基于变量筛选的天然植物特征成分筛选(宽屏)

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1、基于数据挖掘的天然植物活性成分/部位筛选,想法,应用,验证,DR. 大蛇丸 手机:18687543670 QQ:984894914,提出问题:基于天然植物所开发的中成药、香料,其成分复杂,阻碍了对其质量控制、生物机理、及药效发挥的研究。如何确定其对特定活性的有效成分或有效部位,又避免常规天然产物化学研究方式的超强劳动量、随分离过程的活性丢失等问题? 解决方法:采用化学计量学挖掘植物组分与活性之间的关系,可以快速发现植物源产品的活性成分或部位! 方法优势:1)极大减少工作量,使得植物化学工作者的分离具有目的性;2)筛选到的成分或部位,其活性一般均要优于原植物提取物;3)一定程度上反应成分或组分之

2、间的相互作用关系。,活性成分?,活性成分?,活性成分?,活性部位?,一个个分离验证?,以变化的成分导致对变化的效应为基础,采用化学计量学方法,挖掘活性部位/成分.,背景介绍,1006.54 g 狼毒样品,浸泡1小时,回流提取3次,每次2小时,合并,减压浓缩至浸膏状,113.62g,上HPD100树脂柱,69.5g填料 柱体积169ml,上聚酰胺柱,37.76g填料 柱体积154ml,取约2.9g,H2O 10%, 20%, 30%, 40%,50%, 60%,70%,80%,100% HH H1 H2 H3 H4 H5 H6 H7 H8 H10 NA 0.038 0.01 0.216 1.08

3、 0.44 0.27 0.38 0.27 0.01,Fr.,Fr.,H2O,10%, 20%, 30%, 40%,50%, 60%,70%,80%,100% JH J1 J2 J3 J4 J5 J6 J7 J8 J10 NA NA NA 0.066 0.19 1.53 0.83 0.47 NA 0.05,得率11.2%,馏分 标号 重量/g,馏分 标号 重量/g,取约3.36g,3倍柱体积,3倍柱体积,乙醇水梯度冲洗,乙醇水梯度冲洗,基于权重分析的狼毒抗肿瘤活性成分/部位筛选,狼毒组分制备流程,狼毒组分液相分析结果,分离系统:Waters 2695;色谱柱:CAPCELL PAK C18 4.

4、6250,5um 检测波长:290nm;进样:20ul,流速1ml/min,基于权重分析的狼毒抗肿瘤活性成分/部位筛选,狼毒抗肿瘤活性分析,基于权重分析的狼毒抗肿瘤活性成分/部位筛选,成分:色谱全谱数据 活性:离散化处理 变量筛选方法:权重分析,数据分析方法,基于权重分析的狼毒抗肿瘤活性成分/部位筛选,数据处理,权重公式,NCI-H157,A549,SK-HEP-1/BEL-7042,1)从图中可以看出,对于四组癌细胞,均表现出在30至37 min,尤其是35 min左右的成分对高低活性区分能力较强。 2)对个别抗癌活性,如抗NCI-H157,其5分钟左右成分群也具有较强区分能力,潜在活性组分

5、 / 成分,基于权重分析的狼毒抗肿瘤活性成分/部位筛选,潜在活性组分制备及验证,基于权重分析的狼毒抗肿瘤活性成分/部位筛选,100%,基于优劣比分析的淫羊藿抗骨质疏松活性成分/部位筛选,样本来源:17产地产地淫羊藿,茎叶,经提取后获得总提物粉末;成分分析:UPLC-Q-Tof,淫羊藿组分制备及分析,基于优劣比分析的淫羊藿抗骨质疏松活性成分/部位筛选,不同产地淫羊藿对RAW264.7抑制率,前破骨细胞抑制活性分析,成分: 活性:原始数据 变量筛选方法:优劣比法(Good2bad)1,数据分析方法,数据处理,基于优劣比分析的淫羊藿抗骨质疏松活性成分/部位筛选,1 Yang L, Yang Q X,

6、 Yang S H, et al. Journal of Near Infrared Spectroscopy, 2015, 23(6):391-400,总离子流d文件,Trapper,mzXML,XCMS,17*474成分矩阵,优劣比值较高成分,(1)210号成分(宝霍苷I)具有最高的优劣比值,意味着对RAW264.7抑制活性贡献较大,可能具有较高的活性。,成分优劣比值,(2)被选中的成分多数位于7-8分钟(主要位于60-80%乙醇洗脱部位)。,潜在活性组分 / 成分,基于优劣比分析的淫羊藿抗骨质疏松活性成分/部位筛选,潜在活性组分验证,基于优劣比分析的淫羊藿抗骨质疏松活性成分/部位筛选,不

7、同部位抑制活性比较,宝霍苷I和淫羊藿苷的浓度效应曲线,60-80%部位浓度药效曲线,活性上,筛选的60-80%组分优于淫羊藿提取物,筛选的宝藿苷I优于淫羊藿苷(淫羊藿主要活性成分)。 宝藿苷I呈现S型作用曲线,可能与淫羊藿苷作用方式不同。,烟叶提质特征组分/成分筛选,不同烟叶样品重叠色谱图,烟叶组分制备及分析,样本来源:全国不同产地、品种、等级复烤烟叶,共计544个样品。,不同烟叶样本清甜香特征评价,0:清甜香特征不凸显组;1:清甜香特征凸显组,烟叶提质特征组分/成分筛选,不同方法的清甜香特征组分筛选结果总结,数据分析方法及分析结果,烟叶提质特征组分/成分筛选,2 Mann-Whitney-W

8、ilcoxon test 3 Subwindow Permutation Analysis 4 Moving Windows-interval PLS,(1)24.5-28 min的保留时间段(65%洗脱部位),具有较高的筛选频率,基本被几种方法均筛选得到,应该属于对清甜香0组和1组区分比较重要的区间1。,(2)在24.5-28 min的保留时间段存在着被明显选中的两个时间点,即24.77和25.65 min。,潜在活性组分 / 成分,烟叶提质特征组分/成分筛选,潜在活性组分验证,烟叶提质特征组分/成分筛选,(1)将L1M/C、L1MKA、OMT和L1L/C四种津巴布韦烟叶规格按1:1:1:1

9、质量比组合,80%乙醇提取后,加入1/3倍水,-6下静止12小时,过滤不溶物,浓缩至酒精度0%时,制备得烟草初膏液; (2)将烟草初膏液,按质量比1:5缓慢倒入大孔树脂柱进样口,控制流出速度每2s一滴; (3)分别用3倍柱体积的水、20%乙醇、65%乙醇洗脱大孔树脂,收集65%乙醇洗脱部位。 (4)浓缩65%乙醇洗脱部位至相对密度(d2020)1.196,折光指数(nD20)1.480,既得可凸显清甜香的卷烟液体烟草香精。,制备方法,感官评价,基于活性成分的质量控制,烟叶提质特征组分/成分筛选,(1)采用24.77和25.65 min两个特征成分即可实现对烟叶源香料的质量控制。,(2)1组整体

10、与对照相似度概率较大,0组较小,通过散点图和相似度预测概率值,可清楚看出每个样本与对照的差异度。,应用方向,1)优化和精简植物源产品(中成提取物原料、中成药、植物香料) 优化后的产品,一般具有更高的活性,更少的成分,因而使得药物用量减少,副作用减少,质量控制相对容易,作用机理更容易阐述。 2)功效增强的植物源产品的开发 用基于化学计量学的方法筛选植物活性成分/部位,可以极大减少劳动强度,避免盲目筛选,结合制备技术,开发产品的功效更突出,节约劳动成本和时间成本,加快研发速度。 3)植物源产品及植物原料质量控制 确定植物中某种活性的关键组分后,质量控制可以缩小到针对关键组分的监测。避免了传统的只关注主要成分,而忽略了活性成分。,

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