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高通量基因测序系统及配套试剂需求一览表及技术规格

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高通量基因测序系统及配套试剂需求一览表及技术规格_第1页
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高通量基因测序系统及配套试剂需求一览表及技术规格一、功能要求序号货物名称数虽主要技术规格交货期目的地1基因测序仪1台一台仪器可以实现目标 片段 测序,人类全转录组 测序, 人类全外显子组测序,未知 基因组序列的全新测序,已 知基因组序列的再测序, mRNA测序分析,染色质 免疫共沉淀(ChlP-seq)研 究,转录 组测序,表达谱分 析,扩增子测序,拷贝数分 析,甲基化,双端配对测序 等应用和研究目标合同签定后 三个月内浙江二、机器设备性能序号招标规格投标响应1技术参数1」测序原理:系统米用最先进的半导体芯片测序,直接将化学信号转 化为电信号,实时检测测序时产生的氢离子浓度:无激发光源,无 需荧光标记,无需照相系统1.225种通量的测序芯片灵活可选,可产出0.3-1 Gb数据、可产岀2 Gb 数据、可产出7.2Gb数据、可产出15 Gb数据、可产出25 Gb数 据,并有进一步扩展的空间,适合不同通量需求的应用1.2.1高通量测序Reads通量大于120M,同时可以扩展到英他方向的应 用1.2.2具有最小通量在2Mb左右reads的芯片,能够实现最少1-2个病例 样本的上机分析1.3读长:单端测序长度> 600 bp,并有继续延伸读长的空间1.4测序周期(测序运行及分析时间):可在5.5小时内完成单端读长600 bp的测序及分析任务;可在3小时内完成单端读长200 bp的测序及 分析任务;对于读长小于200bp的测序及分析任务,则运行时间需 更 短。

苴中,所有通量芯片均可在2.5小时内完成单端读长200 bp的测 序任务1.5拥有单独分离式的自动化加样系统以及测序系统可并行处理,并 且可以分步质控,保证高效测序1.6仪器设置时间:提供带有RFID标签的即装即用试剂盒,装配设置 时间少于15分钟1.7可在1张芯片上完成多样本和多位点的同时测序1.8读取精度:原始数据准确性M99.0%1.9支持384个样本平行分析厂家支持肿瘤与疾病的检测1.10.1厂家有能力提供能够同时检测基因单碱基突变、拷贝数变异以及融 合突变的检测试剂盒具有资助专利技术开发相关建库试剂盒1」0 2厂家提供的试剂盒获得NMPA批准,能够进行多个肿瘤基因的检 测并能在NMPA批准的髙通量测序平台检测1.10.3厂家提供的肿瘤相关基因检测及研究试剂盒超过5个配备全自动加样系统1.11」平台兼容性:兼容支持科研型及临床型测序平台、兼容支持所有 通 量测序芯片的模板制备1.1L2通量兼容性:可以操作配套不同测序平台芯片,可以制备满足O.3Gb-25Gb测序通量的微珠1.113自动化设计:平台采取自动化设计,能够自动化完成自动化完成 油 包水PCR中的乳化、混合物制备和扩增以及最终芯片上样的所 有步 骤。

从核酸样本输入到完成测序芯片上样全过程的手动操作时间W 30分钟三、配套试剂序号招标规格投标响应1建库及检测试剂盒1.1用途:一个通过DNA片段化、末端修饰、A尾添加、PCR富集等 操作步骤,使基因组样本达到可上机测序的条件的建库试剂盒,建 库试剂盒应包含上述操作的大部分试剂组分1.2主要性能1.2.1能在短时间(V2h)内完成文库构建,无需复杂操作且易形成标准 化的操作,交叉污染的风险低1.2.2样本需求量低,DNA最低需求量为20ng,如检测需求,也可增加 RNA样本,但需求量不能低于为50ng1.2.3覆盖目前NCCN指南推荐的大部分基因1.2.4可以检测多种临床意义明确的变异,如,突变、插入、缺失 融合1.2.5获得国家药品监督管理局的认证1.2.6有配套的分析软件,可以在医院端进行安装并能展示相应的分析检 测结果1.2.7可以提供科研版报告,包含检测结果目前的临床研究进展及靶药 匹 配信息1.2.8有相应的技术培训团队可提供后续服务2核酸提取试剂2」用途:用于核酸的提取、富集、纯化等步骤其处理后的产物用 于 临床体外检测使用2.2主要性能2.2.1同时提取组织样本中的DNA和RNA2.2.2获得国家药品监督管理局的认证3Agencourt AMPure XP Kit3」用途:纯化磁珠,用于文库纯3.2主要性能:满足200-300bp文库片段的纯化性能四、详细配置清单序号招标规格投标响应1硬件配置及软件1.1测序仪主机配置:Intel Motherboard; Intel E5-2680 V4 CPU; 256 GBDDR4: NVIDIA P5000 GPU ; 4X2TB SSD: 4X8TB HDD。

1.2预装了中文分析软件,可将仪器测序数据进行碱基响应比对(base call alignment),输出符合行业标准的数据格式1.3可提供50多个数据分析插件供用户对数据进行后续分析2其他条款2」服务响应:厂家直接提供技术服务,设备出现故障时保证24小 时 内服务维修响应,并于48小时以内派技术人员到达现场维修设 备2.2提供800/400技术服务专线2.3厂家在国内有专门的生物信息团队3配置3」基因测序仪主机1台(需提供医疗器械注册证)3.2全自动加样系统1台(无需提供医疗器械注册证)(含硬件和软 件)3.3相关仪器装机试剂1套。

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