trna上的反密码子到底怎么阅读

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1、 文章已发表于文章已发表于 2012 年生物学通报年生物学通报 tRNA 上的反密码子到底怎么阅读 王 彬 (山东东营市河口区第一中学 山东东营 257200) 人教版必修二遗传与进化教材 66 页在介绍 tRNA 的结构和功能时给出了下面一副 插图: 图 45 tRNA 的结构示意图 显然这幅图是tRNA三叶草叶型的二级结构,此图在很多高校生化教材中很常见,且都是磷 酸基团( P)位于左上端,羟基(OH)位于右上端。图下端标有反密码子,那么代表 反密码子的这三个碱基该怎么阅读和书写呢?如果在此图中从左到右阅读,即P三个连续 碱基OH,其实意味着反密码子是从tRNA的 5端向 3端阅读,即 5

2、三个连续碱基 3。然而在教材同一页,接下来却出现了这样的文字叙述, “如图所示(图 46) ,反密 码子为UAC的tRNA携带甲硫氨酸,通过与mRNA上的碱基AUG互补配对,进入位点 1” 。我 们知道在蛋白质合成时,mRNA信息的阅读(翻译)是从mRNA的的 5端向 3端进行的, 不但如此,在中学教材以及各种版本的生化教材中,密码子表中的 64 种密码子也都是从 5 端向 3端阅读的(关于密码子的阅读,各种教材叙述都是统一的,这不存在争议)。 比如甲硫 氨酸的密码子为AUG,实质为 5AUG3的简写。这样的话,上面所说的“反密码子 为UAC的tRNA携带甲硫氨酸” ,这句话中的反密码子UAC

3、实际上阅读顺序为 3UAC5 。 但是如果反密码子按照 35方向阅读, 就和图 45 反密码子的呈现顺序不相符了。 那么,反密码子到底该怎么阅读呢? 笔者查阅了多种版本的生化教材和一些期刊杂志,这些教材和杂志虽然大多数都没有 对反密码子的阅读做出明确的规定, 但从相关内容的文字表述上, 我们能够获得一些有益的 启发。 有的生化教材在讲述 DNA 分子的一级结构(碱基排列顺序)时,有这样的叙述, “在 表示碱基顺序时,习惯上总是把 5一端写在左边,3一端写在右边,如要颠倒书写必须 注明1” 。有的教材这样叙述:核酸的共价结构(一级结构)有几种表示方法,如竖线式, 文字式等。在文字式中,以字母,以

4、字母代表核苷或核苷酸。原则上 5在左侧,3在右 侧。在文字式中 P 在核苷之左表示与 C5相连,在右表示与 C3 相连。 “有时,多核苷酸链中 的磷酸基 P 也可以省略, 仅以字母表示核苷酸的序列。 这种写法对 DNA 和RNA 都适用 2” 。 还是同一本教材, 该书在讲述密码的变偶性及反密码子和密码子之间的碱基配对关系时, 提 到“按照 Crick 于 1966 年提出的变偶学说,反密码子的第一位碱基与密码子的第三位碱基 的配对可以在一定的范围内变动3” ,见下表: 反密码子与密码子之间的碱基配对 紧接着,该教材继续叙述道, “从已知一级结构的 tRNA 中,其反密码子的第一位碱基 为 C

5、、G、U、I,没有 A,显然 I 是有 A 转变而来的。体外实验表明,在有的情况下,反密 码子的第一位碱基可以与密码子第三位任意碱基(A、G、C、U)配对。例如,家蚕 tRNA1Gly 反密码子为 GCC,可识别 GGN(N 为 A、G、C 或 U) ,四种密码子。兔肝 tRNA1Val反密码 子为 IAC,可识别密码子 GUN。哺乳动物线粒体 tRNA 第一位为 U 的反密码子也可识别四 种密码子” 。 通过上面多个版本生化教材中的文字表述和表格呈现,读者不难发现,若无特殊说明, tRNA 上的反密码子的阅读顺序(从左到右)应为 53方向的。若要表示颠倒的顺序, 则一定会标上相应的方向。如生

6、化教材在讲无意义突变时,举了这样的例子, “对酪氨 酸专一的 tRNA1Tyr上的反密码子应为 3AUG5,但如果此 tRNA 的基因发生突变, 是反密码子变为 3AUC5,它就可以将 mRNA 上终止信号 UAG 读成酪氨酸了” 。 但也有极少数书籍中对 tRNA 和 mRNA 上的读码作了具体的规定, “注意读反密码 子的方向是 35,遗传密码的读码是 53” 。鉴于此,笔者建议,对于 tRNA 上反 密码子的阅读方向教科书应该做出明确说明,否则应该按传统的 53阅读,本文开始 时所列举的高中生物人教版教材中的不妥之处也应该予以修正。 主要参考文献 主要参考文献 1 王运坤,吕显禄生物化学教程青岛:青岛出版社,1988:129130 2 王镜岩,朱圣庚,徐长法生物化学第 3 版北京:高等教育出版社2002:482483, 512513

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