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1、2015.5.21,PubMed生物医学数据库 检索方法与技巧,主要内容,PubMed概况 PubMed数据来源 PubMed检索机制 PubMed检索运算符 PubMed检索方法 结果的显示、打印、保存 其他辅助功能,1. PubMed概况,创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI) 1997年6月开始向全球开放 特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。,2. PubMed数据来源,MEDLINE：标引了主题词等。 OLDMEDLINE：收录1966年以前的数据。 In Process Citations：每天
2、收录，尚未经规范处理的数据。 Publisher-Supplied Citations：由出版商提供的电子文献。 来自NCBI Bookshelf的大部分书和书章节。,3. PubMed检索机制,自动转换匹配功能 (Automatic Term Mapping) 截词检索 短语检索,检索框中输入的未加标签的词匹配顺序 Mesh(医学主题词)转换表 期刊翻译表 作者全称转换表（2002年以后） 作者索引 研究者 (合作伙伴)全称转换表 研究者(合作伙伴)索引,3.1 自动转换匹配功能,如果在以上表任何一个中找到匹配的内容，则匹配结束。例如：如果输入的检索词在主题词转换表中找到与其相匹配的主题词，
3、则使用该主题词进行检索并结束匹配，不会在其他词表中进行匹配。 如果输入的单个词在6个词表中都未找到匹配的内容，其将被在all fields中进行检索；如果输入的词组未找到匹配的内容，该词组将被拆成单词并分别对其进行匹配后将匹配结果以AND连接。,Leukemia “leukaemia“All Fields OR “leukemia“MeSH Terms OR “leukemia“All Fields,Heart attack,“myocardial infarction“MeSH Terms OR (“myocardial“All Fields AND “infarction“All Fiel
4、ds) OR “myocardial infarction“All Fields OR (“heart“All Fields AND “attack“All Fields) OR “heart attack“All Fields,3.2 截词检索,”*” 如：键入”flavor*”，系统会找到那些前一部分是flavor的单词（如flavored, flavorful, flavoring等），并对其分别进行检索。 如果这类词少于600个，PubMed会逐个词检索，若超过600个（如：cel*），PubMed将显示警告信息，要求增加词汇的开头字母数量。 截词功能只限于单词，对词组无效。如：”in
5、fection*”包括”infections”，但不包括”infection control”等。 注意：使用截词检索功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。,3.3 强制检索,双引号（“”）来强制系统进行短语检索。 例如，在PubMed主页的检索提问框中键入”Single cell”，并用双引号引起来，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。 使用双引号检索，会自动关闭词汇转换功能。,” “Vitamin c“ ” (18944篇结果，2015-5-13) “ Vitamin c “All Fields Vitamin c （ 53879篇结果，2015-5-1
6、3 ） (“ascorbic acid“MeSH Terms OR (“ascorbic“All Fields AND “acid“All Fields) OR “ascorbic acid“All Fields OR “vitamin c“All Fields),4. PubMed检索运算符,逻辑运算符 AND OR NOT,逻辑运算符,逻辑“与”运算AND： 检索式写成A AND B，表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。 AIDS AND therapy 逻辑“或”运算OR： 检索式写成A OR B，表示包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的
7、文献为命中文献。 AIDS OR Acquired Immunodeficiency Syndrome 逻辑“非”运算NOT： 检索式写成A NOT B，表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献。 Hepatitis NOT Animal,IP地址：http:/pubmed.gov,PubMed 网址,基本检索,高级检索,主题检索,临床咨询,5. PubMed检索方法,5.1 基本检索 5.2 高级检索 5.3 主题检索 5.4 临床咨询,5.1 基本检索,MeSH主题词、作者、标题、文中单词或短语、期刊名称，或者这些部分的任意组合,关键词、词(词组)或短语： 输入任意关键词：vit
8、amin c、Lung cancer； 带有双引号” ”作为短语检索：”cancer therapy”； 带有连接号”-”作为一个词组检索：interleukin-6。 作者： Chen HD、 仅知道作者姓，则必须加上字段标识，如： Smithau 2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索 如：Joshua Lederberg,5.1 基本检索,期刊刊名： 可用期刊全称：CELLTA； 可用期刊简称：JAMATA；(The Journal of the American Medical Association),5.1 基本检索,分析该检索课题，包含两个方面： 肝癌：liver ca
9、ncer； 酒精：alcohol 两个主题之间的逻辑关系是AND，即 liver cancer AND alcohol,基本检索举例：肝癌和酒精的关系,基本检索举例：肝癌和酒精的关系,输入：liver cancer AND alcohol,5.2 高级检索,高级检索,5.2 高级检索,分析该检索课题，包含两个方面： 作者为：高兴华（Gao XH）； 作者单位为：中国医科大学 （China Medical university）。,高级检索举例：中国医科大学高兴华教授发表的文献,高级检索举例：中国医科大学高兴华教授发表的文献,高级检索举例：中国医科大学高兴华教授发表的文献,5.3 主题检索,根据
10、medline数据主题标引的规范性，利用主题词进行的研究，对提高查全率、查准率会有相当的帮助。,点击MeSH Database打开主题检索界面,高级检索,主题检索,基本检索,5.3 主题检索,主题词(headings)：,直接、准确表达主题概念的词或词组。每个概念只能用一个主题词表达如：肿瘤 cancer Carcinoma Tumor Neoplasm ,Neoplasm,副主题词：用于对主题词的某一特定方面加以限定，强调主题概念的某些专指方面。 如：治疗（therapy）、外科学（surgery）、 代谢（metabolism）、 诊断（diagnosis） 主题词与副主题词之间的组配检索
11、，起到对主题词的限定作用，是主题词具有更高的专指性，缩小检索范围，保证检索结果的准确性。 如：白血病的药物治疗 leukemia/drug therapy 但并不是每个副主题词和任何主题词都能进行组配使用，每个副主题词具有一定的专指性，其使用范围仅限于它后面括号内的类目。,副主题词(subheadings)：,TI - Bisoprolol: opportunities in the treatment of hypertension. AB - Bisoprolol (bisoprolol fumarate) - -cardioselective blocker, does not poss
12、ess intrinsic sympathomimetic and membrane stabilizing activity. The main indications for bisoprolol are arterial hypertension (AH) and heart failure. This article provides an overview of the literature on the potential uses of bisoprolol in the treatment of hypertension. The features of the pharmac
13、okinetics of the drug. The data on the effectiveness of bisoprolol in hypertension and tolerability in patients with concomitant disorders. AU - Minushkina LO SO - Kardiologiia. 2012;52(6):80-5. MH - Adrenergic beta-1 Receptor Antagonists/administration & dosage/adverse effects/pharmacokinetics MH -
14、 Biological Availability MH - *Bisoprolol/administration & dosage/adverse effects/pharmacokinetics MH - Comorbidity MH - *Coronary Disease/complications/drug therapy/physiopathology MH - *Drugs, Generic/economics/pharmacokinetics MH - *Heart Failure/complications/drug therapy/physiopathology MH - Hu
15、mans MH - *Hypertension/complications/drug therapy/physiopathology MH - Perioperative Care/methods MH - Therapeutic Equivalency MH - Treatment Outcome,MH - Adrenergic beta-1 Receptor Antagonists/administration & dosage/adverse effects/pharmacokinetics MH - Biological Availability MH - *Bisoprolol/ad
16、ministration & dosage/adverse effects/pharmacokinetics MH - Comorbidity MH - *Coronary Disease/complications/drug therapy/physiopathology MH - *Drugs, Generic/economics/pharmacokinetics MH - *Heart Failure/complications/drug therapy/physiopathology MH - Humans MH - *Hypertension/complications/drug therapy/physiopathology MH - Perioperative Care/methods MH - Therapeutic Equivalency MH - Treatment Outcome,主题检索举例： 长春新碱（V
