第二章节C-遗传学数据的统计分析及习题幻灯片

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1、第三部分 遗传学数据的统计分析及习题,第二章 孟德尔定律及其扩展,一 、遗传学数据的统计分析,1 概率及其应用 2 二项式及二项概率 3 卡方检验法(适合度检验),1 概率及其应用,概率(probability, p)指在反复实验中,某事件发生的可能性的大小。 当F1植株的花粉母细胞进行减数分裂时,C与c基因分配到每个雄配子中的机会均等,即在形成的雄配子总体中带有C或c基因的雄配子概率各为1/2。,概率的基本定律 乘法定律: 两个独立事件同时发生的概率等于各个事件发生概率的乘积。 例如豌豆的黄子叶、圆粒 ; 绿子叶、 皱粒 这两对性状是受两对独立基因的控制,属于独立事件。 Y或y、R或r进入一

2、个配子的概率各为1/2,而两个非等位基因同时进入某一配子的概率各基因概率的乘积,1/2* 1/2= 1/4.,黄圆红3/4*3/4*3/427/64 绿圆红1/4*3/4*1/49/64 黄红皱3/4*3/4*1/49/64 黄圆白3/4*3/4*1/49/64 绿圆白1/4*3/4*1/43/64 绿皱红1/4*1/4*3/43/64 黄皱白3/4*1/4*1/43/64 绿皱白1/4*1/4*1/41/64,进行双因子杂交(AABB x aabb),预测F2群体中aaBb出现的概率是多少? aa Bb P(aaBb)=1/4*1/2=1/8,乘法定律例子,如果一个家庭计划要两个孩子,则两个

3、孩子都是男孩的概率0.5*0.5 都是女孩的概率0.5*0.5,加法定律: 两个互斥事件同时发生的概率是各个事件各自发生概率之和。 互斥事件:是一事件出现,另一事件即被排斥。 例如:一个骰子有6个标有数字的面,每面向上的概率均为1/6,得到5或6的概率1/61/61/3,可表示为p(5或6)p(5)+p(6),乘法定律与加法定律的联合使用 一个家庭连续2个孩子均为男孩和均为女孩的概率是p0.52(全男)0.52(全女),2 二项式及二项概率,二项式展开通常用于分析某一事件的各种组合所出现的概率。 例如:基因型分别为AA、Aa的个体婚配后生有3个孩子,这3个孩子可能的基因型组合有4四种可能: 均

4、为AA; 两个为AA和一个Aa; 一个为AA和两个Aa; 均为Aa;,利用二项式展开式可计算各种后代基因型组合的概率。 用p、q分别表示后代基因型出现的概率,p、q均为1/2。 (p+q)3=1p3+3p2q+3pq2+1q3 =1AA3+3AA2Aa_3AAAa2+1Aa3 这3个孩子可能的基因型组合的概率分别为1/8、3/8、3/8、1/8。,如果后代个体比较多,利用二项式展开每一项难度较大,此时可利用二项式展开式的通式进行计算。,p,q分别为后代个体各表现型或基因型出现概率; n为后代个体总数; s,t分别代表概率为p,q的表现型和基因型的个数; !代表阶乘。0!或任何数的0次方均等于1

5、。,例题: 基因型分别为AA、Aa的个体婚配后生有5个孩子,其中3个为AA、2个为Aa的概率为:,3 卡方检验法(适合度检验),由于各种因素的干扰,遗传学试验实际获得的各项数值与理论上按估计概率估算的期望值常有一定的偏差。 两者之间出现的偏差是属于试验误差?还是真实差异,需要x2测验判断。 对于计数资料,先计算衡量差异大小的统计量x2 ,根据x2值查知其概率大小,可判断偏差的性质,称作x2 测验。,x2 测验的一般步骤:,(1)明确理论假说,根据总数和理论上预期的比例求理论值。 (2)求差数并计算x2 值。 进行x2测验可利用一下公式(O是实际值,E是理论值,是总和):,(3)求自由度 自由度

6、:指总数确定后,实际变数中可以变动的项数。常为总项数1 (4)确定符合概率的标准 P 大于 0.05实际值与理论值差别不大 P 小于 0.05差异显著,不符合假说 P 小于 0.01差异极显著 (5)根据x2 值和自由度查x2 值表,可以找到相应的P值。,二、习题 课堂作业(一)分离定律,1 人类中,已知有耳垂(A)对无耳垂(a)是显性,根据下列家系图分析三代个体的基因型。,1,2,2 白化病是一种常见的常染色体隐性遗传病,由于患者体内编码酪氨酸酶的基因发生突变,导致酪氨酸酶缺乏,使黑色素的合成发生障碍,从而引起白化症状。患者的虹膜、皮肤、毛发缺乏色素。 现以a表示该病的致病基因,与其等位的正

7、常基因为A,当一对夫妇均为携带者时: (1)他们的后代白化病患儿的概率是多少? (2)表现型正常个体的概率是多少? (3)在表现型正常的个体中,白化病基因携带者的概 率是多少? Aa Aa (亲代) AA Aa Aa aa (子代) (1)1/4; (2)3/4;(3)2/3,课堂作业(二)自由组合,1 进行双因子杂交(AABB x aabb),预测F2群体中aaBb出现的概率是多少? aa Bb P(aaBb)? 1/4*1/2=1/8 2有基因分别为AaBbCcDd和AaBbCcDd(假定4对基因均为完全显性)的个体杂交,在F1后代中,预期出现的表现型种类有 16 种,后代中表现A_BbC_D_的个体比例是 27/128 .,3 人类两对性状的遗传,在一个家庭中,丈夫为多指症患者(属AD型常染色体显性遗传,基因型暂定为F_),妻子正常,他们生育的第一个孩子为聋哑儿(属AR型常染色体隐性遗传,基因型为dd)。试问:这对夫妻若再生育,表型有几种,各表型概率多大?,题解: 孩子是聋哑儿患者,则父母均为聋哑致病基因的携带者 DdDd; 孩子不多指ff,则父亲的基因型为DdFf 母亲的基因型为ffDd。 FD Fd fD fd fD fd 表现型: 全部正常 仅多指 多指聋哑 仅聋哑 概率: 3/8 3/8 1/8 1/8,P51页思考题16.,

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