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酵母菌DNA的提取

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酵母菌DNA的提取_第1页
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酵母DNA提取方法方法一:石英砂法1、 5000rpmx5min 收集过夜培养的菌体(5ml左右),于 200pL 裂解液(50 mmol/ L Tris-HCl pH 8.0 , 180 mmol/ LEDTA pH 8.0 , 1 % SDS , 现配)中,加入 3/10 总体积石英砂在 涡流混 合器上振荡13min,每隔4min将离心管取 出用力甩几下,然后65°C水浴10min2、 加入 200pL 5mol/L KAc,冰浴 8min ;3、 12000rpmx5min 转移上清至新的离心管中;4、 加入 3 mol/L NaAc 35pl ,加入异丙醇 200pL混匀后冰浴8min,12000rpmx5min 收集沉 淀;5、 200pL TE 溶解,加入 RNase10pL,65C水浴 10min ;6、 加入200pL氯仿一异戊醇(24:1 ),抽提;7、 温柔地取上 清150pL,加入20pL 3 mol/L NaAc 及375pL无水乙醇,混匀后 12000rpmx8min 收集 DNA ;8、 70% 乙醇洗涤沉淀,吹干后 TE溶解,-20 C保藏方法二:蜗牛酶法1. 接种于5 ml的YEPD培养基中在25C -28 C振荡培养12-16 h。

2. 3500 rpm 离心5min沉淀细胞,用1ml的无菌水洗涤一次,再加 0.5ml solution I (1M 山 梨醇,0.1M EDTA, pH=7.5) 重悬3. 转移细胞至1.5 ml的离心管 中,加 入0.1蜗牛酶(30mg/ml)溶液,37C保温30-60min,以 获得原生质体4. 最大转速离心 1min 以沉淀细胞,用 500ulsolution II (50mMTris-HCl, 20mM EDTA,pH=7.4) 溶液悬浮,然后加 入50pl 10% SDS, 混合65C保温30min5. 加入200pl 5M 醋酸钾,放 于冰上30 min6. 最大转速离心15min,转移上清液至新的离心管中,用等体积的异丙醇沉淀DNA7. 室温下放置5min,离心10min,用70%的乙醇洗涤一次,真空干燥,用50ul pH=7.4 TE 溶 液溶解方法三:蜗牛酶过夜处理法将酵母接种到YPD培养基中30°C过夜培养16〜18h,离心收集1.5mL,用灭菌水洗 涤两 次;加入600 u L裂解液,35 u L蜗牛酶,37C消化过夜;加入 饱和酚450 u L,氯仿-异戊醇(体 积比24:1)150 u L,轻轻颠倒混 匀使溶液成为 乳状,并保持10min,3000r/min离心10min ;吸 取上清液,用氯仿-异戊醇(体积比24:1)450 u L再抽提1次,10000r/min离心5min ;取上清加 入异丙醇800 u L,- 20C静置30min ; 10000r/min离心5min,沉淀物用70%乙醇洗两次,自 然干燥后溶于30 u L TE缓冲液;加入 0.5 u L10mg/mL的RNaseA,37C温浴30min,自然冷 却后保存。

方法四:蜗牛酶反复冻融法收集过夜培养16〜18h的菌体1.5mL,加入500 u LPBS溶液重悬菌体,12000r/min离心2min,用PBS重洗一次;将沉淀溶于 35 u L的蜗牛酶溶 液中,加入65 u L的PBS,45 C作 用2h,加100 u L裂解液,一20 C冷冻,然后室温振 荡溶解,反复3次;向悬浮液中加 入150 u L 5mol/L KAc(pH8.9)轻轻混匀,然后10000r/min离心5min ;取上清液,加入两 倍体积的无 水乙醇,轻轻混匀,室温放置5min ; 12000r/min离心10min,将沉淀溶解在100 u L TE中; 加入等体积的酚-氯仿-异戊醇(体积比25:24:1),轻柔颠倒 混匀,12000r/min离心5min,重复 抽提1次;加1/10体积的3mol/L醋酸钠(pH5.2),2.5倍体积的无水乙醇,一20C放置30min ; 10000r/min离心5min,弃上清液,用70%乙醇溶液洗涤沉淀两次,室温 干燥后用20 u L TE溶 解;加入0.5 u L 10mg/mL的RNaseA, 37C温浴30min,自然冷却 后保存。

方法五:溶解在100 u L TE中;加入等 体积的酚-氯仿-异戊醇(体积比25:24:1),轻柔颠倒混匀, 12000r/min离心5min,重复抽提1次;加1/10体积的3mol/L醋酸钠(pH5.2),2.5倍体积的 无水乙醇,一20 C放置30min ; 10000r/min离心5min,弃上清液,用70%乙醇溶液洗涤沉淀 两次,室温干燥后 用20 u L TE溶解;加入0.5 u L 10mg/mL的RNaseA,37 C温浴30min,自 然冷却后保存方法六:1、配一个破菌缓冲液:Triton X-100 2% (v/v ) SDS 1% ( w/v )NaCl 100mM Tris-HCl (pH 8.0 ) 10mM2、 把酵母细胞离心收集,加200ul的石英砂或玻璃珠,加入200pl的破菌液再加200』的酚氯仿,涡旋一分钟,放在冰上一分钟,一共反复4次3、 加入500pl的ddH2O,涡旋,离心,抽上清和等体积的酚氯仿混合4、 涡旋,离心,抽上清和等体积的酚氯仿混合,重复4直到离心后两层之间没有蛋白出现5、 抽上清加1ml的无水乙醇,放在-20度30min6、 离心,抽上 清,再用70%乙醇洗一次,真 空干燥,用TE或ddH20溶解方法七:接种酵母到2.5ml酵母试管培 养基中(YPD培养基),30°C,培养16〜18h ;取1.5ml酵 母培养液,室温下,1500 x g离心5〜10min收集菌体;菌体用灭菌水 洗1次,1500 xg 离心 5min ;菌体用 200pl SCED(1mol/L 山梨醇、10mmol/L 柠檬酸钠、10mmol/LEDTA、 10mmol/L DTT 二硫苏糖醇)溶液重悬, 加入3 0pl 10mg/ml 溶菌酶(Lysozyme)37 C温浴1h ; 加入100』2%SDS 混匀,-20 C冰冻,然后 室温震荡溶解,反复3次;向悬浮液中 加入150』 5mol/L KAc(pH 8.9)轻轻混匀, 然后10000r/min 离心5min ;将上清转移到一新的 1.5ml离心 管中,加 入2倍体积的乙醇,轻轻 混匀,室温放置 5min后12000r/min 离心10min ;除去上 清,将沉淀溶解在 300pl TE(10mmol/L Tris-HCl ,pH7.4,1mmol/L EDTA,pH8.0)中,加入 6pl RNase (10mg/ml),37C温浴30min ;加入饱 和酚和氯仿各 150pl充分混匀,然后10000r/min 离心5min ;转移上清到新的1.5ml离心管中,加入1/2体积的7.5mol/L NH4Ac(pH7.5) 和等体 积的异丙醇,-20 C放置20min后12000r/min 离心10min ;除去上清,加 入300pl 70% 乙醇 漂洗沉淀一次,10000r/min离心5min ;风干除去乙醇,用2 0』TE 溶解酵母DNA。

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