篇文献u没有MeSH字段和摘要u记录中用[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966]标记表示。
19技术课件 uPubMed not MedlineuPubMed收录Medline不收录的文献u记录中用[PubMed]标记表示20技术课件 PreMedlinePreMedlinePubMedPubMedMedlineMedline21技术课件 PubMed与与MEDLINE的区别的区别u收录范围广：uMEDLINE收录的部分生命科学相关文章的非医学专业期刊（物理、天文、化学等）u收录记录新：u在MEDLINE数据标引前的最新题录u文献类型全：u提供电子原文链接（部分免费）22技术课件 认识新版认识新版PubMeduPubMed首页uPubMed检索结果页uPubMed结果显示uPubMed摘要显示23技术课件 新版PubMed特色：简洁、清新检索速度较快24技术课件 www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmedwww.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed常用工具常用工具常用工具常用工具Welcome to PubMedWelcome to PubMed使用帮助使用帮助使用帮助使用帮助更多服务更多服务更多服务更多服务检索词输入框检索词输入框检索词输入框检索词输入框25技术课件 出处出处出处出处SOSO篇名篇名篇名篇名TITI作者作者作者作者AUAU文献类型文献类型文献类型文献类型( (状态状态状态状态) )SummarySummary结果筛选结果筛选结果筛选结果筛选检索提示检索提示检索提示检索提示认识认识新版新版PubMed26技术课件 认识认识新版新版PubMed调整显示设置调整显示设置调整显示设置调整显示设置可改变显示模可改变显示模可改变显示模可改变显示模式，显示数量式，显示数量式，显示数量式，显示数量及检索结果排及检索结果排及检索结果排及检索结果排序序序序显示设置显示设置显示设置显示设置显示摘要显示摘要显示摘要显示摘要显示数量显示数量显示数量显示数量排序模式排序模式排序模式排序模式27技术课件 在摘要显示模在摘要显示模在摘要显示模在摘要显示模式下可以看到式下可以看到式下可以看到式下可以看到详细的文献信详细的文献信详细的文献信详细的文献信息息息息作者地址作者地址作者地址作者地址文献摘要文献摘要文献摘要文献摘要文献作者文献作者文献作者文献作者文献篇名文献篇名文献篇名文献篇名全文链接全文链接全文链接全文链接文献类型文献类型文献类型文献类型文献主题词文献主题词文献主题词文献主题词认识认识新版新版PubMed28技术课件 出版社上传出版社上传出版社上传出版社上传PreMedlinePreMedlinePubMedPubMedMedlineMedlinePubMedPubMed数据数据数据数据库收录的文献库收录的文献库收录的文献库收录的文献的状态，主要的状态，主要的状态，主要的状态，主要为为为为MedlineMedline相关数据库检索相关数据库检索相关数据库检索相关数据库检索检索详情检索详情检索详情检索详情认识认识新版新版PubMed29技术课件 非英文的文献非英文的文献非英文的文献非英文的文献篇名上有中括篇名上有中括篇名上有中括篇名上有中括号号号号[ ][ ]且注明且注明且注明且注明有语种有语种有语种有语种英文文献英文文献英文文献英文文献土耳其语土耳其语土耳其语土耳其语[ [ 篇名篇名篇名篇名 ] ]英文文献英文文献英文文献英文文献认识认识新版新版PubMed30技术课件 电子优先即最电子优先即最电子优先即最电子优先即最新文献，一般新文献，一般新文献，一般新文献，一般比印刷出版提比印刷出版提比印刷出版提比印刷出版提前三个月以上前三个月以上前三个月以上前三个月以上电子优先电子优先电子优先电子优先20092009年年年年5 5月月月月20082008年年年年9 9月月月月认识认识新版新版PubMed31技术课件 PubMed检索方法检索方法uPubMed基本检索uPubMed高级检索uPubMed限定检索uPubMed主题检索u临床查询检索uPubMed全文获取32技术课件 PubMed基本检索基本检索u在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写均可），点击GO按钮，PubMed系统会自动在主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中查询与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的“自动词汇匹配功能”。
u例如：检索肿瘤 (cancer)方面的文章u在检索框中输入：“cancer”，再点击“Go”按钮 PubMed将自动地利用它的“自动词汇匹配”功能将重要的词语结合在一起，并将不规范的词语转换成MeSH词表中规范的用词进行检索，比如，检索“cancer” 将自动转换为："neoplasms"[MeSH Terms] OR "neoplasms"[All Fields] OR "cancer"[All Fields]33技术课件 u自自动转换匹配：匹配： PubMed对输入入检索框中的索框中的检索索词进行智能化地校行智能化地校对，，将其逐步地与其数据将其逐步地与其数据库中的各中的各类术语匹配匹配的原的原则MeSH Translation Table主题词注释表主题词注释表Journals Translation Table期刊注释表期刊注释表Common Phrase List常用词组表常用词组表Author Index作者索引表作者索引表No MappingNo Mapping检索词拆分检索词拆分AND34技术课件 自由词检索时自由词检索时自由词检索时自由词检索时PubMedPubMed自动自动自动自动将不规范的词将不规范的词将不规范的词将不规范的词转换成规范的转换成规范的转换成规范的转换成规范的词进行检索词进行检索词进行检索词进行检索自动词汇自动词汇自动词汇自动词汇转换转换转换转换PubMed基本基本检索检索35技术课件 布尔逻辑组合布尔逻辑组合布尔逻辑组合布尔逻辑组合检索，常用的检索，常用的检索，常用的检索，常用的逻辑关系词有逻辑关系词有逻辑关系词有逻辑关系词有ANDAND，，，，OROR，，，，NOTNOT等等等等A BA B 逻辑逻辑与（与（与（与（ANDANDANDAND）））） --------检检出出出出记录记录中同中同中同中同时时含有含有含有含有检检索索索索词词A A A A和和和和检检索索索索词词B.B.B.B. 如：如：如：如：A AND BA AND BA AND BA AND B 逻辑逻辑非（非（非（非（NOTNOTNOTNOT）））） --------在含在含在含在含检检索索索索词词A A A A的的的的记录记录中，去掉含中，去掉含中，去掉含中，去掉含检检索索索索词词B B B B的的的的记录记录。
如：如：如：如：A NOT BA NOT BA NOT BA NOT B 逻辑逻辑或（或（或（或（OROROROR）））） --------检检出出出出记录记录中含有中含有中含有中含有检检索索索索词词A A A A或或或或检检索索索索词词B B B B或同或同或同或同时时含有含有含有含有检检索索索索词词A A A A和和和和B B B B的文献 如：如：如：如：A OR BA OR BA OR BA OR BA BPubMed基本基本检索检索36技术课件 作者姓名作者姓名检检索索 按照姓按照姓+ +名名缩缩写（不用写（不用标标点）的格式点）的格式键键入作者姓名，如：入作者姓名，如：smith jasmith ja或或jones k, jones k, 系系统统会自会自动动在作者字段内在作者字段内进进行行检检索。
姓名第一个字母可用大写也可索姓名第一个字母可用大写也可用小写，姓前名后用小写，姓前名后, ,姓用全称，名字一般用姓用全称，名字一般用缩缩写 考考虑虑到作者姓名的不同形式，到作者姓名的不同形式，PubMedPubMed采用自采用自动转换动转换功能功能进进行作者姓行作者姓名名检检索，如：索，如：smith jsmith j将将检检索成索成smith ja,smith jb,smith jr smith ja,smith jb,smith jr 等 精确精确检检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段限定索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段限定[AU][AU]，如：，如："smith j"[au]"smith j"[au]，，这样这样可避免可避免PubMedPubMed自自动转换动转换，，实现实现精确精确查查找PubMed基本基本检索检索37技术课件 作者姓名检索作者姓名检索作者姓名检索作者姓名检索按照姓按照姓按照姓按照姓( (全写全写全写全写) )++名名名名( (缩写缩写缩写缩写) )，，，，之间不用标点之间不用标点之间不用标点之间不用标点键入作者姓名键入作者姓名键入作者姓名键入作者姓名smith jsmith jPubMed基本基本检索检索38技术课件 精确检索避免精确检索避免精确检索避免精确检索避免PubMedPubMed自动自动自动自动词汇转换，实词汇转换，实词汇转换，实词汇转换，实现精确查找现精确查找现精确查找现精确查找"smith j"[au]"smith j"[au]PubMed基本基本检索检索39技术课件 期刊期刊检检索索 在在检检索框中索框中键键入期刊名，如：入期刊名，如：molecular biology of the molecular biology of the cellcell，系，系统统的的““自自动词语动词语匹配匹配””功能会将它功能会将它转换转换成成mol biol mol biol cell[journal]cell[journal]进进行行检检索。
索 也可以直接也可以直接输输入入MedlineMedline的期刊的期刊标标准准缩缩写形式，如：写形式，如：mol mol biol cellbiol cell，或者是，或者是输输入刊物的入刊物的ISSNISSN（国（国际标际标准出版物代准出版物代码码））进进行行检检索，如：索，如：1059-15241059-1524 如果一个如果一个杂杂志名恰好是主志名恰好是主题词题词或关或关键词键词，如：，如：cancercancer，， sciencescience，，cellcell等，等，PubMedPubMed会首先将会首先将这这些些词转换词转换成成MeSHMeSH词词表中的表中的主主题词进题词进行行检检索因此，需要将索因此，需要将检检索索请请求求进进行行标标准化准化处处理，即理，即在在杂杂志名后面加志名后面加[TA][TA]如："cell"[ta]"cell"[ta]PubMed基本基本检索检索40技术课件 期刊的一般检期刊的一般检期刊的一般检期刊的一般检索，是在检索索，是在检索索，是在检索索，是在检索输入框中键入输入框中键入输入框中键入输入框中键入期刊名或期刊期刊名或期刊期刊名或期刊期刊名或期刊的的的的ISSNISSN号号号号Eur J ImmunolEur J ImmunolPubMed基本基本检索检索41技术课件 期刊的标准检期刊的标准检期刊的标准检期刊的标准检索，是在期刊索，是在期刊索，是在期刊索，是在期刊名后面加字段名后面加字段名后面加字段名后面加字段限定限定限定限定[TA]. [TA]. 比比比比如如如如:"cell"[ta]:"cell"[ta]"cell"[ta]"cell"[ta]PubMed基本基本检索检索42技术课件 期刊数据库（journal database)期刊数据库的作用：1、可以查看期刊的详细信息，包括出版国家，出版社，出版语言，期刊类目等等；2、可以根据期刊的主题分类，查看medline收录的各学科的期刊，比如查看medline收录的关于麻醉学(Anesthesiology)方面的期刊；2、方便检索某本期刊上被PubMed收录的所有文章。
比如：我们想知道期刊Acad Pediatr的全称以及具体的出版社，以方便投稿，如何查？操作方法：点击导航栏上的Journal database，打开期刊数据库检索界面，在检索框中输入Acad Pediatr，再点击Go按钮即可PubMed基本基本检索检索43技术课件 期刊数据库在期刊数据库在期刊数据库在期刊数据库在PubMedPubMed首页首页首页首页导航栏的右下导航栏的右下导航栏的右下导航栏的右下角部分角部分角部分角部分期刊数据库期刊数据库期刊数据库期刊数据库PubMed基本基本检索检索44技术课件 期刊数据库可期刊数据库可期刊数据库可期刊数据库可以查看指定期以查看指定期以查看指定期以查看指定期刊的详细信息刊的详细信息刊的详细信息刊的详细信息ElsevierElsevier出版出版出版出版期刊数据库期刊数据库期刊数据库期刊数据库PubMed基本基本检索检索45技术课件 按期刊主题浏按期刊主题浏按期刊主题浏按期刊主题浏览览览览medlinemedline收收收收录的各学科的录的各学科的录的各学科的录的各学科的期刊期刊期刊期刊期刊主题期刊主题期刊主题期刊主题期刊数据库期刊数据库期刊数据库期刊数据库PubMed基本基本检索检索46技术课件 按字母顺序浏按字母顺序浏按字母顺序浏按字母顺序浏览览览览medlinemedline收收收收录的各学科期录的各学科期录的各学科期录的各学科期刊刊刊刊麻醉学方面麻醉学方面麻醉学方面麻醉学方面PubMed基本基本检索检索47技术课件 期刊数据库可期刊数据库可期刊数据库可期刊数据库可以方便的查看以方便的查看以方便的查看以方便的查看medlinemedline收录收录收录收录的各学科方面的各学科方面的各学科方面的各学科方面的期刊的期刊的期刊的期刊medlinemedline收录的麻收录的麻收录的麻收录的麻醉学方面的期刊醉学方面的期刊醉学方面的期刊醉学方面的期刊PubMed基本基本检索检索48技术课件 截词检索截词检索的作用：扩大检索范围，提高查全率。
截词符：用*表示，代表多个字符，将*加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索如：bacter*，可以检出bacter，bacteria， bacteriophage ，bacterium，等最多600个单词PubMed基本基本检索检索49技术课件 截词检索可以截词检索可以截词检索可以截词检索可以扩大检索范围扩大检索范围扩大检索范围扩大检索范围提高查全率提高查全率提高查全率提高查全率bacter*[bacter*[TITI] ]PubMed基本基本检索检索50技术课件 字段限制字段限制字段限制字段限制检检索索索索采用字段限制方式采用字段限制方式采用字段限制方式采用字段限制方式进进行行行行检检索，其索，其索，其索，其规则规则是：是：是：是：检检索索索索词词1[1[1[1[字段字段字段字段标识标识] ] ] ] 逻辑逻辑运算符运算符运算符运算符 检检索索索索词词2[2[2[2[字段字段字段字段标识标识] ] ] ]如：如：如：如：查查找作者找作者找作者找作者为为crickcrickcrickcrick在在在在1993199319931993年年年年发发表的有关表的有关表的有关表的有关DNADNADNADNA方面的文献方面的文献方面的文献方面的文献. . . .检检索式：索式：索式：索式：DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]PubMed基本基本检索检索51技术课件 字段限制检索字段限制检索字段限制检索字段限制检索其规则是：检其规则是：检其规则是：检其规则是：检索词索词索词索词+[+[字段字段字段字段标识标识标识标识] ] DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]PubMed基本基本检索检索52技术课件 常用检索字段描述和标识Title[ti]：篇名字段Abstract[ab]：摘要字段Affiliation [ad]：著者地址字段。
Author name[au]：文章的作者，检索格式：姓+名如："smith ja"[au]Journal title[ta]：期刊名称如：cell[ta]Language[la]：论文出版语种语种检索时可只输入前3个字母，如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la]比如：检索文章题目中含有高血压的中文文献检索式:hypertension[ti] AND chi[la]PubMed基本基本检索检索53技术课件 hypertension[ti] AND chi[la]hypertension[ti] AND chi[la]检索文章题目检索文章题目检索文章题目检索文章题目中含有高血压中含有高血压中含有高血压中含有高血压的中文文献的中文文献的中文文献的中文文献PubMed基本基本检索检索54技术课件 常用检索字段描述和标识Publication date[dp]:出版日期指论文所在期刊的出版日期日期检索的形式为：YYYY/MM/DD[DP]要检索一段时期内的文章，日期之间可以加冒号，如：1993/01:1995/06[DP]Publication type[pt]:出版类型。
有综述，新闻，传记，临床试验等如：review[pt]MeSH terms[mh]：主题词字段如：hypertension[mh]Subheadings[sh]:副主题词与主题词组配检索.比如：检索1995年到1996年出版的关于高血压方面的综述性文献hypertension[mh] AND 1995/01:1996/12[DP] AND review[pt]PubMed基本基本检索检索55技术课件 检索检索检索检索 19951995 年年年年到到到到 19961996 年出年出年出年出版的关于高血版的关于高血版的关于高血版的关于高血压方面的综述压方面的综述压方面的综述压方面的综述性文献性文献性文献性文献hypertension[mh] AND hypertension[mh] AND 1995/01:1996/12[DP] AND review[pt]1995/01:1996/12[DP] AND review[pt]PubMed基本基本检索检索56技术课件 强制检索功能PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索如：在PubMed主页的检索提问框中键入“single cell”，并用双引号引起来。
点击“GO”按钮，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成2个词：single和cell检索，其检索表达式为：single AND cell. 很明显这样的检索结果是不符号要求的PubMed基本基本检索检索57技术课件 强制检索强制检索强制检索强制检索普通检索普通检索普通检索普通检索"single cell""single cell"single cellsingle cellPubMed基本基本检索检索58技术课件 高级检索高级检索高级检索高级检索PubMed高级高级检索检索59技术课件 PubMed高级高级检索检索预览预览预览预览检索详情检索详情检索详情检索详情检索史检索史检索史检索史高级检索界面高级检索界面高级检索界面高级检索界面下可以看到明下可以看到明下可以看到明下可以看到明细栏，预览，细栏，预览，细栏，预览，细栏，预览，检索史，限定检索史，限定检索史，限定检索史，限定和组合检索等和组合检索等和组合检索等和组合检索等姚开泰院士姚开泰院士姚开泰院士姚开泰院士20012001年年年年以来被以来被以来被以来被MedlineMedline收录的文献收录的文献收录的文献收录的文献60技术课件 PubMed限定限定检索检索限定检索范围限定检索范围限定检索范围限定检索范围为发表在临床为发表在临床为发表在临床为发表在临床核心期刊上的核心期刊上的核心期刊上的核心期刊上的有全文链接的有全文链接的有全文链接的有全文链接的英文文献英文文献英文文献英文文献出版时间出版时间出版时间出版时间临床核心期刊临床核心期刊临床核心期刊临床核心期刊限定为英文限定为英文限定为英文限定为英文LimitLimit限定限定限定限定有全文链接有全文链接有全文链接有全文链接文献类型文献类型文献类型文献类型年龄段年龄段年龄段年龄段61技术课件 PubMed主题检索主题检索《医学主题词表》数据库(MeSH Database) 《医学主题词表》是对生物医学文献进行主题分析、标引和检索的权威性词表，它的作用是使医学文献的主题标引和检索达到统一和一致，并指导用户高质量地检索医学文献。
它可以指导用户从同义词发现主题词，告诉用户主题词如何使用，显示主题词之间的相互关系62技术课件 《医学主题词表》数据库(MeSH Database)利用主题词进行检索方法:1、点击主页右下角的MeSH Database进入主题词检索界面；2、输入检索词后，点击go按钮，系统将显示与该词有关主题词；3、点击该主题词进一步显示该主题词的定义、树状结构、组配的副主题词；4、选择合适的主题词与副主题词后，点击send to按钮，进入检索表达式浏览窗口；5、点击Search PubMed将显示检索结果PubMed主题检索主题检索63技术课件 主题词数据库主题词数据库主题词数据库主题词数据库在在在在PubMedPubMed首首首首页导航栏的右页导航栏的右页导航栏的右页导航栏的右下角下角下角下角主题词数据库主题词数据库主题词数据库主题词数据库PubMed主题检索主题检索64技术课件 输入普通词输入普通词输入普通词输入普通词查找对应主题词查找对应主题词查找对应主题词查找对应主题词MeSHMeSH主题词检索可主题词检索可主题词检索可主题词检索可以指导用户高以指导用户高以指导用户高以指导用户高质量地检索医质量地检索医质量地检索医质量地检索医学文献学文献学文献学文献PubMed主题检索主题检索65技术课件 一般一个主题一般一个主题一般一个主题一般一个主题词还要配合一词还要配合一词还要配合一词还要配合一个副主题词进个副主题词进个副主题词进个副主题词进行组合检索行组合检索行组合检索行组合检索选择副主题词选择副主题词选择副主题词选择副主题词PubMed主题检索主题检索66技术课件 Search Box with ANDSearch Box with AND点点点点Sent toSent to 将将将将检索词添加到检索词添加到检索词添加到检索词添加到检索表达式浏检索表达式浏检索表达式浏检索表达式浏览窗口览窗口览窗口览窗口PubMed主题检索主题检索67技术课件 Search PubMedSearch PubMed主题词检索可主题词检索可主题词检索可主题词检索可以达到比较满以达到比较满以达到比较满以达到比较满意的查全率和意的查全率和意的查全率和意的查全率和查准率查准率查准率查准率PubMed主题检索主题检索68技术课件 主题词检索是主题词检索是主题词检索是主题词检索是在有主题标引在有主题标引在有主题标引在有主题标引的的的的MedlineMedline数数数数据库中检索据库中检索据库中检索据库中检索主题词检索结果主题词检索结果主题词检索结果主题词检索结果PubMed主题检索主题检索69技术课件 普通词不是规普通词不是规普通词不是规普通词不是规范化的主题词范化的主题词范化的主题词范化的主题词检索结果相关检索结果相关检索结果相关检索结果相关度低度低度低度低普通普通普通普通词检索结果词检索结果词检索结果词检索结果PubMed主题检索主题检索70技术课件 PubMed记录字段说明记录字段说明文摘文摘第一著者单位地址第一著者单位地址出版商提供文献识别号出版商提供文献识别号著者群著者群版权说明版权说明参考评论文献参考评论文献合著者合著者文献参考评论文献参考评论定稿版定稿版校样版校样版输入日期输入日期输入完成日期输入完成日期电子出版日期电子出版日期71技术课件 电子出版日期电子出版日期文献出版日期文献出版日期数据加入数据加入PubMed日期日期文献勘误文献勘误参考文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部著者姓名全部调研者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称作为文章主题的著者全称文献相关注释文献相关注释基金编号基金编号基因符号基因符号期编号期编号资助调研者资助调研者资助调研单位资助调研单位国际标准期刊号国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号美国立医学图书馆识别号期刊全称期刊全称72技术课件 最后修订日期最后修订日期规范词表词规范词表词规范词确立日期规范词确立日期系统组织的文摘系统组织的文摘版权拥有者版权拥有者题录提供机构的识别号题录提供机构的识别号病史相关与原始记录病史相关与原始记录其他关键词其他关键词提供其他关键词的机构提供其他关键词的机构数据提供者机构数据提供者机构文章总页数文章总页数出版商提供数据时间出版商提供数据时间期刊出版国期刊出版国数据库文献编号数据库文献编号73技术课件 作为主题词的个人姓名作为主题词的个人姓名出版状态出版状态文献类型文献类型出版模式（纸张或电子）出版模式（纸张或电子） 参考文献数参考文献数已撤回的文献已撤回的文献酶或化学物质代码酶或化学物质代码正在撤消中的文章正在撤消中的文章初版文献初版文献修订和再版的文章修订和再版的文章子专题文档子专题文档太空署提供的数据太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号分子序列访问号原文来源原文来源引用了病例的文献内部处理代码引用了病例的文献内部处理代码74技术课件 临床查询检索临床查询检索 ““Clinical queriesClinical queries””是是专门为临专门为临床医生研究床医生研究设计设计的内置的的内置的临临床方法学床方法学““过滤过滤器器”” （（Clinical Methodology FiltersClinical Methodology Filters），），这组检这组检索策略模型是由加拿大索策略模型是由加拿大临临床流行病学和生物床流行病学和生物统计统计学研究人学研究人员员Haynes RBHaynes RB等人在等人在19941994年提出来的，并年提出来的，并进进行了行了查查全率和全率和查查准率准率分析。
用分析用户户通通过这过这一一临临床方法学床方法学检检索索过滤过滤器，不需掌握复器，不需掌握复杂杂的的检检索策略，即可索策略，即可检检索所需的索所需的临临床研究文献床研究文献75技术课件 使用方法使用方法: :1 1、点、点击击主主页页左左侧导侧导航航栏栏的的Clinical QueriesClinical Queries进进入入临临床床查询页查询页面；面；2 2、在、在检检索框中索框中输输入入检检索索词词，并，并选择选择副主副主题词组题词组配，指定配，指定检检索索结结果是果是查查全全(sensitive)(sensitive)，，还还是是查查准准(specific)(specific)；；3 3、点、点击击GOGO按按钮执钮执行行检检索例如：例如：检检索索““鼻咽癌鼻咽癌nasopharyngeal cancernasopharyngeal cancer治治疗疗方面的研究文方面的研究文献献””临床查询检索临床查询检索76技术课件 临床查询在临床查询在临床查询在临床查询在PubMedPubMed首首首首页导航栏的页导航栏的页导航栏的页导航栏的中间部分中间部分中间部分中间部分临床查询临床查询临床查询临床查询临床查询检索临床查询检索77技术课件 临床查询主要临床查询主要临床查询主要临床查询主要用于检索临床用于检索临床用于检索临床用于检索临床方面的研究文方面的研究文方面的研究文方面的研究文献献献献临床查询检索临床查询检索临床查询检索临床查询检索临床查询检索临床查询检索78技术课件 临床查询主要临床查询主要临床查询主要临床查询主要包括某种疾病包括某种疾病包括某种疾病包括某种疾病的治疗，诊断的治疗，诊断的治疗，诊断的治疗，诊断病因和预后四病因和预后四病因和预后四病因和预后四个方面个方面个方面个方面检索检索检索检索结果结果结果结果临床查询检索临床查询检索79技术课件 PubMed全文获取全文获取 通通过过PubMedPubMed检检索出来的文献，部分我索出来的文献，部分我们们通通过浏览过浏览摘要即可，摘要即可，部分我部分我们还们还需要需要查查看全文，以作看全文，以作进进一步的研究，那么，我一步的研究，那么，我们们如如何何获获取全文呢？取全文呢？一：免一：免费费的全文的全文80技术课件 PubMedPubMed收录收录收录收录的文献大约有的文献大约有的文献大约有的文献大约有10%10%是免费的是免费的是免费的是免费的可以直接打开可以直接打开可以直接打开可以直接打开全文全文全文全文免费全文可直接打开免费全文可直接打开免费全文可直接打开免费全文可直接打开PubMed全文获取全文获取81技术课件 打开打开打开打开PDFPDF全文全文全文全文免费的全文并免费的全文并免费的全文并免费的全文并不代表学术价不代表学术价不代表学术价不代表学术价值低，大部分值低，大部分值低，大部分值低，大部分的生命科学的的生命科学的的生命科学的的生命科学的全文都是免费全文都是免费全文都是免费全文都是免费的的的的PubMed全文获取全文获取82技术课件 二：学校已二：学校已二：学校已二：学校已订购订购的全文的全文的全文的全文 如果我如果我如果我如果我们们所需要的文献，学校已所需要的文献，学校已所需要的文献，学校已所需要的文献，学校已订购订购了了了了该该文献所在的全文型文献所在的全文型文献所在的全文型文献所在的全文型数据数据数据数据库库，我，我，我，我们们也可以直接打开或到相也可以直接打开或到相也可以直接打开或到相也可以直接打开或到相应应的全文数据的全文数据的全文数据的全文数据库库中中中中查查找。
找PubMed全文获取全文获取83技术课件 国内出版的期国内出版的期国内出版的期国内出版的期刊，学校一般刊，学校一般刊，学校一般刊，学校一般都有订购，请都有订购，请都有订购，请都有订购，请查找清华同方查找清华同方查找清华同方查找清华同方或维普，万方或维普，万方或维普，万方或维普，万方学校学校学校学校已订购已订购已订购已订购PubMed全文获取全文获取84技术课件 SpringerLinkSpringerLink和和和和EBSCOEBSCO等外等外等外等外文全文库，一文全文库，一文全文库，一文全文库，一般学校也有订般学校也有订般学校也有订般学校也有订购购购购学校已订购PubMed全文获取全文获取85技术课件 学校未订购的学校未订购的学校未订购的学校未订购的全文，如果不全文，如果不全文，如果不全文，如果不是免费的，一是免费的，一是免费的，一是免费的，一般需要付费般需要付费般需要付费般需要付费学校未学校未学校未学校未订购订购订购订购PubMed全文获取全文获取86技术课件 三：文献三：文献三：文献三：文献传递传递服服服服务务系系系系统统 没有免没有免没有免没有免费费的全文以及学校未的全文以及学校未的全文以及学校未的全文以及学校未订购订购的全文，一般需要付的全文，一般需要付的全文，一般需要付的全文，一般需要付费费才可才可才可才可以看到，以看到，以看到，以看到，这类这类文献我文献我文献我文献我们们可以通可以通可以通可以通过过基于基于基于基于馆际馆际互借的文献互借的文献互借的文献互借的文献传递传递服服服服务务系系系系统统来来来来获获取。
取PubMed全文获取全文获取87技术课件 PubMed RSSPubMed RSS学科跟踪学科跟踪学科跟踪学科跟踪 RSS，也称为“RSS 源”、“XML源”或“Web 源”等，通常在时效性比较强的内容上使用RSS订阅能更快速获取最新信息，利用PubMed的RSS服务，有利于第一时间获取国际上关于某课题或某一方面的最新报道 比如，我是一名临床大夫，我比较关注国际上关于鼻咽癌nasopharyngeal cancernasopharyngeal cancer治疗方面的最新报道，我该如何订阅这个最新报道（RSS）呢？ 订阅最新报道（RSS）首先需要自己制定一个检索式：88技术课件 需要订阅临床需要订阅临床需要订阅临床需要订阅临床方面的最新报方面的最新报方面的最新报方面的最新报道道道道(RSS)(RSS)，建，建，建，建议通过临床查议通过临床查议通过临床查议通过临床查询来检索询来检索询来检索询来检索制定检索式制定检索式制定检索式制定检索式PubMed RSSPubMed RSS学科跟踪学科跟踪学科跟踪学科跟踪89技术课件 说明：说明：u订阅临床方面的RSS（比如某种疾病的诊断或治疗等），建议通过临床查询(Clinical Queries)来检索，这样可以确保检索质量；u订阅课题方面的RSS，建议通过自由词来检索，这样可以检索到最新的电子优先文献，若检索结果在100条以上，建议进一步限定；u首次订阅PubMed RSS，系统默认会为订阅者提供目前所能检索到的所有文献的全文，如果您只需要以后更新的最新文献(不需要这些目前能检索到的文献)，请单独说明。
PubMed RSSPubMed RSS学科跟踪学科跟踪学科跟踪学科跟踪90技术课件 检索策略可以检索策略可以检索策略可以检索策略可以反复的修改，反复的修改，反复的修改，反复的修改，直到满意后再直到满意后再直到满意后再直到满意后再申请订阅最新申请订阅最新申请订阅最新申请订阅最新报道报道报道报道(RSS)(RSS)点击点击点击点击 RSSRSSPubMed RSSPubMed RSS学科跟踪学科跟踪学科跟踪学科跟踪91技术课件 系统要求为订系统要求为订系统要求为订系统要求为订阅的阅的阅的阅的RSSRSS起个起个起个起个名字，我们可名字，我们可名字，我们可名字，我们可以按系统默认以按系统默认以按系统默认以按系统默认直接点创建直接点创建直接点创建直接点创建点创建点创建点创建点创建Create Create FeedFeed PubMed RSSPubMed RSS学科跟踪学科跟踪学科跟踪学科跟踪92技术课件 红色的标记红色的标记红色的标记红色的标记“ “XML”XML”即为订即为订即为订即为订阅的阅的阅的阅的RSSRSS文件文件文件文件我们需要复制我们需要复制我们需要复制我们需要复制这个文件这个文件这个文件这个文件点鼠标右键点鼠标右键点鼠标右键点鼠标右键 选择选择选择选择“ “复制快捷复制快捷复制快捷复制快捷方式方式方式方式( (T T) )” ” PubMed RSSPubMed RSS学科跟踪学科跟踪学科跟踪学科跟踪93技术课件 uuRSS需要有需要有阅读器才能使用，器才能使用，这样的的阅读器很多，器很多，有在有阅读器（打开一个网址就可以），离器（打开一个网址就可以），离线阅读器（安装器（安装软件），如博件），如博阅。
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