第二讲 NCBI序列检索,(一)NCBI简介,NCBI即美国国立生物技术信息中心(http://www.ncbi.nlm.nih.gov),于1988年11月4日立法建立,NCBI的主要任务是发展新的生物资讯技术,以增进对于健康和疾病相关的基本遗传分子的理解二)NCBI数据检索,例子1:下载水稻waxy基因,打开NCBI网址: http://www.ncbi.nlm.nih.gov 选择目标数据库Nucleotide 输入检索词 检索基因序列,例子2:下载2002年3月至12月提交的水稻 mRNA序列,打开NCBI网址: http://www.ncbi.nlm.nih.gov 选择目标数据库Nucleotide 输入检索词及限制条件 检索基因序列,例子3:下载玉米(Zea mays)的PEP羧化 酶(PEP carboxylase)蛋白质序列,打开NCBI网址: http://www.ncbi.nlm.nih.gov 选择目标数据库Protein 输入检索词 检索蛋白质序列,2. 检索长度为501个氨基酸的乙醛脱氢酶 (acetaldehyde dehydrogenase)的蛋白质 序列。
作业,1. 检索迄今为止发表在Nature上的人类基 因组序列3. 检索自己感兴趣的基因序列。