黄瓜总dna的提取及鉴定

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1、黄瓜总DNA的提取及鉴定 摘要:植物DNA首先要在液氮或干冰中将新鲜或冷冻的植物组织研磨成粉,使细胞壁破碎,再用含有去污剂、螯合EDTA等成分的提取缓冲液处理组织匀浆。用氯仿-异戊醇把组织匀浆中变性的蛋白质除去,将DNA与细胞中的蛋白质、碳水化合物等分开;再用RNase A去除核酸中的RNA,剩下的便是DNA。DNA可用乙醇或异丙醇沉淀,沉淀的DNA可用挑取或离心方法收集。DNA的纯度可用紫外分光光度计做初略测量。核酸、蛋白质、盐与小分子的最大吸收峰值分别为260nm、280nm及230nm。顺序测定一个样品在这三种波长下的OD值,如果提取的样品较纯,蛋白质及小分子的污染较小,则OD/OD1.

2、8,OD/OD2.0。通过测定OD,根据公式(双链)的浓度(ug/m L)。DNA的完整性可用凝胶电泳来测定。常用的凝胶有聚丙烯酰胺与琼脂糖。琼脂糖电泳可分理相差100bp的DNA片段,但分离范围大,制备简单。方法:植物组织(削皮的黄瓜)在液氮中研磨,磨好的组织溶于65 CTAB提取缓冲液中,保温一段时间后用酚-氯仿抽取2次,除去变性的蛋白及大部分碳水化合物。再用乙醇将DNA沉淀下来。获得的DNA用紫外分光光度计测定浓度及纯度,再用琼脂糖凝胶电泳检测完整性。关键词:DNA,提取及鉴定1. 实验材料与方法1.1实验材料黄瓜1.1.1试剂液氮; CTAB提取缓冲液;TE缓冲液或重蒸水;酚:氯仿:异

3、戊醇=25:24:1;异丙醇或无水乙醇;TE缓冲液,重蒸水;0.3%(m/V)标准琼脂糖;0.5TBE缓冲液,上样缓冲液;EB;1.1.2器具研钵,小药勺;1.5 m L小离心管若干;定量移液器及枪头;离心机;恒温水浴锅;紫外分光光度计;水平电泳槽;三角瓶(500或1000mL);微波炉或沸水浴,透射紫外灯1.1.3生物材料黄瓜1.2试验方法1.2.1 提取DNA1. CTAB于65,水浴30min。2. 称取8g(黄瓜去皮)研磨破碎细胞壁。3. 加20 mol CTAB于研磨中混匀酚浆,2支离心管于65水浴15min ,3500 Hpm,5min去除残渣。4. 取上清液5mL于离心管中,加入

4、5mL氯仿-异戊醇上下颠倒混合2 min5. 上清液转移至小烧杯中加2倍体积预冷的乙醇,观察纤维状沉淀。6. 转移10mol离心管中,4水箱保存备用1.2.2 DNA浓度及纯度的测定1. 将提取的DNA粗产物离心3500 rmp,10 min。2. 弃上清液,加约5mL70% 乙醇吹打洗涤,使沉淀悬浮。3. 3500 rmp,10min使DNA沉淀。4. 弃上清,2支离心管:一支加5mL氯化钠水溶液溶解;另一支4保存下次备用5. 用氯化钠作对照基线校正后沉淀220-350nm的光谱图。6. 用氯化钠作空白对照,测定OD、OD、OD。1.2.3 琼脂糖凝胶电泳1. 制胶:称取0.25g琼脂糖溶解

5、在25mL1TBE中微波炉加热,微沸3次冷却至60倒胶。2. 点样:待胶冷却凝固后,将DNA样品加2mlddHO溶解,取10ml与3ml loading buffe混合,并用移液枪小心加入至样品槽中3. 电泳:点样端放在负极。120V,40 min 凝胶成像,EB染胶10min,流水5min,凝胶成像在系统下观察。2. 结果与分析2.1提取DNA提取出黄瓜的DNA。2.2 DNA浓度及纯度的测定1. 记录220-350nm时的光谱图2. 计算OD/OD,OD/OD,分析DNA的纯度OD=DNA的浓度=50OD稀释倍数=波长换成280nm及230nm,用同一样品再次测OD的值:OD = ; OD

6、=OD/OD= ; OD/OD=则提取DNA的纯度2.3 琼脂糖凝胶电泳观察并分析DNA的电泳图像从图中可以看出,如果基因组DNA完整,应该仅出现一条主带;如果很多条深浅不一的带,则说明DNA已经降解;如果背景模糊,说明在DNA样品中混杂有RNA;3.1提取DNACTAB提取液中各试剂分别的作用?1. 细胞膜裂解,使DNA释放到提取缓冲液中,同时使组织匀浆中的蛋白质变性;缓冲液中的-疏基乙醇,-疏基乙醇抑制从组织匀浆释放的多酚氧化,防止植物组织黄褐变。3.3 琼脂糖凝胶电泳影响DNA电泳速率有哪些因素?1. DNA片段的长度;2. DNA的构象;3. 琼脂糖的浓度;4. 电压电泳的原理:带电物质在电场中向着与共电荷相反的电极移动DNA分子在高于PI的溶液中带负电荷在电场中向阳极移动。琼脂糖的作用:使DNA分离开琼脂糖凝胶的口径越大,能被分离的DNA越大。

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