第二十一章 常用分子生物学技术的原理及应用ppt课件

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1、第二十一章,常用分子生物学技术的原理及应用 The Popular Technology in Molecular Biology: Principle and Application,第 一 节 分子杂交与印迹技术 Molecular Hybridization & Blotting Technology,分子杂交特性(见第二章)探针技术印迹技术,核酸分子杂交 (nucleic acid hybridization ) 利用DNA变性与复性这一基本性质来进行DNA或RNA定性或定量分析的一种技术。,一、分子杂交与印迹技术的原理,第 二 节,聚 合 酶 链 反 应 Polymerase Cha

2、in Reaction(PCR),一种可以将目的微量的DNA片断扩增100万倍以上的技术,(末代沙皇尼古拉二世、1918年的流行性感冒病毒、电影侏罗纪公园,以及辛普森杀妻案,这四件事情到底有什么相关?答案是没有),PCR 可以把 指定的基因片段 数量放大百万倍,染色体,Mullis (1993),(二)PCR基本反应步骤,变性 95C,延伸 72C,退火 Tm-5C,循环 2530 次,使模板DNA完全变性成单链。同时引物自身和引物之间存在的局部双链得以消除,使引物和模板DNA退火结合,此温度下DNA聚合酶以dNTP 为底物催化DNA链的延长,三个步骤为一个循环, 每次循环产物作为下一轮模板进

3、入下一轮循环,第一轮循环,引物A,引物B,变性(95),退火(60),延伸(72),DNA-Pol,DNA-Pol,温度,第二轮循环,引物A,引物B,变性(95),退火(60),延伸(72),温度,DNA-Pol,DNA-Pol,DNA-Pol,DNA-Pol,第三次循环,变性(95),退火(60),延伸(72),温度,DNA-Pol,DNA-Pol,DNA-Pol,DNA-Pol,DNA-Pol,DNA-Pol,DNA-Pol,DNA-Pol,第一次循环,第二次循环,第三次循环,第四次循环,四、PCR的主要用途,PCR的 用途,基因突变 分析,基因的 体外突变,目的基因 的克隆,DNA 序列

4、测定,DNA和RNA 的微量分析,1、与反转录结合,直接从组织细胞中的mRNA 获得目的基因; 2、利用特异性引物以cDNA或基因组DNA为模板获得目的基因片段; 3、利用简并引物从cDNA 文库或基因组文库中获得具有一定序列相似性的基因片段; 4、利用随机引物从cDNA文库中克隆基因。,利用PCR技术可以随意设计引物在体外对目的DNA的基因片段进行嵌和、缺失、点突变等改造。,PCR技术高度敏感,对DNA的含量要求很低。理论上只要存在一分子的模板就可以获得目的片段。 RNA需要反转录。,利用PCR结合其它技术,可以提高基因突变检测的敏感性。,三、几种重要的PCR衍生技术,(一)反转录PCR技术

5、(二)原位PCR技术(三)实时PCR技术,第 三 节,核 酸 序 列 分 析 Nucleic Acid Sequence Analysis,核酸序列分析的基本原理化学裂解法 (Maxam-Gillbert法)DNA链的末端合成终止法 (sanger法),一、化学裂解法(Maxam-Gillbert法),基本原理 基于某些化学试剂可以使DNA链在1个或2个碱基处发生专一性断裂的特性,精确地控制反应强度,使一个断裂点仅存在于少数分子中,不同分子在不同位点断裂,从而获得一系列大小不同的DNA片段,将这些片段经电泳分离。 分析前,用同位素标记DNA的5末端,经放射自显影即可在X胶片上读出DNA链的序列

6、。,二、DNA链末端合成终止法,又称Sanger法,其基本原理如下: 2,3-双脱氧核苷酸(ddNTP) 无3碳原子上的羟基,故不能与下位核苷酸形成磷酸二酯键。 DNA合成反应在此终止。,2,3-双脱氧核苷酸(ddNTP),DNA-Pol dNTPs,DNA-Pol dNTPs,DNA-Pol dNTPs,DNA-Pol dNTPs,引物,待测序模板DNA,各管分别加入四种ddNTP,ddATP,ddGTP,ddTTP,ddCTP,DNA链末端合成终止法基本原理,DNA链末端合成终止法基本流程,待测DNA模板: 3TTGCACCTGA5 引物:与模板3端互补 DNA聚合酶(DNA-Pol) dNTP底物(其中一种用32P标记)四个试管中分别加入,反应一段时间。,ddG,ddA,ddT,ddC,电 泳,三、DNA自动测序,采用荧光替代放射性核素标记是实现DNA序列分析自动化的基础。 用不同荧光分子标记四种双脱氧核苷酸; 然后进行Sanger测序反应; 反应产物经电泳(平板或毛细管电泳)分离; 通过四种激光激发不同大小DNA片段上的荧光分子使之发射出四种不同波长荧光,检测器采集荧光信号,并依此确定DNA碱基的排列顺序。,DNA自动测序结果举例,生物芯片技术,基因芯片技术,

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