基因克隆步骤完整版.doc

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1、1总RNA提取(1) 液氮研磨或冰上匀浆实验材料;先将1ml Trizol加到离心管中待用(2) 将研磨好的样品加到离心管中混匀,室温放置5 min;打开离心机预冷(3) 加200 L氯仿,振荡15 sec,室温放置3 min,分层;(4) 4oC,12,000g,离心15 min;(5) 取上清,加500 L异丙醇,混匀,室温放置10 min;(6) 4oC,12,000g,离心10 min;(7) 弃上清,加1 mL75%乙醇,漂浮洗涤沉淀,振荡充分;再用100%乙醇清洗(8) 4oC,7,500g,离心5 min;(9) 弃上清,离心,用枪吸取多余液体,放在超净台里干燥后,加50 L D

2、EPC水,80oC保存。此操作中所用到的器皿均需经过DEPC灭活RNA酶处理。提取的总RNA需经RNA电泳检测质量,并用紫外分光光度计测定浓度。OD260值为核酸的吸收值,OD280值为蛋白的吸收值,OD260/280值在1.8-2.0间一般说明该核酸蛋白含量在允许的范围内,可正常使用;此外还有OD230值为多糖和酚类的吸收值,比较干净的核酸OD260/230值能达到2.2左右。RNA浓度计算公式:总RNA 浓度(g/mL)=A260稀释倍数40。2反转录/cDNA第一链的合成纯化RNA以去除基因组DNA,操作按TaKaRa公司的PrimeScript RT reagent with gDNA

3、 Eraser(Perfect Real Time)说明书进行。其体系为:Total RNA1g5 gDNA Eraser Buffer2LgDNA Eraser1LRNase Free dH2O补齐至10L条件为:42oC,2min;RNA纯化后,即可进行反转录。其体系为:5PrimeScript Buffer 2(for Real Time) 4LPrimeScript RT enzyme mix 1LRT Primer Mix 1L上一步的反应液10LRNase Free dH2O补齐至20L操作条件为:(1) 37oC放置15 min; (2) 85oC,5 sec; (3) 4oC保

4、存。3 PCR按TaKaRa公司的Premix Taq Version 2.0操作,PCR反应体系如下:Premix Taq25 L模板5L引物1 (10 M)1 L引物2 (10 M)1 LddH2O18LPCR反应条件为:94C预变性5min;94C变性30s,53C退火30s,72C延伸30s,循环36次;72C延伸10min。PCR反应完毕,取5L反应产物进行1%琼脂糖凝胶电泳(若割胶回收则用10L反应产物)。4 基因克隆及测序4.1 PCR产物切胶回收将PCR产物用1%琼脂糖凝胶进行电泳,在紫外灯下观察并切下预期大小的DNA片段。使用TIANGEN公司的Universal DNA P

5、urification Kit割胶回收试剂盒进行纯化,步骤如下:(1)平衡吸附柱:向吸附柱CB2中(吸附柱放入收集管中)加入500L平衡液BL,13,400g离心1 min,倒掉收集管中的废液,吸附柱CB2重新套回收集管中;(2) 按100 mg agarose胶加入100L 溶液PC,置于50oC中10 min左右,中途混匀几次,至胶完全融化;(3) 将样品倒入一个吸附柱CB2中(吸附柱放入收集管中),室温下13,400g离心1 min,倒掉收集管中的废液,吸附柱CB2重新套回收集管中;(4)向吸附柱CB2中加入600L 漂洗液PW(加乙醇),室温下13,400g离心1 min,倒掉收集管中

6、的废液,吸附柱CB2重新套回收集管中;(5) 重复上一步骤;(6) 将吸附柱CB2放入收集管中,室温下13,400g离心2 min,尽量除去漂洗液,将吸附柱置于室温放置数分钟,彻底晾干;(7) 将柱子套入一新的灭菌1.5 mL离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加50L 洗脱缓冲液,室温放置2分钟,13,400g室温离心2 min,收集到的洗脱液即为回收的DNA纯化液;(8) 取5L的纯化液体进行1%琼脂糖凝胶电泳,以检查纯度,并测量溶液中DNA含量。4.2目的片段与载体连接(1) 胶回收产物与T载体连接体系,参考Takara公司pMD18-T载体的试剂盒说明书。在灭菌的0.5 mL 离心管中配制

7、如下溶液(10 L):回收DNA4LLigation Solution5LpMD18-T Vector1L(2) 16oC反应30分钟,所得产物保存于4oC冰箱备用。4.3连接产物转化E.coli DH5(1) 将5 L连接产物加入到100LE.coli DH5感受态细胞中,轻轻旋转离心管混匀内容物,冰上静置30 min; (2) 42oC水浴热激转化90 sec,立即放回冰上,放置3 min;(3) 每管加入500 L LB培养基(室温放置),37oC 160-180 rpm振荡培养45-60 min,使菌体复苏并表达抗性基因;(4) 在含有Amp(100 g/mL)的选择性平板上加入60-

8、100 L 菌液,用无菌涂布棒轻轻涂布均匀后,用Parafilm膜封好;(5) 将培养皿正放,37oC约50 min,待液体全部吸收后,倒置平板继续培养10-16 h。4.4转化子的筛选及鉴定(1) 用无菌枪头挑取LB平板上3-5个单菌落,分别接种到3.5 mL LB液体培养基中(含100 g/mL Amp),37oC,165rpm振荡培养10-12 h;(2) 用5 L菌液做模板,进行PCR鉴定(50 L 体系),操作步骤同3。阳性菌液由Invitrogen生物公司测序鉴定,余下的菌液4oC保存备用;(3) 测序结果在Genbank数据库中进行比对分析。 村民建房委员会应建立村级农房建设质量安全监督制度和巡查制度,选聘有责任心和具有一定施工技术常识的村民作为义务巡查监督员,开展经常性的巡查和督查。

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