生命的化学基础1

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1、生命的化学基础,http:/ 普通生物学课程网站,不同类型的细胞结构和功能不同,但化学组成基本相似生命的物质基础 一、元素组成 无机界的 C、H 、O 、N 、P 、S 二、分子组成 1、水和无机盐 2、糖类 3、脂类 4、蛋白质 5、核酸,一、元素组成,生命形式多样,但基本元素构成是基本一致的,% O C H N P S 其他,人 65 18 10 8 1.0 0.25 2.75,杆菌 69 15 11 8 1.2 1.00 5.00,基本元素:C,H,O,N,S,P,K,Ca 等占人体99.35%。,其它元素:Na,Fe,Mg,Mn,Zn,Cu, Cl,I等数量少,但作用大。如很多金属元素

2、是酶的辅助因子。 偶然存在的元素:V、Mo、Li、F、Br、Si、As、Sn、等,Fe 氧的运送和酶的活性有关,缺少时,引起缺铁性贫血。 Cu 发生冠心病的主要原因,与酶的活性有关。 Zn 在青少年的发育生长,癌症等的发病和防治起有作用。 Mo (钼)与酶的活性、食道癌的发病率和防治有关。 I 缺碘产生地方性甲状腺肿,幼儿发生呆小症, Mn (锰)与酶的活性有关。 Co (钴)与酶的活性有关。青春期少女0.015mg/每日。 V (钒)软体动物富有钒;鱼体含量较低。,微量元素,F (氟)与牙齿健康有关,缺氟产生龋齿;过多则斑齿和氟中毒。,Ni (镍)植物中1555ppm,人为0.1ppm;急性

3、白血病.25g/ml,Sn (锡)影响骨钙化速度;,Si (硅)矽肺,Si浸润细胞。,Se (硒)缺硒产生克山病,与肝功能,冠心病发病和防 治有关.,功能,1、构成原生质 2、组成多种多样的化合物 3、影响生物体的生命活动,二、分子组成,不同类型的细胞,分子组成大致相同,但是这些物质的相对含量相差很大。,无 机 物,水(water)生命的源泉 无机盐(mineral) 离子 调节生命的环境 细胞渗透压 PH 酶的活化,水和无机盐,水 水的特性符合生物生存的需要: 水是极性分子,形成极性共价键,可以和相邻的水分子形成不稳定的氢键,使水有较强的内聚力和表面能力; 很强的结合能力、最好的极性溶剂,对

4、于物质的运输、生命中化学反应的进行,正常的新陈代谢具有重要意义; 水的比热为1cal/g,在温度改变时,热量的需求和释放较大,使细胞的温度和代谢速率得以保持稳定,维持体温; 固态水比液态水的密度低,有利于水生生物的生存。,无机盐,主要的阴离子有: Cl、 PO4 3 -和HCO3 主要的阳离子有:Na+、K+、Ca2+、Mg2+、Fe2+、Fe3+、Mn2+、Cu2+、Co2+、Mo2+,作用: (1)对细胞的渗透压和PH起着重要作用 (2)酶的活化因子和调节因子, Mg2+ , Ca2+ (3)合成有机物的原料PO4 3 -合成磷脂、核苷酸 (4)动作电位、肌肉收缩等,Na+、K+、Ca2+

5、 内环境稳定:PH值 生物生存38.5,各种生物、各种组织均有适宜的PH范围,细胞中的离子有一定的缓冲能力。,有 机 物,糖(Carbohydrate) 脂类(Lipid) 蛋白质(Protein) 核酸(Nucleic acid)等,1、糖类,功能:,生命活动所需能量来源; 与生物体的结构有关; 储藏的养料; 分子识别作用; 具有润滑保护作用。 组成:C:H:O=1:2:1,糖的分类,单糖- 构成各种糖分子的基本单位 寡糖- 由少数几个(2-10)单糖分子连接 多糖 大量单糖分子连接形成的糖 结合糖糖脂、糖蛋白和蛋白多糖等,单糖分类,己糖,丙糖,戊糖,丁糖,重要的单糖,甘油醛 核糖 脱氧核糖

6、,半缩醛羟基,半缩醛羟基,葡萄糖 果糖 半乳糖,寡 糖(oligosaccharides),-麦芽糖,麦芽糖、蔗糖、乳糖,蔗 糖,-D-葡萄糖残基 -D-果糖残基,乳糖,-D-半乳糖残基 D-葡萄糖残基,多 糖,由很多单糖分子缩合脱水而成的分支或不分支的长链分子,如淀粉、糖原、纤维素,多糖(polysaccharides),均一多糖 淀粉 植物细胞(谷粒,块根,果实) 糖原 动物细胞(如肝细胞中的糖原) 纤维素 植物细胞 木材-50%纤维素,棉花-90%纤维素 非均一多糖 透明质酸 软骨素,纤维素,3、脂类 生命体的重要构件和储能物质,由C、H、O组成,H:O远大于2,不溶于水,能溶于非极性溶

7、剂,类别较多,结构差异很大 功能: 生物膜的组成,磷脂、胆固醇 储存能量 生物表面的保护层 很好的绝缘体,保温 生物学活性,(1)脂肪,甘油和脂肪酸结合而成,甘油的每一个-OH和脂肪酸的-COOH结合,形成酯键。,+,(2)蜡(wax) 由长链脂肪酸和长链一元醇脱水而成,皮肤表面,毛、羽、植物叶及果实表面以及昆虫体表 (3)磷脂(phospholipids) 磷酸甘油脂,甘油的一个-羟基和磷酸结合成酯,存在与细胞的膜系统中,在脑、肺、肾、心、骨髓、卵及大豆细胞中含量丰富。 卵磷脂、脑磷脂、丝氨酸磷脂等。,(4)其他脂类,类固醇 特殊芳香族结构,理化性质与脂肪相近 萜类 结构与类固醇相似。 如植

8、物细胞中的胡萝卜素 维生素E 维生素K 结合脂类,4、蛋白质 遗传信息的表达者,氨基酸 遗传信息载体 蛋白质的结构- 多层次 蛋白质结构与功能的关系 变化多端,生物分子信息,细胞,分子,存贮、复制和传递 遗传信息的系统,生物信息的载体,DNA通过自我复制,在生物体的繁衍过 程中传递遗传信息,基因通过转录和翻译,使遗传信息在生物 个体中得以表达,并使后代表现出与亲代 相似的生物性状。,基因控制着蛋白质的合成,DNA,RNA,蛋白 质,转录,翻译,蛋白质的功能,酶的催化作用 运载和贮存 协调动作 机械支持 免疫保护 产生和传递神经冲动 生长和分化的控制,蛋白质的构件分子 氨基酸,氨基酸的通式 氨基

9、酸的分类,氨基酸的通式,组成蛋白质的常见氨基酸有二十种 ,通式如下: R不同,组成的 氨基酸就不同,20种标准氨基酸的英文简写,氨基酸的分类,对于20种标准的氨基酸,按照侧链化学性质的不同,可以分为以下三组: 疏水性的氨基酸 Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Pro、Trp和Met 带电氨基酸 Arg、His、Lys(+)和Asp、Glu(-) 极性氨基酸 Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、Tyr,甘氨酸(Gly)的侧链只有一个氢原子,是最简单的氨基酸,具有独特的性质,可以单作为第四类,也可以归于第一类。 含有芳香性侧链 Phe、Tyr、Trp、His 侧链为醇或酚的氨基酸

10、有 Ser、Thr、Tyr 可以形成氢键 Arg、Lys、Asp、Glu、Ser、Thr、Asn、Gln、His、Tyr,肽键、肽和多肽,不同数目的氨基酸以肽键顺序相连,形成链状分子,即是肽或多肽,通常分子量在1500以下的为肽,在1500以上的为多肽,-NH2端为N末端写在左,另一端为C末端,写在右。,蛋白质的结构层次,1、一级结构 2、二级结构 3、三级结构 4、四级结构,蛋白质一级结构,肽键 肽链 氨基酸排列顺序等,二级结构,肽链的主链在空间的走向 -螺旋 -折叠,-螺旋,平行 -折叠,反平行 -折叠, -折叠,蛋白质的超二级结构,(i)环花样 (ii)发夹花样 环花样 (iii)希腊图

11、案花样 由四条反平行片组成 (iv)花样 -环- -环-,三级结构,亲水基位于球体表面,疏水基位于球体内部 球状蛋白溶于水,球蛋白 近似球形,表面富含亲水基团,溶于水 如:酶、多种蛋白质激素和各种抗体 细胞质和细胞膜中的蛋白质 纤维蛋白 蛋白质分子围绕一个纵向轴缠绕成螺旋状 如:指甲、毛发、真皮、韧带等,三级结构(tertiary structure) 在二级结构基础上的肽链再折叠形成的构象,胰岛素的三维结构,四级结构,多亚基构成的寡聚蛋白结构 均一寡聚蛋白 由相同亚基构成 非均一寡聚蛋白由不同亚基构成,四级结构(quanternary structure) 组成蛋白质的多条肽链在天然构象空间

12、上的排列方式,多以弱键互相连接:疏水力、氢键、盐键;每条肽链本身具有一定的三级结构,就是蛋白质分子的亚基。,蛋白质的各级结构,氨基酸,一级结构,二级结构,三级结构,四级结构,血红蛋白,蛋白变性,可逆变性,不可逆变性,尿素,天然核糖核酸酶,硫醇,松散核糖核酸酶,变性核糖核酸酶,天然核糖核酸酶,除去硫醇,除去尿素,除去硫醇,除去尿素,核酸(nucleic acid) 以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。 DNA(Deoxyribonucleic acid)脱氧核糖核酸 RNA(Ribonucleic acid) 核糖核酸,5、核酸的化学结构,脱氧核糖核酸(DNA),主要存在于细

13、胞核的染色质内,2%在线粒体。 遗传的物质基础,核糖核酸(RNA),主要存在细胞质,10%在核仁 参与生物体内蛋白质的生物合成,根据RNA的功能,可以分为mRNA、tRNA和rRNA三种。,第一节 核酸的化学组成与结构,一、核酸的化学组成,核苷酸由核糖、磷酸和含氮碱三部分构成,(一)碱基,1、嘧啶碱,2、嘌呤碱,3、稀有碱基,(二)戊糖,(三)核苷,(四)核苷酸,(五)多磷酸核苷酸和环化核苷酸,二、DNA分子的结构,(一)DNA分子的大小,天然存在的DNA分子最显著的特点是很长,分子质量很大,一般在1061010。 例如 大肠杆菌染色体由400万碱基对(basepair,bp)组成的双螺旋DN

14、A单分子。其长度为14X106nm,相当于1.4mm,而直径为20nm,相当原子的大小 黑腹果蝇最大染色体由6,2X107bp组成,长2.1cm 多瘤病毒的DNA由5100bp组成 ,长17nm(17000nm),(二)DNA的碱基组成Erwin Chargaf测定,1)有种的特异性 2)没有器官和组织的特异性 3)各种DNA分子中, A=T, C=G, A+G=C+T 4) 年龄、营养、环境的改变不影响DNA的碱基组成,(三)DNA的一级结构,分子较大 dCMP dGMP dAMP dTMP 磷酸二酯键 线型大分子,无分支,一级结构的表示方法,化学式,线条式,文字式,(四)DNA的二级结构

15、-双螺旋结构模型,DNA双螺旋结构的要点,(DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组成。 两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方向相反,即其中一条链的方向为53而另一条链的方向为35 嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。碱基环平面与螺旋轴垂直,糖基环平面与碱基环平面成90角。,(五) 超螺旋DNA,大多数原核生物 1)共价封闭的环状双螺旋分子 2)再次螺旋化超螺旋结构,三、DNA的一些性质,1、紫外吸收特性,2、DNA的变性(DNA denaturation),物理(热)或化学(碱)方法破坏维持DNA分子双链状态的氢键使成为单链的过程。 变性的特征:增色效应,黏度下降,沉降系数增加,生物学活性丧失,热变性:加热引起的变性。实验室常用的方法,增色效应:核酸分子加热变性时,其在260nm处的紫外吸收急剧增加的现象。,DNA解链曲线,Tm值 :当紫外吸收变化达到最大变化的半数值时,此时所对应的温度称为熔解温度、变性温度或用Tm值表示,第二节 RNA的分子结构,(一)RNA的类型,三种主要的RNA tRNA rRNA mRNA,1、mRNA:占细胞中RNA总量的3%-5%,分子量大小不一,不稳定,代谢活跃,更新迅速,是合成蛋白质的模板。 2、rRNA:细胞中含量最多的RNA,核糖

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