人类基因组计划一、 HGP:人类基因组计划(Human Genome Project)二、 基因组测序三、 基因组分析四、 其他基因组的测序与分析人的基因这么少，却能行使复杂的功能的原因:1. 一个基因对应多个产物:可变剪切和蛋白修饰2. 垃圾基因的功能:非蛋白编码基因的重要功能任务与进展完成四张图:遗传图谱、物理图谱、转录图谱、序列图谱(一) 遗传图谱(Genetic map)1. 定义又称连锁图谱(1 inkage map)或遗传连锁图谱(genetic linkage map)，是指人类基因组内 基因以及专一的多态性DNA标记(marker)相对位置的图谱，其研究经历了从经典的遗 传图谱到现代遗传图谱的过程2. 经典的遗传图谱(以基因表型为标记)3. 现代遗传图谱(以 DNA 为标记)多态性( polymorphism ) : 人的 DNA 序列上平均每几百个碱基会出现一些变异 (variation),并按照孟德尔遗传规律由亲代传给子代，从而在不同个体间表现出不同， 因而被称为多态性►第一代多态性标记：限制性片段长度多态性-RFLP► 第二代多态性标记：短的串联重复序列：小卫星DNA、微卫星DNA►第三代多态性标记：单核背酸的多态性-SNP(二) 物理图谱(Physical map)1. 定义用物理学方法构建的由不同的DNA结构按其在染色体上的原始顺序和实际距离排列的 图谱。
以定位的DNA标记序列如序列标签位点STS作为路标，以DNA实际长度即bp、 kb、Mb为图距的基因组图谱2.序列标签位点(sequence-tagged site, STS)图谱STS是染色体定位明确且可用PCR扩 增的单拷贝序列)三) 转录图谱1. 定义以 EST(expressed sequence tag ，表达序列标签)为标记，根据转录顺序的位置和距离 绘制的图谱四) 序列图谱(分子水平的物理图谱)1. 定义 序列图谱是指整个人类基因组的核苷酸序列图，也是最详尽的物理图谱既包括可转录序列，也包括非转录序列，是转录序列、调节序列和功能未知序列的总和二、大规模测序的策略• 定向：逐步克隆法(clone by clone)• 随机： 全基因组鸟枪法( whole genome shot-gun)逐步克隆法(Clone by Clone) 小基因组DNABAC文库根据物理图 谱正确定位 的BAC或 contig用于鸟枪法 测序的候选 ■克隆 完整的基 因组序列用于鸟枪法测 序的亚克隆。