病毒感染细胞实验整体流程及原理1.1慢病毒1.1.1原理慢病毒（Lentivirus ）是逆转录病毒的一种构建的siRNA/miRNA慢病毒载体，与化学合 成的siRNA和基于瞬时表达载体构建的普通 siRNA载体相比，一方面可以扩增替代瞬时表达载体使用，另一方面，Len tivirus-siRNA克隆经过慢病毒包装系统包装后， 可用于感染依靠传统转染试剂难于转染的细胞系如原代细胞、悬浮细胞和处于非分裂状态的细胞，并且在感 染后可以整合到受感染细胞的基因组，进行长时间的稳定表达1.1.2特点1） 直接包装成为假病毒颗粒， 对分裂和非分裂细胞均有感染作用， 适合RNAi研究和体内实验中难于转染的细胞（比如神经元细胞、干细胞或其它原代细胞 ）2） 可以通过简单方式，在短时间内获得稳定表达特定基因的多种细胞株3 ）可用于基因敲除、基因治疗和转基因动物研究4） 无需任何转染试剂，操作简便5） 可以根据客户需要制备多种标记1.1.3慢病毒包装简要流程：1 ）含有目的基因的慢病毒 RNA i干扰载体的构建和质粒纯化提取2） 慢病毒载体，包装系统共转染病毒包装细胞 293T等3） 培养48hrs-72hrs左右，收集含有病毒的上清培养液。
4） 病毒的纯化和浓缩5） 分装、-80C保存6 ）滴度测定目的基因检定，并出具检测报告1.3、慢病毒和腺病毒的比较慢病毒载体系统和腺病毒载体系统比较病毒表达系统慢病毒表达系统（Len tivirus）腺病毒表达系统（Ade novirus）病毒基因组RNA病毒双链DNA病毒复制自主复制自主复制是否整合病毒基因组整合于宿主基因组，长时间、稳定表达外源基因病毒基因组游离于宿主基因组外，瞬时表达外源基因感染细胞类型感染分裂和不分裂细胞，适用于难转染的原代细胞（如神经细胞）及体内实验感染分裂和不分裂细胞表达风度中水平表达高水平表达表达时间慢（1-3天）快（1-2天）滴度滴度最高可达10*8pfU/ml滴度最高可达10*11pfU/ml克隆容量可插入不超过8kb的外源片段，滴度随插入片段长度增加而降低可插入高达8kb的外源片段，滴度随插入片段长度增加而降低免疫原性低免疫原性高免疫原性2、构建目的基因到载体2.1构建手段一般是根据原始质粒信息确定克隆方案，有以下两种手段1） 如果原始质粒载体有匹配酶切位点，采用相应的内切酶切下相应片段，回收并连接到载体，酶切，并测序鉴定2） 如果没有匹配的酶切位点，则设计带有特殊接头的引物进行 PCR扩增，得到目的片段, 采用相应的内切酶切下相应片段，回收并连接到穿梭载体，酶切，并测序鉴定2.2质粒载体2.2.1概念能够进行自主复制的环状 DNA双链结构，包括真核生物的细胞器（主要指线粒体和叶 绿体）中和细菌细胞拟核区以外的环状脱氧核糖核酸 （DNA）分子2.2.2特征质粒上常有抗生素的抗性基因，例如，四环素抗性基因或卡那霉素抗性基因等。
有些质粒称为附加体（episome）,这类质粒能够整合进真菌的染色体，也能从整合位置上切离下 来成为游离于染色体外的 DNA分子质粒在宿主细胞体内外都可复制通过个些特性，人 们可以把一些目的 DNA片断构建在质粒中，通过转化入大肠杆菌中，利用选择培养基来筛 选从而不断的复制，来得到目的产物 （为了扩增DNA）3、质粒DNA在大肠杆菌里转化然后提取质连接上目的基因的质粒转化大肠杆菌是为了让目的基因在大肠杆菌里扩增,粒，以下是质粒 DNA在大肠杆菌里转化的三步骤 （为什么不进行PCR因为不能做3.1大肠杆菌感受态细胞的制备1 ）从大肠杆菌平板上挑取一个单菌落于 3mlLB培养基的试管中，37C振荡培养过夜2） 取0.4ml菌液转接到40mlLB液体培养基中，37C振荡培养2~3h3） 菌液转移到50ml离心管中，冰上放置 10min4） 4 C离心 10min （4000r/min ）5） 倒出培养液，将管口倒置以便培养液流尽6） 用冰浴的0.1mol/L氯化钙10ml悬浮细胞沉淀，立即冰浴 30min7） 4 C离心 10min （4000r/min ）8） 倒出上清液，用冰浴的 0.1mol/L氯化钙2ml悬浮细胞（冰上放置）9） 分装细胞，200ul 一份，4C保存3.2质粒DNA的转化1 ）取200ul新鲜制备的感受态细胞，加入质粒 DNA2ul混匀，冰浴30min2） 离心管放到42 C保温90s3） 冰浴2min4） 每管加800ulLB液体培养基，37C培养1h （150r/min ）5） 取适当体积（100ul）的复苏细胞，涂布在选择性培养基上，正置 30min6） 倒置平皿37C, 12~16h，出现菌落3.3质粒提取步骤1 ）取1~4ml在LB培养基中培养过夜的菌液， 12000转离心1min，弃上清2 ）加250ul溶液I /RNaseA （溶液I为细胞悬浮液）混合液，漩涡剧烈振荡直至菌体完全重 新悬浮，室温静置 1-2min。
3） 加入250ul溶液n （细胞裂解液），轻柔的反复颠倒混匀 5-6次室温放置1-2min，使菌 体充分裂解，直至形成澄清的裂解溶液4） 加入350ul溶液川（中和液），立刻轻柔地反复颠倒混匀 5-6次，此时会出现白色絮状沉 淀5） 12000室温离心10min，收集上清6） 将上清置于 DNA纯化柱中，静置 1-2min7） 12000转离心1min，弃滤液8）加入500ul溶液PB（洗涤液）12000转离心1min，弃滤液，目的是将硅胶膜上吸附的蛋白、盐等杂质洗脱，以获得高质量质粒 DNA9） 加入500ul溶液W （去盐液），12000转离心1min，弃滤液，重复一次10） 12000转离心3min，以彻底去除纯化柱中残留的液体11） 将DNA纯化柱置于新的离心管中，悬浮滴加 50-100ul溶液Eluent （为无菌的双蒸水，PH 为 8.0-8.5），室温放置 2min12） 12000转离心1min，此时管底即为高纯度的质粒 DNA,质粒于-20C保存质粒提取步骤：吸取液体培养基于 1.5ml离心管中12000转离心1min，弃上清，吸取培养基重复离心弃上清离心，留取少量菌液作为菌种保存，可直接置于 -20C――加250ulBufferS1悬浮细菌，悬浮均匀一一加250ulBufferS2温和充分的上下翻转 4-6次混合均匀，使菌体裂解——加 350ulBufferS3温和上下翻转12000离心10min ——取上清液转移到专用的制备管 （2ml ）12000转离心1min，弃滤液——加 500ulBufferW112000转离心1min，弃滤液——加 500ulBufferW212000转离心1min，弃滤液，重复一遍——将制备管置回 2ml离心管12000转离心1min ——将制备管移入新的 1.5ml离心管中，加60〜80ulEluent或离子水，室温 1min12000转离心1min ——移去制备管，将有质粒的离心管于 4°C或是-20C保存。
4、质粒DNA和其他包装质粒共转染293T细胞产生病毒（即病毒包装）4.1名词解释4.1.1293T细胞是由293细胞派生，表达〔SV40大T抗原的人肾上皮细胞系|，被广泛应用于瞬时~ 转染以过表达各种目标蛋白 ，|或是用以包装病毒4.1.2脂质体：某些细胞质中的天然脂质小体，可作为生物膜，用于捕获外源性物质后更有效地运送到靶细胞，经同细胞融合而释放4.2共转染的操作步骤第一天：用无抗生素 DMEM+10%FBS（胚胎牛血清）铺板 293FT细胞，2ml/孔（6孔板）确 保第二天细胞密度达到 80%-90%融合度第二天：1.500ul无血清培养基稀释 2ug表达质粒+1.5ugpsPAX+1.5ugpMD2G2.500ul 无血清培养基稀释 15ul 脂质体 2000 （lipofectamine2000 ）3.5min后，将DNA溶液和脂质体溶液混合，室温静止 20min4.从6孔板中吸出1ml无血清培养基，然后滴加入 1ml质粒和脂质体混合物5.6-10h后，移除含有 DNA-脂质体复合物的培养基，代之以正常培养液 DMED+10%FBS（从此刻开始算时间）第三天:1•转染24h后，荧光显微镜下观察，转染效率应达到 70%以上第四天：1•转染后48和72h分别收获含病毒的上清。
2.3000rpm离心20min，0.45um滤膜过滤，去除细胞沉淀3.12000转离心浓缩细胞、分装 -80° C贮存4. 滴度测定目的基因检定，并出具检测报告4.3病毒包装的原理质粒DNA为能转录出慢病毒遗传物质（RNA），但不能翻译出慢病毒的外壳及蛋白成分 的载体质粒，其同时连有目的基因和报告基因， psPAX2为能表达慢病毒外壳的质粒，其表达产物可通过粘附机制更易穿过细胞膜， pMD2.G为慢病毒的膜蛋白质粒，通过lipofectamine2000进行三质粒共转到靶细胞基因组中， 宿主基因组在表达时， 随宿主基因转录出的目的基因 RNA与psPAX2、pMD2.G基因翻译出的蛋白组装为慢病毒在上述程序中提及的“第四天”收集病毒在第五天再用该病毒感染靶细胞， 病毒进细胞后，其遗传物质RNA反转录出DNA，该基因再整合到靶细胞的基因组中，完成转染过程，因为 质粒DNA只能转录出病毒 RNA和表达目的基因却不能表达出病毒的外壳和膜蛋白成分，因 此其不能像普通的病毒一样在宿主细胞能反复增殖， 故对宿主细胞是无害的并且高效的将目的基因转然到靶细胞基因组中5、 慢病毒感染细胞5.1流程图5.2感染步骤1）铺板：将对数生长期的细胞消化重悬后，按 1*105/L密度接种于12孔板，生长过夜2 ）感染：将70-80%铺满12孔板中的培养液吸除，换新鲜的培养液，同时加入 PBS浓度梯度稀释的病毒液，混合均匀后即可放入孵箱培养。
3）24h左右可换液，48小时即可看荧光，具体根据细胞状态来看5.3荧光显微镜的操作流程打开荧光器（30min内不能关闭，否则影响显微镜寿命），细胞培养板置于载物台，调 节物镜和光圈，先用自然光观察视野内细胞，再关闭光，开启荧光通道，观察荧光强度，判 定感染率图片取样前可以调节曝光时间，增益值和彩色度使荧光照片最完美 （针对leica）5.4注意事项内容1. 病毒浓度要适宜，太少的话细胞被感染的也少，但是病毒浓度太大，对细胞有伤害2. 感染病毒时培养基量少， 以保证病毒的浓度， 在培养 10h 左右可根据培养基颜色加培养基3. 在不明确细胞感染复数情况下，可进行浓度梯度感染，计算细胞感染复数4. 在加病毒后一般 24h 左右可换液， 48 小时即可看荧光，具体时间根据细胞状态来看6、感染后的细胞检测方法6.1 荧光初步检测若有荧光， 则表示病毒感染成功， 但并不能确定目的基因是否整合到细胞中， 待进一步 检测，荧光有强弱之分，与病毒加入的量有关6.2RNA的提取及RT-PCF检测6.2.1 原理因为真核细胞 DNA含有很多非编码区， 真核生物的DNA转录成为RNA之后，经过剪切 和拼接，去掉这些非编码区，才能形成真正的 mRNA,,是否表达真核生物的基因并表达相应的蛋白，只能通过提取其 mRNA并RT-P。