《化学信息学第一讲FGQ幻灯片》由会员分享，可在线阅读，更多相关《化学信息学第一讲FGQ幻灯片（31页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、化学与生物信息学,2019/6/3,1,化学学院农药与化学生物学教育部重点实验室,冯国强,2,中国科学院化学研究所博士，先后在英国谢菲尔德大学、剑桥大学、利兹大学从事过博士后研究，现任华师化学学院教授、博导。,,冯国强,个人介绍,办公室：化学楼540 实验室：化学楼530-532,3,21世纪是信息的时代！,如果我们把“检索工具”比作知识的宝库，那么“文献检索”就是打开知识宝库的一把钥匙,科技改变了我们获取信息的方式！,4,据美国科学基金会统计，一个科学研究人员花费在查找和消化学术资料上的时间需占全部科研时间的51%，计划思考占8%，实验研究占32%，书面总结占9%。 -美国科学基金会 NSF
2、(National Science Foundation),总结写报告 9%,5,科研工作中与信息相关的问题,如何在海量的信息中快速检索到相关的、高质量的信息？ 如何有效地分析目前的研究进展并确定新的研究方向？ 如何及时跟踪某研究方向的最新进展？ 如何有序管理所检索到的大量文献？ 如何迅速提高论文写作的效率？ 如何全面了解所发表论文及其期刊的影响力 确定投稿方向？,信息检索贯串整个科研过程！,6,如何获取我们所需要的信息？,Are these enough? NO！,这门课你将学到：,化学文献基础知识 如何检索文献 （重点）,7,Chemical informatics,欢 迎 步 入 化 学
3、 信 息 学,8,是一门应用信息学方法解决化学问题的学科！ Cheminformatics, Chemical Informatics,The mixing of information resources to transform data into information, and information into knowledgeBrown 1998,A generic term that encompasses the design, creation, organization, management, retrieval, analysis, dissemination, vis
4、ualisation, and use of chemical information into knowledge Paris 2000,以化学、化工、计算机与信息技术为基础的边缘学科，它涉及化学化工信息的获取、管理、处理与控制、计算推演与模拟和图形表示的技术与方法。,什么是化学信息学？,9,化学、化工文献学 文献信息检索 个人资料管理,化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输 化学结构、化学反应的计算机表示、化学数据库技术 化学信息的网际通讯语言,化学图形 化学信息可视化和虚拟技术，化工制图,涵盖六个方面的内容！,化学信息学领域范围,10,化学信息学领域范围,化学信息的解析与处理 化学实验
5、设计，实验数据处理，图谱分辨与解析 生物分子的信息解析，多元分析和数据挖掘技术,化学知识的计算机推演 结构与性质关系，分子及其聚集体系的计算机计算与模拟， 分子与材料设计，化学反应分析与设计，化工过程计算与模仿,化学教育与教学的现代技术与远程信息资源,11,课程目的,熟练使用检索工具,快速检索信息资源,充分利用信息资源,有效识别信息资源,课程安排（9周）,课堂讲授与讨论 上机实践与练习,12,考核,教材,参考书,第一章 科技文献基础知识,科技文献的基本常识,13,继承功能、传递交流功能,文献的属性,知识性、记录性、物质性,文献的级别,一次文献、二次文献、三次文献,文献的功能,文献是记录知识内容
6、的信息集合体，是人类进步和发展的经验总结，是科技情报的源泉。,14,书目、题录 索引、文摘,词典、名录 指南、手册、年鉴,评述、论文丛集 百科全书,二次文献,原始文献 (一次文献),三次文献,文献整理,重组、浓缩,（检索工具）,（参考性文献）,文献结构示意图,15,文献的分类,科技期刊 科技图书 专利文献 科技报告 会议文献,学位论文 技术标准 产品资料 电子出版物,16,文献数量迅猛增加,现代化学文献特点,17,文献种类繁多，形式多样 类型：图书、期刊杂志、科技报告、学位论文、会议资料 文献载体：印刷型、缩微型、机读型 文献性质：一次文献、二次文献、三次文献,电子文献与网络检索普及 化学数据
7、库 （Scifinder、Reaxys、ISI Web of Knowledge等） 全文数据库（ACS、RSC、Elsevier、Wiley InterScience数据库）,18,科技文献的检索方法,科技文献的检索途径,著者途径 序号途径 分类途径 其它途径,如著作目录、作者索引等,如标准号索引、登记号索引等,如分类目录、分类索引等,如分子式索引、书名索引等,19,查阅科技文献的基本原则,科技文献的检索方法,（1）掌握部分文献检索工具,目录、题录与摘要 索引、述评与文摘指南 几种重要的数据库 几种检索性期刊 利用www与计算机文献检索系统 参考工具书,20,科技文献的检索方法,（2）确定跟
8、踪浏览的重要期刊,权威性刊物，如J. Am. Chem. Soc. 有关专业刊物，如J. Org. Chem. 消息性刊物，如C&E News, Science News 科普性刊物，如Scientific American,（3）阅读文献时注意参考文献的引证,21,Top 化学杂志,Nature IF = 36.28 Science IF = 31.201 Nature Chem. IF = 20.524 Angew. Chem. Int. Ed. IF = 13.455 J. Am. Chem. Soc. IF = 9.907 Chem. Comm. IF = 6.169 Chem. Sc
9、i. IF = 7.525,Chem. Rev. IF = 40.197 Accounts Chem. Res. IF = 21.64 Chem. Soc. Rev. IF = 28.76,2011年影响因子,22,文献的检索方法,（1）直接法：从浏览原始文献中直接查出与 课题相关的文献线索，依据文献线索查原始文献。,（2）追溯法：依据文献所附的参考文献为线索 查找文献的方法。,（3）工具法：利用文摘和索引等检索工具进行检索。,23,2012,Cited References,2000,1998,2001,1993,2010,Times Cited,Related Records,2004,1
10、999,2002,1994,2009, Citing ,2011,从一篇高质量的文献出发 沿着科学研究的发展道路,Times Cited 越查越新,Cited References 越查越旧,Related Records 相同参考文献或同时被引用的文献，越查越深,第二章 科学研究方法和科技论文写作,24,一、科学研究的方法,1.科研课题的选题,要具有创新性和先进性 要注意实际性 要考虑科学上的可行性 要抓住关键性的时机,（1）选题原则：,25,历史和现状的调查 实地考察 文献调查 资料的整理 研究方案的制定,（2）调查研究：,26,科研实验中的基本步骤,（1）理论准备 （2）实验方案的设计与
11、制定 （3）实验器材与原料的准备 （4）实验过程中的观察与记录 （5）实验结果的整理与数据的分析评价 （6）实验报告,二、科技论文的写作与参考文献的引证,摘要,标题,作者,引言,参考文献,结果,28,讨论,结论,致谢,附加材料,实验方法,29,1.科技论文的写作,（1）标题 （2）摘要 （3）引言 （4）实验方法 （5）结果与讨论,（6）结论 （7）致谢 （8）参考文献 （9）附加信息材料,（1）引证原则（及时性；珍贵性；准确、相关性） （2）引用格式（不同杂志要求不同，关注每种杂志的投稿须知）,2.参考文献的引证,30,1.请从网上查阅你感兴趣的与化学有关的研究性文章（一篇中文， 一篇英文），并写出它们的论文组成部分，参考文献的引证次序。 2.根据你个人兴趣，在网上搜索1-2个你感兴趣的研究小组的网站 和相关内容截屏。 3.你对本课程的期待或要求或建议？ Word版本电子版作业请发送到以下邮箱： 作业命名：名字-学号-日期.doc,思考题（课堂上机实习）,31,
