实验室常用技术参数资料(精)

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1、实验室常用技术参数资料一、核酸及蛋白质常用数据 1核苷三磷酸的物理常数化合物分子量max(pH7.0)1摩尔溶液(pH7.0)中max时的最大吸收值OD280/OD260ATP507259154000.15CTP48327190000.97GTP523253137000.66UTP484262100000.38dATP494259152000.15dCTP46727193000.98dGTP507253137000.66dTTP48226796000.712常用核酸的长度与分子量核酸核苷酸数分子量DNA48502(双链环状)3.0107pBR3224363(双链)2.810628SrRNA48

2、001.610623SrRNA37001.210618SrRNA19006.110519SrRNA17005.51055SrRNA1203.6104tRNA(大肠杆菌)752.51043常用核酸蛋白换算数据(1)重量换算1g=10-6g 1pg=10-12g1ng=10-9g 1fg=10-15g(2)分光光度换算:1A260双链DNA=50g/ml1A260单链DNA=30g/ml1A260单链RNA=40g/ml(3)DNA摩尔换算:1g 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol末端1g pBR322 DNA=0.36pmol1pmol 1000bp DNA=0.66g1pm

3、ol pBR322=2.8g1kb双链DNA(钠盐)=6.6105道尔顿1kb单链DNA(钠盐)=3.3105道尔顿1kb单链RNA(钠盐)=3.4105道尔顿(4)蛋白摩尔换算:100pmol分子量100,000蛋白质=10g100pmol分子量50,000蛋白质=5g100pmol分子量10,000蛋白质=1g氨基酸的平均分子量=126.7道尔顿(5)蛋白质/DNA换算:1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7104MW蛋白质10,000MW蛋白质=270bp DNA30,000MW蛋白质=810bp DNA50,000MW蛋白质=1.35kb100,000MW蛋白质=2.7kb

4、DNA4常用蛋白质分子量标准参照物(1)高分子量标准参照(2)中分子量标准参照(3)低分子量标准参照肌球蛋白分子量磷酸化酶B97,400碳酸酐酶31,00肌球蛋白212,000牛血清白蛋白66,200大豆脻蛋白酶21,500-半乳糖甘酶B116,000谷氨酶脱氢酶55,000抑制剂磷酸化酶B97,400卵白蛋白42,700马心肌球蛋白16,900牛血清白蛋白66,200醛缩酶40,000溶菌酶14,400过氧化氢酶57,000碳酸酐酶31,000肌球蛋白(F1)8,100醛缩酶40,000大豆脻蛋白酶21,500肌球蛋白(F2)6,200抑制剂肌球蛋白(F3)2,500溶菌酶14,4005常用

5、DNA分子量标准参照物DNA/HindDNA/EcoR/Hind+EcoRpBR322/Hae23130212262122758712394167421514840510465575804497350489436156434268458802322484335304346420273530202726757564190423451125158421321137519218974184118311247564125续上表pBR322/Hinf174/Hinf174/Hae 174/Tap1631726140135329145177131181078117550655310087240439650

6、0826033273444176631023129841348281141221311422718722024940234541542002419433751511182072二、常用缓冲液1分子克隆常用缓冲液2磷酸缓冲液(1)25下0.1mol/L磷酸钾缓冲液的配制pH1mol/L K2HPO4(ml)1mol/L KH2PO4(ml)5.88.591.56.013.286.86.219.280.86.427.872.26.638.161.96.849.750.37.061.538.57.271.728.37.480.219.87.686.613.47.890.89.28.094.06.2(

7、2)25下0.1mol/L磷酸钠缓冲液的配制pH1mol/L Na2HPO4(ml)1mol/L NaH2PO4(ml)5.87.992.16.012.088.06.217.882.26.425.574.56.635.264.86.846.353.77.057.742.37.268.431.67.477.422.67.684.515.57.889.610.48.093.26.8:用蒸馏水将混合的两种1mol/L贮存液稀释至1000ml,根据Henderson-Hasselbalch方程计算其pH值:pH=pK+1g(质子受体/质子供体)在此,pK=6.86(25)。3电泳缓冲液测序凝胶加样缓冲

8、液98%去离子甲酰胺10mol/L EDTA(pH8.0)0.025%二甲苯青FF0.025%溴酚蓝甲酰胺:许多批号的试剂级甲酰胺,其纯度符合使用要求,无须再进行处理。不过,一旦略呈黄色,则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与Dowex XG8混合床树脂共同搅拌1小时进行去离子处理,并用Whatman 1号滤纸过滤2次,去离子甲酰胺分装成小份,充氮存于-70。常用的电泳缓冲液缓冲液使用液浓贮存液(每升)Tris-乙酸(TAE)1:0.04mol/L Tris-乙酸50:242g Tris碱0.001mol/L EDTA57.1ml冰乙酸100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)Tris-磷酸

9、(TPE)1:0.09mol/L Tris-磷酸10:10g Tris碱0.002mol/L EDTA15.5ml85%磷酸(1.679g/ml)40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)Tris-硼酸(TBE)a0.50.045mol/L Tris-硼酸5:54g Tris碱0.001mol/L EDTA27.5硼酸20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)碱性缓冲液b1:50mmol/L NaOH1:5ml 10mol/L NaOH1mmol/L EDTA2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)Tris-甘氨酸c1:25mmol/L Tris5:15.1g Tri

10、s250mmol/L 甘氨酸94g 苷氨酸(电泳级)(pH8.3)0.1% SDS50ml 10% SDS(电泳级)说明:TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5溶液,出现沉淀后则予以废弃。以片都以1TBE作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小, 故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1TBE以提供足够的缓冲容量。碱性电泳缓冲液应现用现配。Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。2SDS凝胶加样缓冲

11、液:100mmol/L TrisHCl(6.8)200mmol/L二硫苏糖醇(DTT)4%SDS(电泳级)0.2%溴酚蓝20%甘油不含DTT的2SDS凝胶加样缓冲液可保存于室温,应在临用前取1mol/L贮存液现加于上述缓冲液中。4凝胶加样缓冲液缓冲液类型6缓冲液贮存温度0.25%溴酚蓝40.25%二甲苯青FF40%(W/V)蔗糖水溶液0.25溴酚蓝室温0.25%二甲苯青FF15%聚蔗糖(Ficoll400)0.25%溴酚蓝40.25%二甲苯青FF30%甘油水溶液0.25%溴酚蓝440%(W/V)蔗糖水溶液碱性加样缓冲液:300mmol/L NaOH6mmol/L EDTA18%聚蔗糖(Fico

12、ll400)40.15%溴甲酚绿0.25%二甲苯青FF使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三:增大样品密度;以确保DNA均匀进入样品孔内;使样品呈现颜色,从而使加样操作更为便利,含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的染料。溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青FF的2.2倍,而与琼脂糖浓度无关。以0.5TBF作电泳液时,溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状DNA相同,而二甲苯青FF的泳动则与长4kb的双链线状DNA相同。在琼脂糖浓度为0.5%1.4%的范围内,这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显著。选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。但是,对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪染料,因为在碱性pH条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。5各种pH值的Tris缓冲液的配制各种pH值的Tris缓冲液的配制所需pH值(25)0.1mol/L HCl的体积714577244773434744207540376385

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