pubmed如何进行医学信息检索

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1、2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,1,美国医学文献数据库 MEDLINE,2008.9.22,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,2,一、数据库概况,（一）主办单位：美国国立医学图书馆(NLM)编制。 （二）收录学科内容： 主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。 包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学，基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,3,（三）文

2、献来源： 收录全球70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊，大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选,由NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。 近年数据涉及37种语种，回溯至1950年的数据涉及60种语种。数据库47%为美国本土出版文献，90%为英文文献，79%的文献有著者撰写的英文文摘，（以上数据根据2007年11月数据库提供）。,一、数据库概况,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,4,（四）收录数据类型 已处理完毕的数据（Indexed） 19

3、50-1965 回溯数据 1966 to present 近年数据 处理中的数据（In process）: 最新的、尚未经规范处理的数据，只有简单的篇名、作者、出处等书目信息和文摘，没有标引规范化医学主题词、物质名称、文献类型等信息。该库中数据在所有标引工作完成后，每周一次转入MEDLINE-Indexed数据库中。,一、数据库概况,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,5,收录图示,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,6,（五）MEDLINE的检索系统 NCBI-PubMed Ovid SP Web of Knowledge EBSCO OCLC First S

4、earch,一、数据库概况,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,7,不同检索系统中的Medline数据库,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,8,二、NCBI-PubMed,www.pubmed.org,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,9,（一）NCBI 网站简介 www.ncbi.nlm.nih.gov,1988年，美国的参议员 Claude Pepper 发起， 1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心（NCBI） NCBI的任务: 建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并进行先进方法的

5、研究。 促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。 促进全世界范围内生物技术信息收集的合作,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,10,NCBI 主页,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,11,NCBI 生物信息整合系统 All database,检索大分子生物学数据 获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列； 获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列；从核酸序列翻译到蛋白质的序列； 获取基因和染色体图谱；蛋白质三维结构数据及大分子模式（MMDB）等其他生物信息数据库检索。 PubMed书目文献数据。,2018/12/14,

6、复旦大学图书馆文献检索教研室,12,（二）PubMed简介,特点： 1. 免费提供题录和文摘 2. 提供与原文的网址链接(部分免费获取） 3. 提供检索词自动转换匹配 4. 操作简便、快捷,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,13,PubMed 收录数据,MDENLINE Indexed 1966 to prensent的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和摘要，每条记录标有 PubMed-indexed for MEDNLINE OldMDENLINE 1950-1965年间的MEDLINE数据，没有MeSH字段和摘要，每条记录标有 PubMed-OLDMDENLINE

7、 for Pre1966,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,14,PubMed 收录数据,MDENLINE Inprocess 最新的MDENLINE尚未标引的处理中数据。每条记录标有PubMed-in process。 Not MDENLINE 是出版商提供的电子文献，PubMed 收录，而MDENLINE不收录的数据。每条记录标有PubMed。,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,15,基本检索输入框,特征栏提供辅助检索功能,侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、规范词数据库检索、特定文献检索等,执行检索,PubMed 主页,高级检索,个性化服务,检索帮助手册

8、,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,16,可以在检索栏中输入一个或多个检索词（系统默认空格为AND检索） 如：placenta growth oxygen 可以在检索栏中输入布尔逻辑运算式（运算符必须大写） 如：asthma AND (therapy OR treatment),（三）PubMed 基本检索规则,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,17,输入多个检索词,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,18,字段限定符： 如：Stemti AND neuroscience 截词符：treat* 强迫短语匹配符：“brca 1” 严格按输入形式

9、匹配，不再自动转换匹配和扩展检索，常用于词组和专有名词检索。,（三）PubMed 基本检索规则,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,19,含字段限定的检索式,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,20,自动转换匹配检索词： 对常用医学名词进行自动在规范词索引、文本词及所有记录字段中转换匹配。 如：renal failure kidney failureMESH OR kidneyAll Field OR renal failure All Field,（三）PubMed 基本检索规则,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,21,2018/12/14,

10、复旦大学图书馆文献检索教研室,22,自动扩展检索： 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索。 如：输入hypertension therapy，系统自动检索高血压的药物治疗、饮食疗法,（三）PubMed 基本检索规则,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,23,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,24,著者检索(authors)： 姓全称在前，名首字母在后。 加字段限定符 如：genbacev oau moore amau 2002年以后的文章可以查著者全名 如：joshua lederberg,（三）PubMed 基本检索规则,2018/12/14,复旦大学图书

11、馆文献检索教研室,25,著者检索 moore amau,（三）PubMed 基本检索规则,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,26,期刊检索（journals）： 刊名全称检索 如：new england journal of medicineso MEDLINE认可的标准刊名缩写检索 如：clin exp immunolso 国际标准期刊号检索 如：1059-1524,（三）PubMed 基本检索规则,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,27,刊名的检索 （字段限定来源SO）,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,28,PubMed记录字段说明,

12、文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论 定稿版 校样版 输入日期 输入完成日期 电子出版日期,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,29,电子出版日期 文献出版日期 数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称 文献相关注释 基金编号 基因符号 期编号 资助调研者 资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号 期刊全称,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,30,最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘 版权拥有者 题录提供机

13、构的识别号 病史相关与原始记录 其他关键词 提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,31,作为主题词的个人姓名 出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码 正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码 标准期刊缩写 文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,32,（四

14、）PubMed的辅助检索,1. Limits（检索限制选择）： 字段限制：著者、刊名、篇名、出版日期、滤过（filter原文收藏处）等限制。 数据输入时间：默认检索可回溯到1950年，限制选择30天-10年。 各种文献类型限制 各种语种限制 期刊类别与学科文档限制,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,33,作者限定,添加作者姓名输入框,清除限定,期刊限定,作者姓名索引选词,多作者逻辑匹配选项,全文、免费全文、摘要限定,日期限定,Limits 检索限制,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,34,出版日期限定,入库日期限定,研究对象 人/动物限定,研究对象性别限定,

15、语种限定,子文档限定,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,35,检索字段限定,执行检索,清除所有限定,文献类型限定,研究对象年龄限定,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,36,2. Previw/index（检索策略预览/索引）： 浏览检索式，预览检出文献数量 修改检索式 组配检索式 如：可用检索式编号 #1 OR #2 浏览索引（index）选词检索,（四）PubMed的辅助检索,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,37,检索预览,检索历史,索引加词检索,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,38,PubMed - Index 索

16、引检索例,johns hopkins asthma,选择著者地址字段,输入地址起始单词,点击显示索引词表,选择相关词条,选择词条间的逻辑关系,添加到检索框,执行检索,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,39,3. History（检索史）： 历次检索式回顾 编辑检索式 如：#5 AND genbacev oau,（四）PubMed的辅助检索,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,40,检索历史回顾,检索式,检索时间,检出篇数,检索式编号可替代检索式进行输入检索如：#6 AND genbacev oau,2018/12/14,复旦大学图书馆文献检索教研室,41,4. Details （检索的详细匹配过程）： 显示检索词转换匹配运算详细过程 用途：转换、确定规范词 如：liver cancer liver neoplasms 修改检索策略,（四）PubMed的辅助检索,2018/