《imagej-常用功能教程》由会员分享，可在线阅读，更多相关《imagej-常用功能教程（78页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、ImageJ 这套软件可以自动帮你你计算细胞数，也可以定量分析 DNA 电泳或是 Western blot 条带。 step 1.首先打开软件后，开启图档step 1.首先打开软件后，开启图档 ImageJ 这套软件可以自动帮你你计算细胞数，也可以定量分析 DNA 电泳或是 Western blot 条带。 step 1.首先打开软件后，开启图档step 1.首先打开软件后，开启图档 step 2.请先做校正，选择 Analyze 底下的 Calibrate 选项，再选择校正的模式， 使用 Uncalibrate OD，再按 ok step 2.请先做校正，选择 Analyze 底下的 Cal
2、ibrate 选项，再选择校正的模式， 使用 Uncalibrate OD，再按 ok 按下 ok 之后会出现校正的图形按下 ok 之后会出现校正的图形 Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项)， 再按下 Analyze/Gels/select first Lane 快速键(Ctr+1)，此时框架中会出现 一个号码 1，之后可以移动框架到第二个 lane 再选择 Analyze/Gels/select second Lane 快速键(Ctr+2)，当然可以一直加下去，最后按 Analyze/Gels/plot Lanes 快速键(Ctr +3)。
3、 Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项)， 再按下 Analyze/Gels/select first Lane 快速键(Ctr+1)，此时框架中会出现 一个号码 1，之后可以移动框架到第二个 lane 再选择 Analyze/Gels/select second Lane 快速键(Ctr+2)，当然可以一直加下去，最后按 Analyze/Gels/plot Lanes 快速键(Ctr +3)。 Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度，此时可以看到有 几个比较高的区段， 就是我们想定量的 band， 使用直线工具(工具列第
4、五个选项) 先将图形中高点为有 band 的区域和没有 band 的区域分开再，使用魔术棒工具 (工具列第八个选项)点选要分析的区域。 Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度，此时可以看到有 几个比较高的区段， 就是我们想定量的 band， 使用直线工具(工具列第五个选项) 先将图形中高点为有 band 的区域和没有 band 的区域分开再，使用魔术棒工具 (工具列第八个选项)点选要分析的区域。 Step 5.当我们点选分析时，在 result 的对话视窗会出现分析的数据，依序点 选就会出现每个 band 的值。 Step 5.当我们点选分析时，在 result 的对话视
5、窗会出现分析的数据，依序点 选就会出现每个 band 的值。 注：当我们选择分析的条带也可以是横向选取，就可以只比较相同大小的 DNA 的含量，同样也可以应用在 western blot 或其它类似实验条带的分析上。 使用使用ImageJ 分析图像中的颗粒数分析图像中的颗粒数 NanoUnion.Net 原创教程，转载请保留此行 1，到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。 2，打开ImageJ并打开要分析的图片。请看演示图片。 3，把图像二值话或者设定阈值。选择 Image - Adjust - Threshold. 根据提示设定你需要的阈值。这一步非常重要，关系到结果的正
6、确性。设定阈值的标准就是把是颗粒的地 方都突出出来。示例中颗粒都被染成了红色。 4， 菜单 Analyze - Anelyze particles. 自动统计结果。 示例图片中有 2 个 1 像素的点都被统计出来了。 结果非常准确。 ImageJ 功能强大，其他功能请自学或者听下回分解！再见 使用使用 ImageJ 分析图像中的颗粒数分析图像中的颗粒数 #1 使用使用ImageJ 分析图像中的颗粒数分析图像中的颗粒数 NanoUnion.Net 原创教程，转载请保留此行 1，到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。 2，打开ImageJ并打开要分析的图片。请看演示图片。 3，
7、把图像二值话或者设定阈值。选择 Image - Adjust - Threshold. 根据提示设定你需要的阈值。这一步非常重要，关系到结果的正确性。设定阈值的标准就是把是颗粒的地方都突出出来。示 例中颗粒都被染成了红色。 4，菜单 Analyze - Anelyze particles. 自动统计结果。示例图片中有 2 个 1 像素的点都被统计出来了。结果非常准确。 ImageJ 功能强大，其他功能请自学或者听下回分解！再见 附件附件: particle.JPG (9.26 KB) adjust.JPG (26.63 KB) adjust2.JPG (22.57 KB) analyze.JP
8、G (24.67 KB) result.JPG (38.38 KB) 2007/4/6 21:53 生物医学影像分析软件-ImageJ 计算细 胞数 生物医学影像分析软件-ImageJ 计算细 胞数 2009 年 04 月 21 日 22 时 21 分 52 秒 来源：未知 浏览： 522 次 相信许多朋友也许也在找一种影像软体，可以自动帮你计算细胞数，比方说常常 用使用 4-6-Diamidino-2-phenylindole (DAPI)，或是用其它的抗体在做免疫 染色(Immunohistochemistry Staining)，要如何把影像的资讯数量化呢?最常用 的就是计算染色的细胞
9、数。那有没有软体可以自动帮你算细胞数呢?大概在 90 年中就有人在做这种影像分析，在 2000 年左右也有不少文章介绍各实验室自己 开发的软体，也免费的提供下载。最近由猪排饭同学介绍一套软体 ImageJ，是 由 National Institutes of Health (NIH)所开发免费且跨平台(windows、Mac、 Linux 都可用)的影像分析软体，试用一下觉得相当好用。请参考以下之教学： step 1. 下载安装ImageJ软体step 1. 下载安装ImageJ软体: http:/rsbweb.nih.gov/ij/download.html 或 ImageJ下载 http:
10、/ 请依据不同作业系统选择适合的版本 step 2. 打开软体，再开启要分析的图片(File-Open)。step 2. 打开软体，再开启要分析的图片(File-Open)。 step 3. 设定分析影像的阈值(Image-Adjust-Threshold,或快捷键 Ctr+Shift+T) step 4.调整阈值再按 set 决定。step 4.调整阈值再按 set 决定。 step 5.step 5. 选择 analyze particle(Analyze-Analyze particle) 并且记得要选择 summarize，才会有分析的结果。 选择 analyze particle(A
11、nalyze-Analyze particle) 并且记得要选择 summarize，才会有分析的结果。 step 6. 分析结果，可以看到原图像的视窗会出现电脑判读的数据，summary 会显示个数 及分析影像的区域大小 Using ImageJ to Quantify Gel Images This is a quick tutorial abour using ImageJ to process gel images taken with the GelDoc. ImageJ is a free program that was originally written at NIH. Im
12、ageJ is used to analyze/process all sorts of images in biology-related research. You can use ImageJ to crop/invert/rotate/enhance your gel images. There is even a way to quantify your bands. Rotating/Cropping Gel Images Open ImageJ using the shortcut on the desktop. You can drag the image you want t
13、o open onto the ImageJ window. Once the gel image is open, you can zoom in with “Ctrl+“ and zoom out with “Ctrl-“. Your gel will look something like this (see below). 8/13/2009Tutorial ImageJ C:/index.html1/10 Now you can rotate the image in case its crooked. Go to Image/Rotate/Arbitrarily. You will
14、 get the following dialog window. You can adjust the rotation angle (positive or negative values). To make it easy, make sure that the “Preview“ box is checked, that will show you how your image is rotated, and it will also show you vertical/horizontal lines for orientation. Click OK when youre done
15、. 8/13/2009Tutorial ImageJ C:/index.html2/10 Now its time to crop the gel image. Use the “Rectangular Selection“ tool. After selecting the region of interest go to Image/Crop to crop the selection.See below for screenshots. Enhancing the Gel Image This is a typical step when dealing with gel images.
16、 You need to adjust the histogram of the image. Please make sure not to blow-out (saturate) the whites. You want to make sure your image has enough dynamic range. Talk to me if youre confused. Anyways, you can do that with Image/Adjust/Brightness-Contrast. , see the Brightness requires 64- bit Windows) or without Java (3MB). Open Reads an image and displays it in a separate window. Files must b
