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1、免费全文生物医学网络期刊检索指南 (Free Full-text Biomedical Online Journals Search & Retrieval Guideline ),中南大学医学图书馆,随着Internet的飞速发展,网上免费生物医学全文期刊与日俱增,为了方便读者了解、检索免费资源,外刊收集了10个提供免费全文期刊的网站并对此10个网站的全文检索方法作了详细的介绍。,免费生物医学全文网络期刊简介,Pubmed() Pubmedcentral(www.pubmedcentral.nih.gov) Biomed central () Highwire(www.highwire.or
2、g) Freemedicaljournals(),DOAJ(www.doaj.org) J-STAGE(www.jstage.jst.go.jp/browse/) SciELO Brazil(www.scielo.br/) Oxford Journal(www3.oup.co.uk/jnls/) ISPUB(),第一讲:Pubmed,一、简介及收录范围 Pubmed是美国国家生物技术信息中心(NCBI)于97年开发的用于检索网上生物医学文献信息的检索系统。后加入NCBI开发的Entrez通用浏览器,更换了检索界面。它收录了: 1 、MEDLINE 2 、PreMEDLINE 3 、Publis
3、her supplied citations (出版商直接提供的文献信息),MEDLINE,收录了1966年以来全世界70个国家和地区4600余种生物医学期刊。每周更新。 内容涉及:医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等专业。 MEDLINE记录标注PubMed - indexed for MEDLINE,PreMEDLINE,未深度标引的临时性数据库,经MeSH词表标引 后,加入到MEDLINE中。 记录标注PubMed - in process,Publisher Supplied Citation,由出版商提供,但未被MEDLINE收录的文献。记录标注PubMed - as su
4、pplied by publisher,二、Pubmed著录格式,作者,文章标题,刊名,年,卷,期,页码,可链接免费的全文,相关文献及站点链接,三、PUBMED页面简介,Limits:对检索词进行限定。限定项包括字段、 出版类型、年龄、日期、性别、研究对象、语种等。 Preview/Index:Preview显示检中文献的条数。并能增加检索词与前面的检索词进行AND, OR, NOT的组配检索。Index按字顺对提交的检索词进行相关索引。,History: 显示检索策略和结果,存贮的检索策略为100个,时间为1小时。 Clipboard:集中存放选定的记录。方便用户打印、下载。最大存贮数为50
5、0条记录,一小时内无任何操作,记录将自动消失。,Journal database:期刊查找 Mesh database:医学主题词查找 Single Citation Matcher:单篇文献匹配 Clinical queries 临床咨询 Order documents 购买全文,四、Pubmed的功能及检索规则,1、词汇自动匹配功能(Automatic Term Mapping) (1) 医学主题词转换表(MeSH Translation table) 系统会自动将检索词与MeSH词对照并进行转换 例:Vitamin h 转换为: Biotin MeSH Terms OR Vitamin
6、h Text word (注:要了解检索词的转换情况可按“details”进行查询),(2)刊名转换表(Journals Translation table) 包括刊名全称、MEDLINE刊名缩写和ISSN号。 系统将刊名全称转换为MEDLINE刊名简写进行检索。 例:New England journal of medicine 转换为 “N Engl J Med”Journal,(3)、短语列表(Phrase List) 检索词与MeSH表和刊名转换表未能匹配,则与 短语列表中的词语进行匹配。短语来自MeSH,一 体化医学语言系统和补充概念(物质)名称表。 (4)作者索引(Author I
7、ndex) 当检索词与前三个表未能匹配时,或输入的词后面跟了1-2个字母时,则匹配“author index”。 姓名输入原则:姓(全称)在前,名在后(首字母缩写)。 例:Xia JH,如果检索词未能在四个表中找到匹配词。检索词则被断开,再分别查找匹配词。最终没有匹配词的话,短语中的单个词则用AND连接,在全部字段中查找。 例:pressure point转换为(pressureMeSH Terms OR pressureText Word) AND pointAll Fields),(5)短语被强制分割检索,2、短语不被分割匹配的检索功能 如果不想短语被强制断开,则需对短语加双引号。例如:
8、“single cell” “intensive care”,3、布尔逻辑运算检索功能 例: singer_p AU AND (analg OR sedation) AND “intensive care“ NOT 2001 DP AND、OR、NOT必须大写。 逻辑符的运算次序是从左至右,括号内的检索式可作为一个单元,优先运行。 布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识 查带文摘的文献 检索词 AND hasabstract 例如:acromegaly AND hasabstract,4、截词检索功能: 例:输入analg ,可检索出analgesia, analgesics 等 说明:将不
9、执行转换功能; 截词检索只限于单词,对词组无效,5、链接相关文献、图书及站点,部分还可链接全文,链接相关文献,链接NCBI,绿色的图标:全文免费,五、PUBMED的字段标识符,AB-Abstract LA-Language AD-Affiliation MH-MeSH Terms AU-Authors PMID-PubMed Unique dentifier CY-Country PT-Publication Type DP-Publication Date SO-Source EDAT-Entrez Date TA-Journal Title Abbreviation GS-GeneSymb
10、o TI-Title IS-ISSN UID-Unique Identifiers 备注:检索词字段标识符,六、文献检索的途径,基本检索 限定检索 Preview辅助检索 单篇文献的匹配检索 期刊检索 主题词的查询 临床查询,文献查询-基本检索,例如:检索fk506结合蛋白质在肾移植中的作用 (Fk506 binding protein;kidney transplantation),直接输入检索词,说明: 检索词可使用截词符,例如:analg ,可检索出analgesia,analgesics等 要使短语不分开检索,可用“”,例如“intensive care” 布尔逻辑符AND,OR,NO
11、T要大写; 作者姓名姓前名后首字母大写,例:Xia JH,要知道检索词的转换可按“detail”键;上个例子检索词转换形式为(“tacrolimus binding proteins“MeSH Terms OR fk506 binding proteinsText Word) AND “kidney transplantation“MeSH Terms 在检索词后可直接进行字段的限定,例如:tacrolimus binding proteinsMesh;Xia JHau,文献查询-限定检索(limits),(1),(2),(3),(4),(5),(6),(7),(8),(9),(10),说明:
12、 (1)字段的限定,例如title;title/abstract;MeSH (2)文献类型的限定,例如:review,letter,editorial (3)年龄段的限定,例如:2-5;6-12;13-18 (4)文献进入Entrez检索系统的天数限定 (5)期刊出版日期限定 (6)在带有摘要的文献中检索 (7)语种的限定 (8)人或动物的限定,(9) subets下选定:“AIDS”限制在艾制滋病文献库; “Dental journals”限制在牙科学文献库;“MEDLINE”限制在MEDLINE数据库;“Nursing journals”限制在护理学文献库;“pubmed central”
13、限制在PMC中检索;“toxicology”限定在毒理学数据库中检索; (10)性别的限定,文献查询-preview辅助检索,例如:alzheimer disease的基因疗法(gene therapy) 检索步骤: (1)在检索框中输入alzheimer disease,按“preview” (2)在“All Fields”选择一个检索字段,其右侧输入框中输入检索词gene therapy,点击AND,点击屏幕上部Preview开始检索并显示记录条数,这样可以反复操作;若点击Go则显示结果。,公元11年（4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff） (西汉王莽新朝三年
14、)，是中国古老的实证医学萌芽。由于儒、释、道三教合流所形成的中国文化格局，“重道轻器” （45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）衍生出的务虚倾向，重体悟而疏实证，必然缺少逻辑推理，致使中国的实证医学成就在日后难以与西方医学同日而语。古埃及医师运用念咒、画符和草药治病，前二者就是巫医。（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）西医在古希腊时期就开始医巫分家，亚里士多德曾详细描述了动物的内脏和器官，古希腊医学最高成就的代表人物希波克拉底将唯物主义哲学运用于医学之中，在论圣病中说：“被人们称为神圣的疾病(指癫痫和一些精神患者)，在我看来一点也不比其他病症更神、更圣，与其他
15、任何疾病一样起源于自然的原因。只因这些病症状奇异，而人们对它们又一无所知，充满疑惑，故而将其原因和性质归之于神灵。”亚里士多德所创立的唯物主义医学体系，加快了医学科学化的进程；（df4肺炎88gdg青霉素d25f肝炎df6） （df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2） 非凡（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）的事件都集中发生在这个时期。并且是独立地发生在中国、印度和西方”。这一阶段，（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）是东、西方哲学、科学、文化发展的重要时期。此时诸子蜂起，儒家、墨家、道家、法家学派林立，形成了空前绝后的学术繁荣局面，对中华文化的发展起了奠基作用；处在古典希腊文明的开创时期，（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）出现了德谟克利特、费底亚斯、阿基米德、苏格拉底等哲人和智者。在东、西方科学和文化昌明的大背景下，（4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff） 黄帝内经和希波克拉底全集代表着中、西两座医学的峰巅之作便自然而然的诞生了。内经的问世，标志着中医学已从简单的临床经验积累，升华到系统的理论总结。关于希波克拉底全集，意大利著名医史学家卡
