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1、北京大学研究生院医学部分院361课程编号：020402 开课单位：药学院化学生物学系 化学生物学化学生物学 I-概论概论 Introduction to Chemical Biology 学 分：3.0 学 时：54 考核方式：考试 教学方式：讲授 主讲教师：王夔、张礼和等 课程类型：B 授课对象：化学生物学专业硕士、博士研究生必修课；药物化学相关专业的博士和硕士研究生选修课 开设目的：了解和掌握化学生物学研究的基本方法及当前主要进展。 教学要求：本课程分化学生物学研究方法和化学生物学研究进展两大部分内容。化学生物学研究方法主要包括：生物技术，化学、物理技术，计算机模拟技术、组合化学技术等在化
2、学生物学研究中的应用。化学生物学研究进展部分主要讲授：调节，控制基因表达的化学小分子的研究；化学小分子与细胞的相互作用；化学小分子与生物大分子的相互作用等内容。 预修知识：选课者需要学习化学原理和无机化学、分析化学、基础有机化学、物理化学、基础生物物理学、基础生物化学、分子生物学基础、细胞生物学基础等课程。 主要内容 1 前言 2 生物技术在化学生物学研究中的应用 3 化学、物理技术在化学生物学研究中的应用 4 计算机模拟技术在化学生物学研究中的应用 5 组合化学在化学生物学研究中的应用 6 调节，控制基因表达的化学小分子的研究 7 化学小分子与细胞的相互作用 8 化学小分子与生物大分子的相互
3、作用等内容 9 总结 思考题： 1. 化学生物学和生物化学、分子生物学的区别是什么？ 2. 化学小分子和生物大分子作用的表征要点有哪些？有哪些方法？ 3. 化学小分子调控生命过程的基本策略有哪些？ 4. 化学小分子合成的新策略和新方法有哪些？ 教材：自编 北京大学研究生院医学部分院362Introduction to Chemical Biology Credits: 3.0 Introduction: This class consists of the research methods of chemical biology and the recent developments of c
4、hemical biology. The research methods of chemical biology include: Application of Bio-technology for the Studies of Chemical Biology; Application of Chemical and Physical Methods for the Studies of Chemical Biology; Application of Computer for the Studies of Chemical Biology; Application of Combinat
5、orial Chemistry for the Studies of Chemical Biology. The recent developments of chemical biology include: Regulation of Gene Expresion by Small Molecules; Effects on the Cell Cycles and Substructures of Cells by Small Molecules; Interaction between Biomolecules and Small Molecules. 北京大学研究生院医学部分院363课
6、程编号：020426 开课单位：药学院化学生物学系 化学生物学化学生物学 II Chemical Biology II 学 分：3.0 学 时：56 考核方式：考试 教学方式：讲授 主讲教师：杨晓达 课程类型：B 授课对象：化学生物学专业硕士研究生必修课；药物化学相关专业的博士和硕士研究生选修课 开设目的：无机离子和生命体系的相互作用是化学生物学的一个重要部分。本课程介绍细胞无机化学研究的体系、理论和方法。 教学要求: 本课程主要包括相互联系的三个主要部分，包括高等无机化学理论、生物无机化学原理和方法、无机药物的作用原理和设计。用讲授和课堂讨论的方式进行互动式的学习。 预修知识：基础无机化学，
7、基础生物化学 主要内容 一、配位化学 a) 配位键的类型和配合物的几何构型 b) 晶体场-配体场理论 c) 配合物的热力学稳定性和稳定常数测定 d) 配位反应的动力学机制 e) 配合物的光谱性质：电子光谱、EPR、NMR 和穆斯堡谱、光电子能谱 二、金属蛋白的配位化学 a) 铁蛋白 b) 铜蛋白 c) 锌蛋白 d) 钙蛋白 e) 钾通道 f) 其它金属蛋白和离子通道 三、生物氧化还原 a) 电子转移蛋白和氧化还原酶 b) 细胞色素 P450 的结构和作用机理 c) 线粒体氧化磷酸化和电子转移 d) 活性氧的生成和代谢 e) Ca-ROS-ATP 的关系 f) 细胞抗氧化体系 四、酸碱催化和含金
8、属水解酶 a) 羧肽酶 b) 碳酸酐酶 c) 乙醇脱氢酶 五、双氧运输 a) 血红蛋白和肌红蛋白 北京大学研究生院医学部分院364b) 蚯蚓血红蛋白 c) 血蓝蛋白 六、生物分子的构象变化和金属调节 a) 钙调蛋白 b) 锌指蛋白 c) 顺铂和 DNA 的结合作用 七、离子和配合物的吸收和转运 a) 铁转运 b) 铜转运 c) 配合物的细胞摄取 八、无机离子的相似性作用规律 a) 概论 b) 稀土生物化学 c) 钒生物化学 九、生物矿化 a) 硬组织的结构 b) 成矿过程的热力学和动力学 c) 基质蛋白对生物矿化的调控 d) 骨组织的溶解和再矿化 e) 钙化/结石的形成 十、无机药物设计基础
9、a) 无机药物综述 b) 中药矿物的研究进展 c) 无机药物的活性（作用靶） 、吸收能力和毒性 d) 金属的毒性控制和解毒方法 思考题： 1. 金属离子和生物大分子结合的方式和对生物大分子构象的影响是什么？ 2. 影响金属离子和生物大分子结合的因素有哪些？ 3. 无机离子如何影响细胞的生命过程？什么是相似性作用规律？ 4. 细胞如何控制无机离子的浓度？ 5. 无机离子如何影响细胞活性氧代谢？ 6. 矿物如何和细胞作用？你知道哪些中药矿物？ 7. 无机药物设计的要点是什么？ 教材：自编 参考书目： 1. 现代配位化学（徐志固主编） 2. 生物无机化学（王夔主编） 3. 医化学基础（王夔主编） 4
10、. 生物无机化学导论（计亮年主编） 5. 生物无机化学原理（杨频主编） 6. 生物无机化学原理（Lippard 主编） 7. Handbook of metalloproteins 北京大学研究生院医学部分院365Chemical Biology II Credits: 3.0 Introduction: This class introduced basic principles and methods for inorganic cytochemistry. The content of this class include three major parts: theories of a
11、dvanced inorganic chemistry, inorganic biochemistry, and inorganic pharmaceutics. The class is organic in a manner of mutual learning and in-class discussion. Content: Coordination chemistry Theories of coordination valence Stability thermodynamic chemistry of coordination compounds Kinetics of coor
12、dination compounds Spectroscopy of coordination compounds The structure and chemistry of metalloproteins Biological redox reactions Cyt P450 and redox enzymes The function and chemistry of mitochodria Reactive oxygen species and their metabolism Cellular antioxidant system and antioxidant response A
13、cid-base catalysis and metal-content hydrolases Oxygen transportation Regulation of conformation of biological molecules by metal ions Calcium dependent proteins Proteins containing the Zinc fingers DNA conformational changes induced by cisplatin binding Across membrane transportation of metals and
14、inorganic compounds The Analogy Principle of inorganic ions The biochemistry of lanthanides The biochemistry of vanadium and hypoglycemic vanadium compounds Biomineralization The structure of hard tissues Thermodynamics and kinetics of biomineraliztion Regulation of biomineraliztion by cells and bio
15、logical matrixes Pathological biomineralization Inorganic pharmaceutics Review on inorganic pharmaceutics Minerals in Traditional Chinese medicine The principle of designing inorganic pharmaceutics Control of metal toxicity 北京大学研究生院医学部分院366课程编号：020403 开课单位：药学院化学生物学系 化学生物学高级实验化学生物学高级实验 Chemical Biology Labs 学 分：3.0 学 时：128 考核方式：实验考试 教学方式：实验 主讲教师：杨晓达 课程类型：C 授课对象：化学生物学专业硕士研究生必修课 药物化学相关专业的博士和硕士研究生
