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1、BLAST序列比对,BioEdit使用简要介绍,BioEdit安装,打开BioEdit7.0.9.0-setup.exe，next，直到选择安装目录,BioEdit安装,选择完安装目录，next到最后一步，完成安装。,导入query序列,打开BioEdit，导入Query_sequence.fasta文件。FileOpen 注意文件类型选择All Files (*.*),创建比对数据库,导入nirS_nucleotide.fasta核酸数据库和nirS_protein.fa蛋白数据库，分别创建本地的nirS的核算数据库和蛋白数据库。 Accessory ApplicationBLASTCrea
2、te a local nucleotide database file / Create a local protein database file,Local Blast,Accessory ApplicationBLASTLocal BLAST,Program： blastn : 核酸核酸 blastp : 蛋白蛋白 tblastn: 蛋白翻译的核酸 tlastx: 翻译的核酸蛋白 tblastx: 翻译的核酸翻译的核酸,导入待比对的序列,如 Query_sequence.fasta,选择本地核酸/蛋白数据库,定义一个输出文件，txt文件即可,Blast的所有使用说明，命令行格式,期望值, e-value,Local Blast,Accessory ApplicationBLASTLocal BLAST。选择blastn,在相应的输出文件目录下，找到blastn的相应结果，可以直接打开，查看比对结果,Local Blast,Blastn比对结果,评分最高，E值最低的结果排在第一,Local Blast,Accessory ApplicationBLASTLocal BLAST。选择blastx,在相应的输出文件目录下，找到blastx的相应结果，可以直接打开，查看比对结果,Local Blast,Blastx比对结果,
