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1、系统发育树构建,赵慧,16SrRNA片段获取,DNA提取,基因组DNA,PCR扩增,16SrRNA,细菌培养液,测序,序列比对,1.使用DNAstar中的SeqMan对未知菌测序得到的两条序列进行组装连接 SeqMan使用方法：1.打开软件如图,2.点击Add Sequence 然后选择侧得的序列（带有图的）,3.点击 Assemble 得到如下图，然后双击Contig1,4.得到下图，减掉两端不好的序列，点击Contig，再点击save consensus ，保存。,NCBI比对,5.将得到的序列输入到NCBI上进行比对,6.Blast DAN,7.输入组装的DNA序列,8.选择相似的菌种,
2、9.下载FASTA格式,10.MEGA7比对,1.打开软件点击Align-Edit/Build Alignment 然后 OK-DNA 再然后是Edit -insert sequence from file-选择序列（相似菌和目的菌，fasta格式）-选中序列-点击Alignment -Align by clustalW-保存（mas格式）,构建发育树,再点击phylogency-construct/test neighbor- jioning tree-然后选择上述保存的文件.mas 然后参数选择Bootstrap method 1000 其他默认，点击compute,得到系统发育树,谢谢,
