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1、API-TOFMS II双极性数据采集及分析软件操作手册 REV. 02API-TOFMS II禾信双极性大气压电离飞行时间质谱仪2目 录第1章 软件的功能、接口方式及运行环境11.1 软件功能11.2 接口方式11.3 USB驱动程序的安装11.4 采集软件的安装21.5 运行环境3第2章 电控及数据采集软件的开关42.1 电控及数据采集软件的开启42.2 采集及分析软件的关闭4第3章 参数设置63.1 数据采集卡设置63.1.1 输入通道、触发通道73.1.2 输入量程73.1.3 采样频率73.1.4 触发电平73.1.5 触发延时73.1.6 阀值电压73.1.7 采样长度83.1.8
2、 累加次数设置83.1.9 谱图数量83.1.10 采样时间83.1.11 缓存大小83.1.12 降噪83.1.13 数据保存路径93.2 质量分析器参数设置113.2.1 质量分析器参数面板113.2.2 中低压参数设置123.2.3 脉冲电压参数设置123.2.4 高压参数设置133.2.5 射频电压参数设置143.2.6 电压极性模式转换15第4章 软件功能介绍194.1 工具栏按钮功能介绍194.1.1 打开文件204.1.2 参数设置214.1.3 数据采集、暂停及停止214.1.4 峰重心标注及擦除234.1.5 谱图校准244.1.6 Mass、MIC、TIC、迭代TIC图排布
3、314.1.7 MIC图的实现324.1.8 迭代TIC334.1.9 查看峰信息354.1.10 本底扣除及还原354.1.11 离子流相对标准偏差364.1.12 Mass图基线374.1.13 左侧停靠窗口的操作384.2 窗口相关基本操作384.2.1 谱图窗口的调整384.2.2 局部放大功能394.3 分析器参数的另存和加载404.3.1 存储分析器参数404.3.2 加载分析器参数41第5章 数据处理425.1 质量数精度的设置425.2 数据的导出425.3 导出数据的处理43- 2 -第1章 软件的功能、接口方式及运行环境1.1 软件功能ApoloMs 为API-TOFMS
4、II的电控及数据采集软件，可实现以下功能：控制及监测仪器电源、真空系统及各路电压等，采集并显示色谱质谱信息。数据采集部分目前具备的功能有：正负极性切换、保存及导出质谱信息、谱图校准、谱图横坐标（飞行时间，m/z）转换、总离子色谱图(TIC)和多离子色谱图（MIC）变化趋势图、各质谱峰信息（含飞行时间t或m/z、峰面积、峰强度及分辨率等）、谱图累加/平均、连续一段质谱峰强度的相对标准偏差（RSD）等。 1.2 接口方式计算机与上位机通讯通过USB通信线连接使用。 计算机与TDC数据采集卡通过USB通信线连接使用。1.3 USB驱动程序的安装双击上位机通讯驱序CP210VCP_Win_XP_Vis
5、ta_7.exe（图标：），按提示完成上位机通讯驱动程序安装。双击采集卡USB驱动程序EZ-USB_devtools_version_261700（USB驱动）.exe（图标：），按提示完成TDC采集卡USB驱动程序。 两个驱动成功安装后打开中低压开关和采集卡开关，同时连接上各自USB通讯线可在设备管理器的端口（COM和LPT）和通用串行总线控制器中找到对应的图标，见图1-1。图1-1 上位机通讯和TDC采集卡驱动成功连接后对应图标1.4 采集软件的安装USB驱动程序安装完成后，将含有如下文件的ApiMs-DPS文件夹拷贝过来点击软件程序文件ApoloMs.exe（图标）即可使用。，和等为应用
6、程序的扩展文件，是软件运行、上位机控制和采集的必需文件。为应用程序的校正文件，是校准的必需文件，即所有的校正数据都保存在该文件中。 为应用程序的配置设置参数文件，即仪器分析器参数，该参数文件可以其他文件名另存于其他文件夹中，需要调用时再进行加载。1.5 运行环境1) CPU P200以上；2) 操作系统类型：32位(32bit)2)内存 64M以上；3)硬盘 200MB以上；4)视窗 Windows 98以上。第2章 电控及数据采集软件的开关2.1 电控及数据采集软件的开启双击采集及电控软件快捷方式，弹出采集及分析软件的操作界面，如图 21所示。图 21 数据采集及控制软件的参数设置界面2.2
7、 采集及分析软件的关闭采集软件的关闭可以通过以下两种途径实现：1） 单击采集及分析软件右上角的，则采集软件关闭。2） 点击“文件”“退出”，如图,2-2所示。图 2-2 采集软件关闭路径第3章 参数设置3.1 数据采集卡设置点击工具栏中的视图-工具栏和停靠窗口-采集设置，即可调出采集设置面板。图3-1 采集设置面板的调用图3-2 采集参数设置面板3.1.1 输入通道、触发通道采集卡信号通道为通道1或通道2，根据使用情况选择相应的信号输入通道；触发通道选择通道3。3.1.2 输入量程输入量程为TDC数据采集卡的触发电平及阀值电压的有效设置范围，范围应选择 -1.214,1.214。如果触发电平或
8、者阀值电压的设置值超过了-1.214V，数据数据采集卡也以-1.214来计算。3.1.3 采样频率采样频率分多个档位，含2.5G、1.25G、833M、625M、500M、250M，根据需要，选择合适的档位，常用1.25G采样频率。3.1.4 触发电平根据触发信号的信号强度，选择合适的触发电平，保证采集过程可以正常单触发，避免出现触发电平的绝对值设置过大无法触发以及设置过小出现多次（2）触发的现象。3.1.5 触发延时触发延时的作用是通过设置一定的时间长度（单位为us），使得在0到设置的触发延时的时间段之内的质谱图不显示；触发延时以微秒为单位，步长为6.4ns。3.1.6 阀值电压阀值电压的设
9、置均为负值，该参数的作用是：输入到TDC数据采集卡的信号，其强度的绝对值小于设置值的绝对值，则不被采集到，反之，大于设置值的信号强度则被采集，记录到总信号强度TIC（Total Ion Counts）中。阀值的设置最小间隔为1mV，最低阀值电压4mV。3.1.7 采样长度采样长度是指以外触发信号为起点，单次数据采集的时间长度。设置值越大，记录的离子飞行时间越长，则相应离子的质荷比（m/z）值越大。用户根据需要，设置合适的采样长度，避免出现设置值过小，目标峰在软件上显示不出来的现象。3.1.8 累加次数设置累加次数是指每得到一个谱图，所需要累加的推斥次数。举例说明：假设推斥频率为6000Hz，即
10、每秒钟推斥6000次，如果累加次数设置为6000，即累加6000次推斥出一个谱图，即每秒得到一个质谱图。同理，累积次数设置为12000，则每两秒出一个谱图，各个峰的强度约变为6000次累加的两倍。3.1.9 谱图数量谱图数量是指需要采集的质谱图的个数，以图3-2为例，TIC个数设置为10000，则共采集10000个谱图后采集停止。3.1.10 采样时间 采样时间是指TIC图采集时间的长短，它的大小由累加次数和谱图数量来决定。3.1.11 缓存大小缓存档位共分为7个：1 Mb、2 Mb、4 Mb、8 Mb、16 Mb、32 Mb、63Mb，可根据采集数据大小选择合适档位，常用档位为63Mb。3.
11、1.12 降噪可根据需要，勾选降噪功能，以平滑曲线图，降噪前后对比如图3-3及3-4所示。注：降噪前后导出的质谱数据均为原始数据，不因降噪功能的勾选而改变真实数据。图3-3 Mass图降噪前图3-4 Mass图降噪后3.1.13 数据保存路径点击“视图”“工具栏和停靠窗口”“ 数据目录”，调出数据目录设置面板，如图3-5；点击即可设置存贮路径，如图3-6；点击开始采集，软件跳出文件名输入对话框，默认按照电脑记录时间为文件名，也可自行设置（注：命名可为字母、数字、符号等，不支持中文命名），如图3-7所示。图3-5 调用数据目录设置面板图3-6 设置数据采集文件的存储目录图3-7 设置数据采集文件
12、名3.2 质量分析器参数设置3.2.1 质量分析器参数面板如图3-8，点击工具栏“控制”“仪器控制”“参数设置”，弹出“质量分析器参数设置”面板或者单击工具条“set”按钮。面板主要包含运行参数监测、环境设备、中低压、脉冲、高压、射频、极性切换（含启动正、负离子模式、关闭质量分析器）等7个功能模块，绿色指示相应模块已处于工作状态，灰色指示相应模块处于关闭状态。图3-8 质量分析器参数设置3.2.2 中低压参数设置可手动键入电压值，也可调节按钮，进行微调；勾选时，则同组装置电压值可同时抬高或降低。图3-9 中低压参数设置3.2.3 脉冲电压参数设置可手动键入电压值，也可调节按钮，进行微调；功能模
13、块划分为两个部分，一个是分析脉冲推斥部分相关电压设置，另外一部分是Skmmier2电压设置。Skmmier2可选“直流模式”或者“脉冲模式”，正常使用直流模式，如果想进一步提高一定质荷比范围内离子的信号强度，可将Skimmer2模式选定为脉冲模式。（注：Skimmer2脉冲模式下仅会提高一定m/z内离子的信号强度，呈现质量歧视现象。当仅关注某一离子且该离子信号较弱时，推荐使用该功能）Skimmer2模式选择为“直流模式”时，正离子模式下SkimmerL电压输出有效，负离子模式下SkimmerH电压输出有效。Skimmer2模式选择为“脉冲模式”时， Skimmer2施加脉冲电压，Skimmer
14、L、SkimmerH电压均输出有效，脉冲产生的时间（即脉冲延时）、宽度（即skimmer脉宽）及幅值（即SkimmerH与SkimmerL的电压差）均可调节；skimmer2施加脉冲电压后，可对某种离子进行富集，通常富集小离子时需减小“脉冲延时”时间，增大“Skimmer脉宽”；相反，通常富集大离子时需增加“脉冲延时”时间，减小“Skimmer脉宽”。图3-10 脉冲参数设置3.2.4 高压参数设置可手动键入电压值，也可调节按钮，进行微调；勾选时，分析器电压处于待机状态，此时加速电压（ACCE）及MCP电压压差减小至1000V以内。图3-11 高压参数设置3.2.5 射频电压参数设置可手动键入电压值，也可调节按钮，进行微调；勾选时，则同组装置电压值可同时抬高或降低，见图3-12。RFQ提供两个共振频率(f)，分别为1.4MHz及800KHz；MIR提供两个共振频率，分别为700KHz及500KHz。由离子传输质量与射频四极杆电场频率(f)及幅值（Vpp）关系（m/z Vpp/f）可知，测量小离子时（如30m/z1500），建议RFQ频率为1.4MHz，MIR频率为700KHz，同时根据目标物m/z大小，增大或降低两段四级杆射频电压幅值；测量大离子时（如m/z1500），建议RFQ频率为0.7MHz，MIR频率为500KHz，同时抬高射频电压幅值。图3-12
